Job Description P29349 Confidence 100.00% Date Tue Jan 22 11:46:53 GMT 2013 Rank 14 Aligned Residues 276 % Identity 75% Template d2shpa1 SCOP info (Phosphotyrosine protein) phosphatases II (Phosphotyrosine protein) phosphatases II Higher-molecular-weight phosphotyrosine protein phosphatases Resolution 2.00

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		208	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																			.
Query SS confidence																																			.
Query Sequence		T	R	I	T	A	A	G	I	N	A	R	V	E	Q	L	V	K	G	G	F	W	E	E	F	E	S	L	Q	Q	D	S	R	D	.	T	F	S	R	N	E	G	Y	K	Q	E	N	R	L	K	N	R	Y	R	N	I	L	P	Y	D	H	T	R	V	K	L	L	D	V	E	H	S	V	A	G	A	E	Y	I	N	A
Query Conservation																																			.
Alig confidence																			.																.																																.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																			.																																																.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		T	R	I	N	A	A	E	I	E	S	R	V	R	E	L	S	K	.	G	F	W	E	E	F	E	T	L	Q	Q	Q	E	C	K	L	L	Y	S	R	K	E	G	Q	R	Q	E	N	K	N	K	N	R	Y	K	N	I	L	P	F	D	H	T	R	V	V	L	.	.	.	.	.	.	.	H	D	S	D	Y	I	N	A
Template Known Secondary structure						G	G	G											.											G	G	G	G	G	G									S	G	G	G	G	G	G	S	S	S	T	T					T	T	T					.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																			.																																																.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		219	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.								.	.	.	.	.	.	.	290
		287	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	Y	I	R	L	P	T	D	G	D	L	Y	N	M	S	S	S	S	E	S	L	N	S	S	V	P	S	C	P	A	C	T	A	A	Q	T	Q	R	N	C	S	N	C	Q	L	Q	N	K	T	C	V	Q	C	A	V	K	S	A	I	L	P	Y	S	N	C	A	T	C	S	R	K	S	D	S	L	S	K	H	K	R
Query Conservation
Alig confidence						.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		N	I	I	M	.	.	P	K	K	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure						.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure						.	.					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		308	.	310	.			.	.	.	.
		367	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	E	S	S	A	S	S	S	P	S	S	G	S	G	S	G	P	G	S	S	G	T	S	G	V	S	S	V	N	G	P	G	T	P	T	N	L	T	S	G	T	A	G	C	L	V	G	L	L	K	R	H	S	N	D	S	S	G	A	V	S	I	S	M	A	E	R	E	R	E	R	E	R	E	M	F	K	T	Y	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Y	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																																327	.
		447	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	T	Q	G	C	L	L	T	Q	Q	V	N	T	V	T	D	F	W	N	M	V	W	Q	E	N	T	R	V	I	V	M	T	T	K	E	Y	E	R	G	K	E	K	C	A	R	Y	W	P	D	E	G	R	S	E	Q	F	G	H	A	R	I	Q	C	V	S	E	N	S	T	S	D	Y	T	L	R	E	F	L	V	S
Query Conservation
Alig confidence								.	.	.	.
Template Conservation								.	.	.	.
Template Sequence		A	T	Q	G	C	L	.	.	.	.	Q	N	T	V	N	D	F	W	R	M	V	F	Q	E	N	S	R	V	I	V	M	T	T	K	E	V	E	R	G	K	S	K	C	V	K	Y	W	P	D	E	Y	A	L	K	E	Y	G	V	M	R	V	R	N	V	K	E	S	A	A	H	D	Y	T	L	R	E	L	K	L	S
Template Known Secondary structure								.	.	.	.	T	T	T												T								S		S			T	T			S					S			T	T						T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure								.	.	.	.
Template SS confidence
		329	330	.	.	.	.					.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.
		527	.	.			530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.
Predicted Secondary structure					.	.
Query SS confidence					.	.
Query Sequence		W	R	D	.	.	Q	P	A	R	R	I	F	H	Y	H	F	Q	V	W	P	D	H	G	V	P	A	D	P	G	C	V	L	N	F	L	Q	D	V	N	T	R	Q	S	H	L	A	Q	A	G	E	K	P	G	P	I	C	V	H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	F	I	V	I	D	M	I	L	D	Q	I	V
Query Conservation					.	.
Alig confidence					.	.																																								.	.	.	.
Template Conservation																																														.	.	.	.
Template Sequence		K	V	G	Q	G	N	T	E	R	T	V	W	Q	Y	H	F	R	T	W	P	D	H	G	V	P	S	D	P	G	G	V	L	D	F	L	E	E	V	H	H	K	Q	E	S	.	.	.	.	I	M	D	A	G	P	V	V	V	H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	F	I	V	I	D	I	L	I	D	I	I	R
Template Known Secondary structure			T	T																		S	S	S			S																			.	.	.	.	S	T	T									S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																																														.	.	.	.
Template SS confidence
		405	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.					.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
		605	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	G	L	D	T	E	I	D	I	Q	R	T	I	Q	M	V	R	S	Q	R	S	G	L	V	Q	T	E	A	Q	Y	K	F	V	Y	Y	A	V	Q	H	Y	I	Q	T	L
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		E	K	G	V	D	C	D	I	D	V	P	K	T	I	Q	M	V	R	S	Q	R	S	G	M	V	Q	T	E	A	Q	Y	R	S	I	Y	M	A	V	Q	H	Y	I	E	T	L
Template Known Secondary structure					T	T	S													T	T	S	T	T	S	S																			T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		481	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.