Job Description P29349 Confidence 100.00% Date Tue Jan 22 11:46:53 GMT 2013 Rank 1 Aligned Residues 499 % Identity 55% Template c3ps5A_ PDB info PDB header:hydrolase, signaling protein Chain: A: PDB Molecule:tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6; PDBTitle: crystal structure of the full-length human protein tyrosine2 phosphatase shp-1 Resolution 3.10 Å

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Show / Hide Conservation and Alignment quality

		5	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	W	F	H	P	T	I	S	G	I	E	A	E	K	L	L	Q	E	Q	G	F	D	G	S	F	L	A	R	L	S	S	S	N	P	G	A	F	T	L	S	V	R	R	G	N	E	V	T	H	I	K	I	Q	N	N	G	D	F	F	D	L	Y	G	G	E	K	F	A	T	L	P	E	L	V	Q	Y	Y	M	E	N
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		R	W	F	H	R	D	L	S	G	L	D	A	E	T	L	L	K	G	R	G	V	H	G	S	F	L	A	R	P	S	R	K	N	Q	G	D	F	S	L	S	V	R	V	G	D	Q	V	T	H	I	R	I	Q	N	S	G	D	F	Y	D	L	Y	G	G	E	K	F	A	T	L	T	E	L	V	E	Y	Y	T	Q	Q
Template Known Secondary structure		S				S	S																T	T								S	S	S	T	T	S								T	T											S	S				S	S	S	S			B	S	S										T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		3	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.
		85	.		.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.
Predicted Secondary structure				.																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence				.																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	E	.	L	K	E	K	N	G	Q	A	I	E	L	K	Q	P	L	I	C	A	E	P	T	T	E	R	W	F	H	G	N	L	S	G	K	E	A	E	K	L	I	L	E	R	G	K	N	G	S	F	L	V	R	E	S	Q	S	K	P	G	D	F	V	L	S	V	R	T	D	D	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation				.																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence				.																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	G	V	L	Q	D	R	D	G	T	I	I	H	L	K	Y	P	L	N	C	S	D	P	T	S	E	R	W	Y	H	G	H	M	S	G	G	Q	A	E	T	L	L	Q	A	K	G	E	P	W	T	F	L	V	R	E	S	L	S	Q	P	G	D	F	V	L	S	V	L	S	D	Q	P	K	A	G	P	G	S	P	L
Template Known Secondary structure		S	S			B		S	S			B						B						S			S	T	T				S																T	T								S	S	S	T	T												S	S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		83	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.
		155	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.										.	.
Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		K	V	T	H	V	M	I	R	W	Q	D	K	K	Y	D	V	G	G	G	E	S	F	G	T	L	S	E	L	I	D	H	Y	K	R	N	P	M	V	E	T	C	G	T	V	V	H	L	R	Q	P	F	N	A	T	R	I	T	A	A	G	I	N	A	R	V	E	Q	L	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	G
Query Conservation																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		R	V	T	H	I	K	V	M	C	E	G	G	R	Y	T	V	G	G	L	E	T	F	D	S	L	T	D	L	V	E	H	F	K	K	T	G	I	E	E	A	S	G	A	F	V	Y	L	R	Q	P	Y	Y	A	T	R	V	N	A	A	D	I	E	N	R	V	L	E	L	N	K	K	Q	E	S	E	D	T	A	K	A
Template Known Secondary structure									B		G	G	G		B	B	S	S	S	S			B	S	S											S		B			T	T	S			B													G	G	G														S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		163	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.
		226	.	.	.	230	.	.	.	.	.		.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.						.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure												.																																																											.	.	.	.	.
Query SS confidence												.																																																											.	.	.	.	.
Query Sequence		G	F	W	E	E	F	E	S	L	Q	.	Q	D	S	R	D	T	F	S	R	N	E	G	Y	K	Q	E	N	R	L	K	N	R	Y	R	N	I	L	P	Y	D	H	T	R	V	K	L	L	D	V	E	H	S	V	A	G	A	E	Y	I	N	A	N	Y	I	R	L	P	T	.	.	.	.	.	D	G	D	L	Y	N
Query Conservation												.																																																											.	.	.	.	.
Alig confidence												.																																																								.	.		.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																				.	.
