Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P19174 Date Wed May 9 17:43:44 BST 2012 Unique Job ID 1975ec919504b475

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	G	A	A	S	P	C	A	N	G	C	G	P	G	A	P	S	D	A	E	V	L	H	L	C	R	S	L	E	V	G	T	V	M	T	L	F	Y	S	K	K	S	Q	R	P	E	R	K	T	F	Q	V	K	L	E	T	R	Q	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	W	S	R	G	A	D	K	I	E	G	A	I	D	I	R	E	I	K	E	I	R	P	G	K	T	S	R	D	F	D	R	Y	Q	E	D	P	A	F	R	P	D	Q	S	H	C	F	V	I	L	Y	G	M	E	F	R	L	K	T	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?																											?	?	?	?	?	?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	L	Q	A	T	S	E	D	E	V	N	M	W	I	K	G	L	T	W	L	M	E	D	T	L	Q	A	P	T	P	L	Q	I	E	R	W	L	R	K	Q	F	Y	S	V	D	R	N	R	E	D	R	I	S	A	K	D	L	K	N	M
Secondary structure
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Disorder																											?	?	?	?	?																?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	S	Q	V	N	Y	R	V	P	N	M	R	F	L	R	E	R	L	T	D	L	E	Q	R	S	G	D	I	T	Y	G	Q	F	A	Q	L	Y	R	S	L	M	Y	S	A	Q	K	T	M	D	L	P	F	L	E	A	S	T	L	R	A
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Disorder																							?	?	?	?	?	?																		?	?											?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	E	R	P	E	L	C	R	V	S	L	P	E	F	Q	Q	F	L	L	D	Y	Q	G	E	L	W	A	V	D	R	L	Q	V	Q	E	F	M	L	S	F	L	R	D	P	L	R	E	I	E	E	P	Y	F	F	L	D	E	F	V	T
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Disorder		?	?	?																																												?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	L	F	S	K	E	N	S	V	W	N	S	Q	L	D	A	V	C	P	D	T	M	N	N	P	L	S	H	Y	W	I	S	S	S	H	N	T	Y	L	T	G	D	Q	F	S	S	E	S	S	L	E	A	Y	A	R	C	L	R	M	G
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		C	R	C	I	E	L	D	C	W	D	G	P	D	G	M	P	V	I	Y	H	G	H	T	L	T	T	K	I	K	F	S	D	V	L	H	T	I	K	E	H	A	F	V	A	S	E	Y	P	V	I	L	S	I	E	D	H	C	S	I	A
Secondary structure
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Q	Q	R	N	M	A	Q	Y	F	K	K	V	L	G	D	T	L	L	T	K	P	V	E	I	S	A	D	G	L	P	S	P	N	Q	L	K	R	K	I	L	I	K	H	K	K	L	A	E	G	S	A	Y	E	E	V	P	T	S	M	M
Secondary structure
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Disorder																										?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Y	S	E	N	D	I	S	N	S	I	K	N	G	I	L	Y	L	E	D	P	V	N	H	E	W	Y	P	H	Y	F	V	L	T	S	S	K	I	Y	Y	S	E	E	T	S	S	D	Q	G	N	E	D	E	E	E	P	K	E	V	S	S
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?		?	?	?	?						?					?	?	?	?	?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	T	E	L	H	S	N	E	K	W	F	H	G	K	L	G	A	G	R	D	G	R	H	I	A	E	R	L	L	T	E	Y	C	I	E	T	G	A	P	D	G	S	F	L	V	R	E	S	E	T	F	V	G	D	Y	T	L	S	F	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?												?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		R	N	G	K	V	Q	H	C	R	I	H	S	R	Q	D	A	G	T	P	K	F	F	L	T	D	N	L	V	F	D	S	L	Y	D	L	I	T	H	Y	Q	Q	V	P	L	R	C	N	E	F	E	M	R	L	S	E	P	V	P	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?		?	?	?	?								?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		N	A	H	E	S	K	E	W	Y	H	A	S	L	T	R	A	Q	A	E	H	M	L	M	R	V	P	R	D	G	A	F	L	V	R	K	R	N	E	P	N	S	Y	A	I	S	F	R	A	E	G	K	I	K	H	C	R	V	Q	Q	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																					?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		G	Q	T	V	M	L	G	N	S	E	F	D	S	L	V	D	L	I	S	Y	Y	E	K	H	P	L	Y	R	K	M	K	L	R	Y	P	I	N	E	E	A	L	E	K	I	G	T	A	E	P	D	Y	G	A	L	Y	E	G	R	N	P
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Disorder																									?	?	?	?												?		?	?				?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		G	F	Y	V	E	A	N	P	M	P	T	F	K	C	A	V	K	A	L	F	D	Y	K	A	Q	R	E	D	E	L	T	F	I	K	S	A	I	I	Q	N	V	E	K	Q	E	G	G	W	W	R	G	D	Y	G	G	K	K	Q	L	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?															?	?																										?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		F	P	S	N	Y	V	E	E	M	V	N	P	V	A	L	E	P	E	R	E	H	L	D	E	N	S	P	L	G	D	L	L	R	G	V	L	D	V	P	A	C	Q	I	A	I	R	P	E	G	K	N	N	R	L	F	V	F	S	I	S
Secondary structure
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Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?		?			?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		M	A	S	V	A	H	W	S	L	D	V	A	A	D	S	Q	E	E	L	Q	D	W	V	K	K	I	R	E	V	A	Q	T	A	D	A	R	L	T	E	G	K	I	M	E	R	R	K	K	I	A	L	E	L	S	E	L	V	V	Y	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?		?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		R	P	V	P	F	D	E	E	K	I	G	T	E	R	A	C	Y	R	D	M	S	S	F	P	E	T	K	A	E	K	Y	V	N	K	A	K	G	K	K	F	L	Q	Y	N	R	L	Q	L	S	R	I	Y	P	K	G	Q	R	L	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?																																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		S	N	Y	D	P	L	P	M	W	I	C	G	S	Q	L	V	A	L	N	F	Q	T	P	D	K	P	M	Q	M	N	Q	A	L	F	M	T	G	R	H	C	G	Y	V	L	Q	P	S	T	M	R	D	E	A	F	D	P	F	D	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?										?		?			?	?	?		?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		S	L	R	G	L	E	P	C	A	I	S	I	E	V	L	G	A	R	H	L	P	K	N	G	R	G	I	V	C	P	F	V	E	I	E	V	A	G	A	E	Y	D	S	T	K	Q	K	T	E	F	V	V	D	N	G	L	N	P	V	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		P	A	K	P	F	H	F	Q	I	S	N	P	E	F	A	F	L	R	F	V	V	Y	E	E	D	M	F	S	D	Q	N	F	L	A	Q	A	T	F	P	V	K	G	L	K	T	G	Y	R	A	V	P	L	K	N	N	Y	S	E	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?		?	?	?																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		E	L	A	S	L	L	I	K	I	D	I	F	P	A	K	E	N	G	D	L	S	P	F	S	G	T	S	L	R	E	R	G	S	D	A	S	G	Q	L	F	H	G	R	A	R	E	G	S	F	E	S	R	Y	Q	Q	P	F	E	D	F
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SS confidence
Disorder															?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		R	I	S	Q	E	H	L	A	D	H	F	D	S	R	E	R	R	A	P	R	R	T	R	V	N	G	D	N	R	L
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SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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