Job Description A0AVT1 Confidence 100.00% Date Tue Apr 3 14:58:27 BST 2012 Rank 6 Aligned Residues 379 % Identity 25% Template d1yova1 SCOP info Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins Activating enzymes of the ubiquitin-like proteins Ubiquitin activating enzymes (UBA) Resolution 2.60

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		39	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	D	D	A	L	Y	S	R	Q	R	Y	V	L	G	D	T	A	M	Q	K	M	A	K	S	H	V	F	L	S	G	M	G	G	L	G	L	E	I	A	K	N	L	V	L	A	G	I	K	A	V	T	I	H	D	T	E	K	C	Q	A	W	D	L	G	T	N	F	F	L	S	E	D	D	V	V	N	K	R	N	R
Query Conservation
Alig confidence																																																																												.	.
Template Conservation																																																																												.	.
Template Sequence		L	K	E	Q	K	Y	D	R	Q	L	R	L	W	G	D	H	G	Q	E	A	L	E	S	A	H	V	C	L	I	N	A	T	A	T	G	T	E	I	L	K	N	L	V	L	P	G	I	G	S	F	T	I	I	D	G	N	Q	V	S	G	E	D	A	G	N	N	F	F	L	Q	R	S	S	I	.	.	G	K	N	R
Template Known Secondary structure							T																										S												T	T	T		S								S	B										T	T			G	G	G	T	.	.	T	S	B
Template Predicted Secondary structure																																																																												.	.
Template SS confidence
		8	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.			.	.	.	.
		119	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.			.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																												.	.
Query SS confidence																												.	.
Query Sequence		A	E	A	V	L	K	H	I	A	E	L	N	P	Y	V	H	V	T	S	S	S	V	P	F	N	E	.	.	T	T	D	L	S	F	L	D	K	Y	Q	C	V	V	L	T	E	M	K	L	P	L	Q	K	K	I	N	D	F	C	R	S	Q	C	P	P	I	K	F	I	S	A	D	V	H	G	I	W	S	R	L	F
Query Conservation																												.	.
Alig confidence																												.	.																																		.	.
Template Conservation																																																															.	.
Template Sequence		A	E	A	A	M	E	F	L	Q	E	L	N	S	D	V	S	G	S	F	V	E	E	S	P	E	N	L	L	D	N	D	P	S	F	F	C	R	F	T	V	V	V	A	T	Q	L	P	E	S	T	S	L	R	L	A	D	V	L	W	N	S	.	.	Q	I	P	L	L	I	C	R	T	Y	G	L	V	G	Y	M	R
Template Known Secondary structure											T	T		T	T	S	B					S	S								S		G	G	G	G	G	G		S						S																	.	.	T										T	T
Template Predicted Secondary structure																																																															.	.
Template SS confidence
		86	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.
		197	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.									.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.
Query SS confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.
Query Sequence		C	D	F	G	D	E	F	E	V	L	D	T	T	G	E	E	.	.	.	.	.	.	.	.	P	K	E	I	F	I	S	N	I	T	Q	A	N	P	G	I	V	T	C	L	E	N	H	P	H	K	L	E	T	G	Q	F	L	T	F	R	E	I	N	G	M	T	G	L	N	G	S	I	Q	Q	I	.	.	.	.	.
Query Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.																																																				.	.	.	.	.
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.											.	.	.																																							.	.	.	.	.
Template Conservation																																				.	.	.
Template Sequence		I	I	I	K	E	H	P	V	I	E	S	H	P	D	N	A	L	E	D	L	R	L	D	K	P	F	P	E	L	R	E	H	F	Q	.	.	.	S	Y	D	L	D	H	M	E	K	K	D	H	S	H	T	P	W	I	V	I	I	A	K	Y	L	A	Q	W	Y	S	E	T	N	G	R	I	P	K	T	Y	K	E	K
Template Known Secondary structure					S					S					S	S							S	S	S											.	.	.	T			S	S	S	S						T	T	S																	T							T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																				.	.	.
Template SS confidence
		164	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.				.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
																																																																																	264
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	D	F	R	D	L	I	R	Q	G	I	L	K	N	E	N	G	A	P	E	D	E	E	N	F	E	E	A	I	K	N	V	N	T	A	L	N	T	T	Q	I	P	S	S	I	E	D	I	F	N	D	D	R	C	I	N	I	T	K	Q	T	P	S	F	W	I	L	A	R	A	L	K	E	F	V	A	K	E	G	Q
Template Known Secondary structure										T	S	S		B		T	T	S	S	B																	S	S			S										T	S					S			S	S																	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		241	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		265	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.																																									.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		V	I	S	P	F	S	F	S	I	G	D	T	T	E	L	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	L	H	G	G	I	A	V	Q	V	K	T	P	K	T	V	F	F	E	S	L	E	R
Query Conservation																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	N	L	P	V	R	G	T	I	P	D	M	I	A	D	S	G	K	Y	I	K	L	Q	N	V	Y	R	E	K	A	K	K	D	A	A	A	V	G	N	H	V	A	K	L	L	Q	S	I	G	Q	A	P	E	S	I	S	E	K	E	L	K	L	L	C	S	N	S	A	F	L	R	V	V	R	C	R	S	L	A	E
Template Known Secondary structure		S	S											S																																		T	T	T			S	S	S	S											T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400
		305	.	.	.	.					310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.				.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure							.	.	.	.																																							.	.	.
Query SS confidence							.	.	.	.																																							.	.	.
Query Sequence		Q	L	K	H	P	.	.	.	.	K	C	L	I	V	D	F	S	N	P	E	A	P	L	E	I	H	T	A	M	L	A	L	D	Q	F	Q	E	K	Y	S	R	K	P	N	V	G	C	.	.	.	Q	Q	D	S	E	E	L	L	K	L	A	T	S	I	S	E	T	L	E	E	K	P	D	V	N	A	D	I	V	H
Query Conservation							.	.	.	.																																							.	.	.
Alig confidence							.	.	.	.																																							.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	Y	G	L	D	T	I	N	K	D	E	I	I	S	S	M	D	N	P	D	N	E	I	V	L	Y	L	M	L	R	A	V	D	R	F	H	K	Q	Q	G	R	Y	P	G	V	S	N	Y	Q	V	E	E	D	I	G	K	L	K	S	C	L	T	G	F	L	Q	E	Y	G	L	S	V	M	V	K	D	D	Y	V	H
Template Known Secondary structure					T	T	T	S									T	T	S	T	T	S	T																	S	S	S		T	T	S	S	T	T	T																				T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		401	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
		378	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	L	S	W	T	A	Q	G	F	L	S	P	L	A	A	A	V	G	G	V	A	S	Q	E	V	L	K	A	V	T	G	K	F	S	P	L	C	Q	W	L	Y	L	E	A	A	D	I
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	F	C	R	Y	G	A	A	E	P	H	T	I	A	A	F	L	G	G	A	A	A	Q	E	V	I	K	I	I	T	K	Q	F	V	I	F	N	N	T	Y	I	Y	S	G	M	S	Q
Template Known Secondary structure						T	T	T																								T		S				S	S						T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.