Template Sequence		G	F	W	E	E	F	E	S	L	Q	K	Q	E	V	K	N	L	H	Q	R	L	E	G	Q	R	P	E	N	K	G	K	N	R	Y	K	N	I	L	P	F	D	H	S	R	V	I	L	Q	G	R	D	S	N	I	P	G	S	D	Y	I	N	A	N	Y	I	K	.	.	N	Q	L	L	G	P	D	E	N	A	K	T
Template Known Secondary structure												G	G	G	G	G						T	G	G	G		G	G	G	G	G	G		S		S	S					T	T	T						S			S	S	S	T	T	T	T									.	.		S	S	S		T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																				.	.
Template SS confidence
		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.			.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	S	S	S	S	E	S	L	N	S	S	V	P	S	C	P	A	C	T	A	A	Q	T	Q	R	N	C	S	N	C	Q	L	Q	N	K	T	C	V	Q	C	A	V	K	S	A	I	L	P	Y	S	N	C	A	T	C	S	R	K	S	D	S	L	S	K	H	K	R	S	E	S	S	A	S	S	S	P	S	S	G	S
Query Conservation
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		Y	I	A	S	Q	G	C	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		321	.	.	.	.	.	.	.
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	S	G	P	G	S	S	G	T	S	G	V	S	S	V	N	G	P	G	T	P	T	N	L	T	S	G	T	A	G	C	L	V	G	L	L	K	R	H	S	N	D	S	S	G	A	V	S	I	S	M	A	E	R	E	R	E	R	E	R	E	M	F	K	T	Y	I	A	T	Q	G	C	L	L	T	Q	Q	V	N	T
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	A	T
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																																															329	330	.
		460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.			.	.	530	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																						.	.
Query SS confidence																																																																						.	.
Query Sequence		V	T	D	F	W	N	M	V	W	Q	E	N	T	R	V	I	V	M	T	T	K	E	Y	E	R	G	K	E	K	C	A	R	Y	W	P	D	E	G	R	S	E	Q	F	G	H	A	R	I	Q	C	V	S	E	N	S	T	S	D	Y	T	L	R	E	F	L	V	S	W	.	.	R	D	Q	P	A	R	R	I	F	H
Query Conservation																																																																						.	.
Alig confidence																																																																						.	.
Template Conservation
Template Sequence		V	N	D	F	W	Q	M	A	W	Q	E	N	S	R	V	I	V	M	T	T	R	E	V	E	K	G	R	N	K	C	V	P	Y	W	P	E	V	G	M	Q	R	A	Y	G	P	Y	S	V	T	N	C	G	E	H	D	T	T	E	Y	K	L	R	T	L	Q	V	S	P	L	D	N	G	D	L	I	R	E	I	W	H
Template Known Secondary structure												T	T								S		S	B	S	S	S	S	B	S					S			B	T						T	T												S	S											S	S			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		332	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.
		538	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	H	F	Q	V	W	P	D	H	G	V	P	A	D	P	G	C	V	L	N	F	L	Q	D	V	N	T	R	Q	S	H	L	A	Q	A	G	E	K	P	G	P	I	C	V	H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	F	I	V	I	D	M	I	L	D	Q	I	V	R	N	G	L	D	T	E	I	D	I	Q	R	T
Query Conservation
Alig confidence																																					.	.	.	.
Template Conservation																																					.	.	.	.
Template Sequence		Y	Q	Y	L	S	W	P	D	H	G	V	P	S	E	P	G	G	V	L	S	F	L	D	Q	I	N	Q	R	Q	E	S	L	P	H	A	.	.	.	.	G	P	I	I	V	H	S	S	A	G	I	G	R	T	G	T	I	I	V	I	D	M	L	M	E	N	I	S	T	K	G	L	D	C	D	I	D	I	Q	K	T
Template Known Secondary structure									S	S	S	S		S		S																		T	T		.	.	.	.								S	S	S	S																					S	S
Template Predicted Secondary structure																																					.	.	.	.
Template SS confidence
		412	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.					.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.
		618	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	Q	M	V	R	S	Q	R	S	G	L	V	Q	T	E	A	Q	Y	K	F	V	Y	Y	A	V	Q	H	Y	I	Q	T	L	I	A	R	K	R	A	E	E	Q
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	Q	M	V	R	A	Q	R	S	G	M	V	Q	T	E	A	Q	Y	K	F	I	Y	V	A	I	A	Q	F	I	E	T	T	K	K	K	L	E	V	L	Q	S
Template Known Secondary structure							T	T	S	T	T	S	S		S																				T	T	T	T	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		488	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.