Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description A0AVT1 Date Tue Apr 3 14:58:27 BST 2012 Unique Job ID 13c0206945bc8832

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	G	S	E	P	V	A	A	H	Q	G	E	E	A	S	C	S	S	W	G	T	G	S	T	N	K	N	L	P	I	M	S	T	A	S	V	E	I	D	D	A	L	Y	S	R	Q	R	Y	V	L	G	D	T	A	M	Q	K	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	S	H	V	F	L	S	G	M	G	G	L	G	L	E	I	A	K	N	L	V	L	A	G	I	K	A	V	T	I	H	D	T	E	K	C	Q	A	W	D	L	G	T	N	F	F	L	S	E	D	D	V	V	N	K	R	N	R	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	V	L	K	H	I	A	E	L	N	P	Y	V	H	V	T	S	S	S	V	P	F	N	E	T	T	D	L	S	F	L	D	K	Y	Q	C	V	V	L	T	E	M	K	L	P	L	Q	K	K	I	N	D	F	C	R	S	Q	C	P	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	K	F	I	S	A	D	V	H	G	I	W	S	R	L	F	C	D	F	G	D	E	F	E	V	L	D	T	T	G	E	E	P	K	E	I	F	I	S	N	I	T	Q	A	N	P	G	I	V	T	C	L	E	N	H	P	H	K	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	G	Q	F	L	T	F	R	E	I	N	G	M	T	G	L	N	G	S	I	Q	Q	I	T	V	I	S	P	F	S	F	S	I	G	D	T	T	E	L	E	P	Y	L	H	G	G	I	A	V	Q	V	K	T	P	K	T	V	F	F	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	L	E	R	Q	L	K	H	P	K	C	L	I	V	D	F	S	N	P	E	A	P	L	E	I	H	T	A	M	L	A	L	D	Q	F	Q	E	K	Y	S	R	K	P	N	V	G	C	Q	Q	D	S	E	E	L	L	K	L	A	T	S
Secondary structure
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Disorder							?										?	?	?	?	?	?	?																					?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	S	E	T	L	E	E	K	P	D	V	N	A	D	I	V	H	W	L	S	W	T	A	Q	G	F	L	S	P	L	A	A	A	V	G	G	V	A	S	Q	E	V	L	K	A	V	T	G	K	F	S	P	L	C	Q	W	L	Y	L	E
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Disorder						?	?	?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	A	D	I	V	E	S	L	G	K	P	E	C	E	E	F	L	P	R	G	D	R	Y	D	A	L	R	A	C	I	G	D	T	L	C	Q	K	L	Q	N	L	N	I	F	L	V	G	C	G	A	I	G	C	E	M	L	K	N	F	A
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Disorder			?	?	?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	L	G	V	G	T	S	K	E	K	G	M	I	T	V	T	D	P	D	L	I	E	K	S	N	L	N	R	Q	F	L	F	R	P	H	H	I	Q	K	P	K	S	Y	T	A	A	D	A	T	L	K	I	N	S	Q	I	K	I	D	A
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		H	L	N	K	V	C	P	T	T	E	T	I	Y	N	D	E	F	Y	T	K	Q	D	V	I	I	T	A	L	D	N	V	E	A	R	R	Y	V	D	S	R	C	L	A	N	L	R	P	L	L	D	S	G	T	M	G	T	K	G	H	T
Secondary structure
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		E	V	I	V	P	H	L	T	E	S	Y	N	S	H	R	D	P	P	E	E	E	I	P	F	C	T	L	K	S	F	P	A	A	I	E	H	T	I	Q	W	A	R	D	K	F	E	S	S	F	S	H	K	P	S	L	F	N	K	F	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?							?	?									?																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		Q	T	Y	S	S	A	E	E	V	L	Q	K	I	Q	S	G	H	S	L	E	G	C	F	Q	V	I	K	L	L	S	R	R	P	R	N	W	S	Q	C	V	E	L	A	R	L	K	F	E	K	Y	F	N	H	K	A	L	Q	L	L	H
Secondary structure
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Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		C	F	P	L	D	I	R	L	K	D	G	S	L	F	W	Q	S	P	K	R	P	P	S	P	I	K	F	D	L	N	E	P	L	H	L	S	F	L	Q	N	A	A	K	L	Y	A	T	V	Y	C	I	P	F	A	E	E	D	L	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?		?	?																																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		D	A	L	L	N	I	L	S	E	V	K	I	Q	E	F	K	P	S	N	K	V	V	Q	T	D	E	T	A	R	K	P	D	H	V	P	I	S	S	E	D	E	R	N	A	I	F	Q	L	E	K	A	I	L	S	N	E	A	T	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?			?				?		?			?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		D	L	Q	M	A	V	L	S	F	E	K	D	D	D	H	N	G	H	I	D	F	I	T	A	A	S	N	L	R	A	K	M	Y	S	I	E	P	A	D	R	F	K	T	K	R	I	A	G	K	I	I	P	A	I	A	T	T	T	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?																											?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		V	S	G	L	V	A	L	E	M	I	K	V	T	G	G	Y	P	F	E	A	Y	K	N	C	F	L	N	L	A	I	P	I	V	V	F	T	E	T	T	E	V	R	K	T	K	I	R	N	G	I	S	F	T	I	W	D	R	W	T	V
Secondary structure
SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		H	G	K	E	D	F	T	L	L	D	F	I	N	A	V	K	E	K	Y	G	I	E	P	T	M	V	V	Q	G	V	K	M	L	Y	V	P	V	M	P	G	H	A	K	R	L	K	L	T	M	H	K	L	V	K	P	T	T	E	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																							?	?													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.
Sequence		Y	V	D	L	T	V	S	F	A	P	D	I	D	G	D	E	D	L	P	G	P	P	V	R	Y	Y	F	S	H	D	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?															?	?	?	?	?
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