Phyre 2 Results for A8JNU2

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	A8JNU2
Date	Tue Jan 22 11:54:53 GMT 2013
Unique Job ID	fea6c8db72c9c9e4

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M G A Q Q G K D R G A H S G G G G S G A P V S C I G L S S S P V A S V S P H C I S S S S G V S S A P L G G G S T L R G S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence R I K S S S S G V A S G S G S G G G G G G S G S G L S Q R S G G H K D A R C N P T V G L N I F T E H N G T K H S S F R G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence H P G K Y H M N L E A L L Q S R P L P H I P A G S T A A S L L A D A A E L Q Q H Q Q D S G G L G L Q G S S L G G G H S S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence T T S V F E S A H R W T S K E N L L A P G P E E D D P Q L F V A L Y D F Q A G G E N Q L S L K K G E Q V R I L S Y N K S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence G E W C E A H S D S G N V G W V P S N Y V T P L N S L E K H S W Y H G P I S R N A A E Y L L S S G I N G S F L V R E S E

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ?
?
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence S S P G Q R S I S L R Y E G R V Y H Y R I S E D P D G K V F V T Q E A K F N T L A E L V H H H S V P H E G H G L I T P L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence L Y P A P K Q N K P T V F P L S P E P D E W E I C R T D I M M K H K L G G G Q Y G E V Y E A V W K R Y G N T V A V K T L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence K E D T M A L K D F L E E A A I M K E M K H P N L V Q L I G V C T R E P P F Y I I T E F M S H G N L L D F L R S A G R E

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence T L D A V A L L Y M A T Q I A S G M S Y L E S R N Y I H R D L A A R N C L V G D N K L V K V A D F G L A R L M R D D T Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence T A H A G A K F P I K W T A P E G L A Y N K F S T K S D V W A F G V L L W E I A T Y G M S P Y P A I D L T D V Y H K L D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence K G Y R M E R P P G C P P E V Y D L M R Q C W Q W D A T D R P T F K S I H H A L E H M F Q E S S I T E A V E K Q L N A N

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
? ? ?
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence A T S A S S S A P S T S G V A T G G G A T T T T A A S G C A S S S S A T A S L S L T P Q M V K K G L P G G Q A L T P N A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence H H N D P H Q Q Q A S T P M S E T G S T S T K L S T F S S Q G K G N V Q M R R T T N K Q G K Q A P A P P K R T S L L S S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence S R D S T Y R E E D P A N A R C N F I D D L S T N G L A R D I N S L T Q R Y D S E T D P A A D P D T D A T G D S L E Q S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence L S Q V I A A P V T N K M Q H S L H S G G G G G G I G P R S S Q Q H S S F K R P T G T P V M G N R G L E T R Q S K R S Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence L H S Q A P G P G P P S T Q P H H G N N G V V T S A H P I T V G A L D V M N V K Q V V N R Y G T L P K G A R I G A Y L D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence S L E D S S E A A P A L P A T A P S L P P A N G H A T P P A A R L N P K A S P I P P Q Q M I R S N S S G G V T M Q N N A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence A A S L N K L Q R H R T T T E G T M M T F S S F R A G G S S S S P K R S A S G V A S G V Q P A L A N L E F P P P P L D L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence P P P P E E F E G G P P P P P P A P E S A V Q A I Q Q H L H A Q L P N N G N I S N G N G T N N N D S S H N D V S N I A P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence S V E E A S S R F G V S L R K R E P S T D S C S S L G S P P E D L K E K L I T E I K A A G K D T A P A S H L A N G S G I

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . . . . . . . 1230 . . . . . . . . . 1240 . . . . . . . . . 1250 . . . . . . . . . 1260

Sequence A V V D P V S L L V T E L A E S M N L P K P P P Q Q Q Q K L T N G N S T G S G F K A Q L K K V E P K K M S A P M P K A E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1270 . . . . . . . . . 1280 . . . . . . . . . 1290 . . . . . . . . . 1300 . . . . . . . . . 1310 . . . . . . . . . 1320

Sequence P A N T I I D F K A H L R R V D K E K E P A T P A P A P A T V A V A N N A N C N T T G T L N R K E D G S K K F S Q A M Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ?
? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1330 . . . . . . . . . 1340 . . . . . . . . . 1350 . . . . . . . . . 1360 . . . . . . . . . 1370 . . . . . . . . . 1380

Sequence K T E I K I D V T N S N V E A D A G A A G E G D L G K R R S T G S I N S L K K L W E Q Q P P A P D Y A T S T I L Q Q Q P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1390 . . . . . . . . . 1400 . . . . . . . . . 1410 . . . . . . . . . 1420 . . . . . . . . . 1430 . . . . . . . . . 1440

Sequence S V V N G G G T P N A Q L S P K Y G M K S G A I N T V G T L P A K L G N K Q P P A A P P P P P P N C T T S N S S T T S I

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1450 . . . . . . . . . 1460 . . . . . . . . . 1470 . . . . . . . . . 1480 . . . . . . . . . 1490 . . . . . . . . . 1500

Sequence S T S S R D C T S R Q Q A S S T I K T S H S T Q L F T D D E E Q S H T E G L G S G G Q G S A D M T Q S L Y E Q K P Q I Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1510 . . . . . . . . . 1520 . . . . . . . . . 1530 . . . . . . . . . 1540 . . . . . . . . . 1550 . . . . . . . . . 1560

Sequence Q K P A V P H K P T K L T I Y A T P I A K L T E P A S S A S S T Q I S R E S I L E L V G L L E G S L K H P V N A I A G S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1570 . . . . . . . . . 1580 . . . . . . . . . 1590 . . . . . . . . . 1600 . . . . . . . . . 1610 . . . . . . . . . 1620

Sequence Q W L Q L S D K L N I L H N S C V I F A E N G A M P P H S K F Q F R E L V T R V E A Q S Q H L R S A G S K N V Q D N E R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?
? ? ?
?
? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1630 . . . . . . . .

Sequence L V A E V G Q S L R Q I S N A L N R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand