Job Description P29349 Confidence 100.00% Date Tue Jan 22 11:46:53 GMT 2013 Rank 7 Aligned Residues 410 % Identity 29% Template c2jjdA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon; PDBTitle: protein tyrosine phosphatase, receptor type, e isoform Resolution 3.20 Å

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		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	L	V	K	G	G	F	W	E	E	F	E	S	L	Q	Q	D	S	R	D	T	F	S	R	N	E	G	Y	K	Q	E	N	R	L	K	N	R	Y	R	N	I	L	P	Y	D	H	T	R	V	K	L	L	D	V	E	H	S	V	A	G	A	E	Y	I	N	A	N	Y	I	R	L	P	T	D	G	D	L	Y	N
Query Conservation
Alig confidence																								.																																			.	.													.	.
Template Conservation																								.																																			.	.													.	.
Template Sequence		E	E	E	I	R	I	R	S	R	E	E	F	N	S	L	P	S	G	H	I	Q	G	.	T	F	E	L	A	N	K	E	E	N	R	E	K	N	R	Y	P	N	I	L	P	N	D	H	S	R	V	I	L	S	Q	L	G	I	.	.	P	C	S	D	Y	I	N	A	S	Y	I	D	.	.	G	Y	K	E	K	N	K
Template Known Secondary structure								T			T	T	G	G	G	S			T	T	S	S		.			T	T	T	T		G	G	G	G	G	G		S	S	T	T	S				S	S	S										.	.	T	T	T	T									.	.		T	T
Template Predicted Secondary structure																								.																																			.	.													.	.
Template SS confidence
		121	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.		.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.			.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.			.	190	.	.	.	.	.
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350																										.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	S	S	S	S	E	S	L	N	S	S	V	P	S	C	P	A	C	T	A	A	Q	T	Q	R	N	C	S	N	C	Q	L	Q	N	K	T	C	V	Q	C	A	V	K	S	A	I	L	P	Y	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	A	T	C
Query Conservation																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		F	I	A	A	Q	G	P	K	Q	E	T	V	N	D	F	W	R	M	V	W	E	Q	K	S	A	T	I	V	M	L	T	N	L	K	E	R	K	E	E	K	C	H	Q	Y	W	P	D	Q	G	C	W	T	Y	G	N	I	R	V	C	V	E	D	C	V	V	L	V	D	Y	T	I	R	K	F	C	I	Q	P	K	A
Template Known Secondary structure										G	G	G											T	T								S		S			T	T				S				S		S	S	S					T	T												S	S									B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		204	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
		355	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		S	R	K	S	D	S	L	S	K	H	K	R	S	E	S	S	A	S	S	S	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	S	G	S	G	P	G	S	S	G	T	S	G	V	S	S	V	N	G	P	G	T	P	T	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																								.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		P	R	L	V	S	Q	L	H	F	T	S	W	P	D	F	G	V	P	F	T	P	I	G	M	L	K	F	L	K	K	V	K	T	L	N	P	V	H	A	G	P	I	V	V	H	C	S	A	G	V	G	R	T	G	T	F	I	V	I	D	A	M	M	A	M	M	H	A	E	Q	K	V	D	V	F	E	F	V	S	R
Template Known Secondary structure															S	S	S			S		S														S		T	T									S	S	S	S	S																			S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
Predicted Secondary structure																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		T	S	G	T	A	G	C	L	V	G	L	L	K	R	H	S	N	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		I	R	N	Q	R	P	Q	M	V	Q	T	D	M	Q	Y	T	F	I	Y	Q	A	L	L	E	Y	Y	L	Y	G	D	T	E	L	D	V	S	S	G	L	E	E	E	F	R	K	L	T	N	V	R	I	M	K	E	N	M	R	T	G	N	L	P	A	N	M	K	K	A	R	V	I	Q	I	I	P	Y	D	F	N	R
Template Known Secondary structure				T	T	S	T	T		S																			T							T	T												T	S				S	T	T						S					T	T		S	S	T	T	S				S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.
			423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.
Predicted Secondary structure		.
Query SS confidence		.
Query Sequence		.	S	G	A	V	S	I	S	M	A	E	R	E	R	E	R	E	R	E	M	F	K	T	Y	I	A	T	Q	G	C	L	L	T	Q	Q	V	N	T	V	T	D	F	W	N	M	V	W	Q	E	N	T	R	V	I	V	M	T	T	K	E	Y	E	R	G	K	E	K	C	A	R	Y	W	P	D	E	G	R	S	E	Q
Query Conservation		.
Alig confidence		.																															.	.	.	.																																										.
Template Conservation																																	.	.	.	.																																										.
Template Sequence		V	I	L	S	M	Y	T	D	Y	I	N	A	S	F	I	D	G	Y	R	Q	K	D	Y	F	I	A	T	Q	G	P	L	.	.	.	.	A	H	T	V	E	D	F	W	R	M	I	W	E	W	K	S	H	T	I	V	M	L	T	E	V	Q	E	R	E	Q	D	K	C	Y	Q	Y	W	P	T	E	G	.	S	V	T
Template Known Secondary structure								T	T										S	S	S	T	T										.	.	.	.	T	T	T											T	T								S		S			T	T								S		S	S	S	.
Template Predicted Secondary structure																																	.	.	.	.																																										.
Template SS confidence
		468	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.					.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.		540	.	.
		502	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	G	H	A	R	I	Q	C	V	S	E	N	S	T	S	D	Y	T	L	R	E	F	L	V	S	W	R	D	Q	P	A	R	R	I	F	H	Y	H	F	Q	V	W	P	D	H	G	V	P	A	D	P	G	C	V	L	N	F	L	Q	D	V	N	T	R	Q	S	H	L	A	Q	A	G	E	K	P	G	P	I	C	V
Query Conservation
Alig confidence																																																																					.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.
Template Sequence		H	G	E	I	T	I	E	I	K	N	D	T	L	S	E	A	I	S	I	R	D	F	L	V	T	L	N	G	E	Q	V	R	V	V	R	Q	F	H	F	H	G	W	P	E	I	G	I	P	A	E	G	K	G	M	I	D	L	I	A	A	V	Q	K	Q	Q	Q	Q	.	.	.	.	.	T	G	N	H	P	I	T	V
Template Known Secondary structure			T	T												S	S													T	T												S		S	S	S			S																			.	.	.	.	.	S	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.
Template SS confidence
		548	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.						.	.	.	.	.	620	.	.
		582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	F	I	V	I	D	M	I	L	D	Q	I	V	R	N	G	L	D	T	E	I	D	I	Q	R	T	I	Q	M	V	R	S	Q	R	S	G	L	V	Q	T	E	A	Q	Y	K	F	V	Y	Y	A	V	Q	H	Y	I	Q
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.
Template Conservation																													.	.	.
Template Sequence		H	C	S	A	G	A	G	R	T	G	T	F	I	A	L	S	N	I	L	E	R	V	K	A	E	G	L	.	.	.	L	D	V	F	Q	A	V	K	S	L	R	L	Q	R	P	H	M	V	Q	T	L	E	Q	Y	E	F	C	Y	K	V	V	Q	D	F	I	D
Template Known Secondary structure				S	S	S	S	S																			S		.	.	.												T	T	S	T	T	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.
Template SS confidence
		629	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.				.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.