Job Description P29349 Confidence 100.00% Date Tue Jan 22 11:46:53 GMT 2013 Rank 37 Aligned Residues 266 % Identity 39% Template c2g59B_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:receptor-type tyrosine-protein phosphatase o; PDBTitle: crystal structure of the catalytic domain of protein2 tyrosine phosphatase from homo sapiens Resolution 2.19 Å

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		207	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.				.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.
Predicted Secondary structure																						.	.	.
Query SS confidence																						.	.	.
Query Sequence		A	T	R	I	T	A	A	G	I	N	A	R	V	E	Q	L	V	K	G	G	.	.	.	F	W	E	E	F	E	S	L	Q	Q	D	S	R	D	T	F	S	R	N	E	G	Y	K	Q	E	N	R	L	K	N	R	Y	R	N	I	L	P	Y	D	H	T	R	V	K	L	L	D	V	E	H	S	V	A	G	A	E	Y
Query Conservation																						.	.	.
Alig confidence																						.	.	.																.																														.	.	.	.	.
Template Conservation																																								.																														.	.	.	.	.
Template Sequence		T	N	P	V	Q	L	D	D	F	D	A	Y	I	K	D	M	A	K	D	S	D	Y	K	F	S	L	Q	F	E	E	L	K	L	I	G	L	D	I	.	P	H	F	A	A	D	L	P	L	N	R	C	K	N	R	Y	T	N	I	L	P	Y	D	F	S	R	V	R	L	.	.	.	.	.	V	E	E	G	A	D	Y
Template Known Secondary structure							G	G	G																								T	T	T	T	T	T	S	.			T	G	G	G	S	G	G	G	G	G	G		S	S	T	T					T	T	T	B				.	.	.	.	.			T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																								.																														.	.	.	.	.
Template SS confidence
		4	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.		.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70						.	.	.	.	.	.	.
		284	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		I	N	A	N	Y	I	R	L	P	T	D	G	D	L	Y	N	M	S	S	S	S	E	S	L	N	S	S	V	P	S	C	P	A	C	T	A	A	Q	T	Q	R	N	C	S	N	C	Q	L	Q	N	K	T	C	V	Q	C	A	V	K	S	A	I	L	P	Y	S	N	C	A	T	C	S	R	K	S	D	S	L	S	K
Query Conservation
Alig confidence									.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		I	N	A	N	Y	I	P	.	.	G	Y	N	S	P	Q	E	Y	I	A	T	Q	G	P	L	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			S						.	.		S	S		T	T										G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure									.	.																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		82	.	.	.	.	.	.			.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.
		364	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	K	R	S	E	S	S	A	S	S	S	P	S	S	G	S	G	S	G	P	G	S	S	G	T	S	G	V	S	S	V	N	G	P	G	T	P	T	N	L	T	S	G	T	A	G	C	L	V	G	L	L	K	R	H	S	N	D	S	S	G	A	V	S	I	S	M	A	E	R	E	R	E	R	E	R	E	M	F	K
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		444	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	Y	I	A	T	Q	G	C	L	L	T	Q	Q	V	N	T	V	T	D	F	W	N	M	V	W	Q	E	N	T	R	V	I	V	M	T	T	K	E	Y	E	R	G	K	E	K	C	A	R	Y	W	P	D	E	G	R	S	E	Q	F	G	H	A	R	I	Q	C	V	S	E	N	S	T	S	D	Y	T	L	R	E	F
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	T	R	N	D	F	W	K	M	V	L	Q	Q	K	S	Q	I	I	V	M	L	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	D	H	Y	W	P	F	T	E	E	P	I	A	Y	G	D	I	T	V	E	M	I	S	E	E	E	Q	D	D	W	A	C	R	H	F
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G											T	T									.	.	.	.	.	.	.	.	.					S		S	S	S	S					T	T												S	S
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																							.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																105	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.										.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
		524	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550			.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.
Predicted Secondary structure																													.	.
Query SS confidence																													.	.
Query Sequence		L	V	S	W	R	D	Q	P	A	R	R	I	F	H	Y	H	F	Q	V	W	P	D	H	G	V	P	A	.	.	D	P	G	C	V	L	N	F	L	Q	D	V	N	T	R	Q	S	H	L	A	Q	A	G	E	K	P	G	P	I	C	V	H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	F	I	V	I	D	M	I	L	D
Query Conservation																													.	.
Alig confidence								.																					.	.																		.	.	.	.	.	.
Template Conservation								.																																								.	.	.	.	.	.
Template Sequence		R	I	N	Y	A	D	.	E	M	Q	D	V	M	H	F	N	Y	T	A	W	P	D	H	G	V	P	T	A	N	A	A	E	S	I	L	Q	F	V	H	M	V	R	Q	Q	A	T	.	.	.	.	.	.	K	S	K	G	P	M	I	I	H	C	S	A	G	V	G	R	T	G	T	F	I	A	L	D	R	L	L	Q
Template Known Secondary structure						T	T	.																S	S																						T	.	.	.	.	.	.	T		S	S							S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure								.																																								.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		171	.	.	.	.	.		.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.							.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.
		602	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	I	V	R	N	G	L	D	T	E	I	D	I	Q	R	T	I	Q	M	V	R	S	Q	R	S	G	L	V	Q	T	E	A	Q	Y	K	F	V	Y	Y	A	V	Q	H	Y	I	Q	T
Query Conservation
Alig confidence									.	.	.
Template Conservation									.	.	.
Template Sequence		H	I	R	D	H	E	F	.	.	.	V	D	I	L	G	L	V	S	E	M	R	S	Y	R	M	S	M	V	Q	T	E	E	Q	Y	I	F	I	H	Q	C	V	Q	L	M	W	M	K
Template Known Secondary structure							S		.	.	.												T	T	S	T	T	S	S		S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.
Template SS confidence
		244	.	.	.	.	.	250				.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.

No model constructed - rank, confidence too low