Job Description Q96KQ4 Confidence 95.77% Date Wed Jun 6 09:44:33 BST 2012
Rank 298 Aligned Residues 152
% Identity 14% Template c2efrB_
PDB info
PDB header: contractile proteinChain: B: PDB Molecule: general control protein gcn4 and tropomyosin 1 alpha chain;
PDBTitle: crystal structure of the c-terminal tropomyosin fragment with n- and2 c-terminal extensions of the leucine zipper at 1.8 angstroms3 resolution
Resolution 1.80 Å
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25 . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60 . . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . .
Predicted Secondary structure  
Query SS confidence  
Query Sequence  
E T T C R D V V E F C K E P G E G S C H L A E V W R G N E R P I P F D H M M Y E H L Q K W G P R R E E V K F F L R H E D S P T E N S E Q G G R Q T Q E Q R T Q R
Query Conservation  
                                                                                                                                             
Alig confidence  
Template Conservation  
                                                                                                                                                     
Template Sequence  
K Q L E D K V E E L L S K N Y H L E N E V A R L K K L L E R A E E R A E L S E G K S A E L E E E L K T V T N N L K S L E A Q A E K Y S Q K E D K Y E E E I K V L
Template Known Secondary structure  
Template Predicted Secondary structure  
Template SS confidence  
   
149 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180 . . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . .
 
   
105 . . . . 110 . . . . . .
. . . 120 . . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . .
Predicted Secondary structure  
.
Query SS confidence  
.
Query Sequence  
N V I N V P G E K R T E .
N G V G N P R V E L T L S E L Q D M A A R Q Q Q Q I E N Q Q Q M L V A K E Q R L H F L K Q Q E R R Q Q Q S I S E N E K L
Query Conservation  
                        .                                                                                                            
Alig confidence  
.
Template Conservation  
                                                                                                                               
Template Sequence  
S D K L K E A E T R A E F A E R S V T K L E K S I D D L E D E L Y A Q K L K Y K A I S E E M K Q L E D K V E E L L S K N Y H L E N E V A R L K K L
Template Known Secondary structure  
T T
Template Predicted Secondary structure  
Template SS confidence  
   
229 230 . . . . . . . . . 240 . . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300 .
 
No model constructed - rank, confidence too low
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Please cite: Protein structure prediction on
the web: a case study using the Phyre server
Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols
4, 363 - 371 (2009) [pdf ] [Import into BibTeX ]