Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description O00459 Date Fri May 25 09:44:30 BST 2012 Unique Job ID 0ae9a79684a9af6d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	G	P	E	G	F	Q	Y	R	A	L	Y	P	F	R	R	E	R	P	E	D	L	E	L	L	P	G	D	V	L	V	V	S	R	A	A	L	Q	A	L	G	V	A	E	G	G	E	R	C	P	Q	S	V	G	W	M	P	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?										?			?	?		?					?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	E	R	T	R	Q	R	G	D	F	P	G	T	Y	V	E	F	L	G	P	V	A	L	A	R	P	G	P	R	P	R	G	P	R	P	L	P	A	R	P	R	D	G	A	P	E	P	G	L	T	L	P	D	L	P	E	Q	F	S	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?		?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	D	V	A	P	P	L	L	V	K	L	V	E	A	I	E	R	T	G	L	D	S	E	S	H	Y	R	P	E	L	P	A	P	R	T	D	W	S	L	S	D	V	D	Q	W	D	T	A	A	L	A	D	G	I	K	S	F	L	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	P	A	P	L	V	T	P	E	A	S	A	E	A	R	R	A	L	R	E	A	A	G	P	V	G	P	A	L	E	P	P	T	L	P	L	H	R	A	L	T	L	R	F	L	L	Q	H	L	G	R	V	A	S	R	A	P	A	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?																																			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	A	V	R	A	L	G	A	T	F	G	P	L	L	L	R	A	P	P	P	P	S	S	P	P	P	G	G	A	P	D	G	S	E	P	S	P	D	F	P	A	L	L	V	E	K	L	L	Q	E	H	L	E	E	Q	E	V	A	P	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?			?	?	?	?	?			?					?	?	?	?	?								?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	L	P	P	K	P	P	K	A	K	P	A	S	T	V	L	A	N	G	G	S	P	P	S	L	Q	D	A	E	W	Y	W	G	D	I	S	R	E	E	V	N	E	K	L	R	D	T	P	D	G	T	F	L	V	R	D	A	S	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?		?	?			?	?			?	?	?	?	?		?	?																						?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	Q	G	E	Y	T	L	T	L	R	K	G	G	N	N	K	L	I	K	V	F	H	R	D	G	H	Y	G	F	S	E	P	L	T	F	C	S	V	V	D	L	I	N	H	Y	R	H	E	S	L	A	Q	Y	N	A	K	L	D	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	L	Y	P	V	S	K	Y	Q	Q	D	Q	I	V	K	E	D	S	V	E	A	V	G	A	Q	L	K	V	Y	H	Q	Q	Y	Q	D	K	S	R	E	Y	D	Q	L	Y	E	E	Y	T	R	T	S	Q	E	L	Q	M	K	R	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?					?															?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	E	A	F	N	E	T	I	K	I	F	E	E	Q	G	Q	T	Q	E	K	C	S	K	E	Y	L	E	R	F	R	R	E	G	N	E	K	E	M	Q	R	I	L	L	N	S	E	R	L	K	S	R	I	A	E	I	H	E	S	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?																				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		K	L	E	Q	Q	L	R	A	Q	A	S	D	N	R	E	I	D	K	R	M	N	S	L	K	P	D	L	M	Q	L	R	K	I	R	D	Q	Y	L	V	W	L	T	Q	K	G	A	R	Q	K	K	I	N	E	W	L	G	I	K	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		T	E	D	Q	Y	A	L	M	E	D	E	D	D	L	P	H	H	E	E	R	T	W	Y	V	G	K	I	N	R	T	Q	A	E	E	M	L	S	G	K	R	D	G	T	F	L	I	R	E	S	S	Q	R	G	C	Y	A	C	S	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	D	G	D	T	K	H	C	V	I	Y	R	T	A	T	G	F	G	F	A	E	P	Y	N	L	Y	G	S	L	K	E	L	V	L	H	Y	Q	H	A	S	L	V	Q	H	N	D	A	L	T	V	T	L	A	H	P	V	R	A	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	G	P	P	P	A	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand