Job Description P29349 Confidence 100.00% Date Tue Jan 22 11:46:53 GMT 2013 Rank 5 Aligned Residues 421 % Identity 26% Template c1yguA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:leukocyte common antigen; PDBTitle: crystal structure of the tandem phosphatase domains of rptp2 cd45 with a ptyr peptide Resolution 2.90 Å

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		206	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.				.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.
Predicted Secondary structure																			.	.	.
Query SS confidence																			.	.	.
Query Sequence		N	A	T	R	I	T	A	A	G	I	N	A	R	V	E	Q	L	.	.	.	V	K	G	G	F	W	E	E	F	E	S	L	Q	Q	D	S	R	D	T	F	S	R	N	E	G	Y	K	Q	E	N	R	L	K	N	R	Y	R	N	I	L	P	Y	D	H	T	R	V	K	L	L	D	V	E	H	S	V	A	G	A	E
Query Conservation																			.	.	.
Alig confidence																			.	.	.																				.																																		.
Template Conservation																																									.																																		.
Template Sequence		N	V	E	P	I	H	A	D	I	L	L	E	T	Y	K	R	K	I	A	D	E	G	R	P	F	L	A	E	F	Q	S	I	P	R	V	F	S	K	F	.	P	I	K	E	A	R	K	P	F	N	Q	N	K	N	R	Y	V	D	I	L	P	Y	D	Y	N	R	V	E	L	S	E	I	N	.	G	D	A	G	S	N
Template Known Secondary structure																																	S		S	S		S	S	S	.				S	T	T	S	G	G	G	S	T	T		S		T	T					T	T	T	B							T	.	T	S	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																									.																																		.
Template SS confidence
		604	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.		.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.		.	.	.	.	680	.
		283	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Y	I	N	A	N	Y	I	R	L	P	T	D	G	D	L	Y	N	M	S	S	S	S	E	S	L	N	S	S	V	P	S	C	P	A	C	T	A	A	Q	T	Q	R	N	C	S	N	C	Q	L	Q	N	K	T	C	V	Q	C	A	V	K	S	A	I	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation																																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.																																																						.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation										.	.
Template Sequence		Y	I	N	A	S	Y	I	D	.	.	G	F	K	E	P	R	K	Y	I	A	A	Q	G	P	R	D	E	T	V	D	D	F	W	R	X	I	W	E	Q	K	A	T	V	I	V	X	V	T	R	C	E	E	G	N	R	N	K	C	A	E	Y	W	P	S	X	E	E	G	T	R	A	F	G	D	V	V	V	K	I	N
Template Known Secondary structure				S						.	.		S	S	S	T	T										T	T	T											T	T								S		S			T	T								S			T	T	T						T	T
Template Predicted Secondary structure										.	.
Template SS confidence
		682	.	.	.	.	.	.	.			690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																346	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.																	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	L	P	Y	S	N	C	A	T	C	S	R	K	S	D	S	L	S	K	H	K	R	S	E	S	S	A	S	S	S	P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	S	G	S	G	P	G	S	S	G	T	S	G	V	S	S	V	N
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		Q	H	K	R	C	P	D	Y	I	I	Q	K	L	N	I	V	N	K	K	E	K	A	T	G	R	E	V	T	H	I	Q	F	T	S	W	P	D	H	G	V	P	E	D	P	H	L	L	L	K	L	R	R	R	V	N	A	F	S	N	F	F	S	G	P	I	V	V	H	S	S	A	G	V	G	R	T	G	T	Y	I
Template Known Secondary structure							S	S											S	S	S														S			T	T	S			S													T	T	S			T	T									S	S	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		396	.	.	.	400	.	.	.																.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
Predicted Secondary structure										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		G	P	G	T	P	T	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	G	T	A	G	C	L	V	G	L	L	K	R	H	S	N	D	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence										.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		G	I	D	A	X	L	E	G	L	E	A	E	N	K	V	D	V	Y	G	Y	V	V	K	L	R	R	Q	R	C	L	X	V	Q	V	E	A	Q	Y	I	L	I	H	Q	A	L	V	E	Y	N	Q	F	G	E	T	E	V	N	L	S	E	L	H	P	Y	L	H	N	X	K	K	R	D	P	P	S	E	P	S	P	L
Template Known Secondary structure														S												T	T	T	S	T	T		S																										T	T	T												S	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.
																																									423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	A	V	S	I	S	M	A	E	R	E	R	E	R	E	R	E	M	F	K	T	Y	I	A	T	Q	G	C	L	L	T	Q	Q	V	N	T	V	T	D	F
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																															.	.	.	.
Template Conservation																																																																							.	.	.	.
Template Sequence		E	A	E	F	Q	R	L	P	S	Y	R	S	W	R	T	Q	H	I	G	N	Q	E	E	N	K	S	K	N	R	N	S	N	V	I	P	Y	D	Y	N	R	V	P	L	K	S	K	Y	I	N	A	S	F	I	X	S	Y	W	K	P	E	V	X	I	A	A	Q	G	P	L	.	.	.	.	K	E	T	I	G	D	F
Template Known Secondary structure												T	T		S				G	G	G	S					T	T		S	S	T	T					T	T	T	B									S							S	S	T	T											.	.	.	.	T	T	T
Template Predicted Secondary structure																																																																							.	.	.	.
Template SS confidence
		920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.					.	990	.	.	.	.	.
		464	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.		.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.
Predicted Secondary structure																																																																		.
Query SS confidence																																																																		.
Query Sequence		W	N	M	V	W	Q	E	N	T	R	V	I	V	M	T	T	K	E	Y	E	R	G	K	E	K	C	A	R	Y	W	P	D	E	G	R	S	E	Q	F	G	H	A	R	I	Q	C	V	S	E	N	S	T	S	D	Y	T	L	R	E	F	L	V	S	W	.	R	D	Q	P	A	R	R	I	F	H	Y	H	F	Q	V
Query Conservation																																																																		.
Alig confidence																																	.	.																																.
Template Conservation																																	.	.
Template Sequence		W	Q	X	I	F	Q	R	K	V	K	V	I	V	X	L	T	E	L	K	H	G	D	Q	E	I	C	A	Q	Y	W	G	.	.	E	G	K	Q	T	Y	G	D	I	E	V	D	L	K	D	T	D	K	S	S	T	Y	T	L	R	V	F	E	L	R	H	S	K	R	K	D	S	R	T	V	Y	Q	Y	Q	Y	T	N
Template Known Secondary structure								T	T								S		S			T	T			S	S						.	.	S	S					T	T												S	S											S	S		S												S
Template Predicted Secondary structure																																	.	.
Template SS confidence
		1022	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.			.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		543	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		W	P	D	H	G	V	P	A	D	P	G	C	V	L	N	F	L	Q	D	V	N	T	R	Q	S	H	L	A	Q	A	G	E	K	P	G	P	I	C	V	H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	F	I	V	I	D	M	I	L	D	Q	I	V	R	N	G	L	D	T	E	I	D	I	Q	R	T	I	Q	M	V	R
Query Conservation
Alig confidence																											.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template Conservation																											.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template Sequence		W	S	V	E	Q	L	P	A	E	P	K	E	L	I	S	X	I	Q	V	V	K	Q	K	L	P	.	.	.	.	.	.	Q	K	N	T	P	L	L	I	H	C	R	D	G	S	Q	Q	T	G	I	F	C	A	L	L	N	L	L	E	S	A	E	T	E	E	V	.	.	.	V	D	I	F	Q	V	V	K	A	L	R
Template Known Secondary structure				S	S	S			S	S														T	S		.	.	.	.	.	.	S										S	S	S	S	T	T																	T	S		.	.	.
Template Predicted Secondary structure																											.	.	.	.	.	.																																				.	.	.
Template SS confidence
		1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.							.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.				1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170
		623	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	Q	R	S	G	L	V	Q	T	E	A	Q	Y	K	F	V	Y	Y	A	V	Q	H	Y
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		K	A	R	L	G	X	V	S	T	F	E	Q	Y	Q	F	L	Y	D	V	I	A	S	T
Template Known Secondary structure		T	T	S	T	T	S	S		S														T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1181	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.