Job Description P29349 Confidence 100.00% Date Tue Jan 22 11:46:53 GMT 2013 Rank 6 Aligned Residues 391 % Identity 30% Template c1larB_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: B: PDB Molecule:protein (lar); PDBTitle: crystal structure of the tandem phosphatase domains of rptp2 lar Resolution 2.00 Å

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		243	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	R	N	E	G	Y	K	Q	E	N	R	L	K	N	R	Y	R	N	I	L	P	Y	D	H	T	R	V	K	L	L	D	V	E	H	S	V	A	G	A	E	Y	I	N	A	N	Y	I	R	L	P	T	D	G	D	L	Y	N	M	S	S	S	S	E	S	L	N	S	S	V	P	S	C	P	A	C	T	A	A	Q	T
Query Conservation
Alig confidence																																			.															.	.
Template Conservation																																			.															.	.
Template Sequence		T	W	E	N	S	N	L	E	V	N	K	P	K	N	R	Y	A	N	V	I	A	Y	D	H	S	R	V	I	L	T	S	I	D	.	G	V	P	G	S	D	Y	I	N	A	N	Y	I	D	.	.	G	Y	R	K	Q	N	A	Y	I	A	T	Q	G	P	L	P	E	T	M	G	D	F	W	R	M	V	W	E	Q	R
Template Known Secondary structure								S	T	T	T	G	G	G		S	S	T	T					T	T	T	B							T	.	T		T	T	T	T			S						.	.		T	T													T	T	T											T	T
Template Predicted Secondary structure																																			.															.	.
Template SS confidence
		1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.		.	.	.	.	.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.			.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.
		323	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350																													.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		Q	R	N	C	S	N	C	Q	L	Q	N	K	T	C	V	Q	C	A	V	K	S	A	I	L	P	Y	S	N	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	C	A	T	C	S	R	K	S	D	S	L	S	K	H	K	R	S	E	S	S	A	S	S	S
Query Conservation																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																														.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		T	A	T	V	V	M	M	T	R	L	E	E	K	S	R	V	K	C	D	Q	Y	W	P	A	R	G	T	E	T	C	G	L	I	Q	V	T	L	L	D	T	V	E	L	A	T	Y	T	V	R	T	F	A	L	H	K	S	G	S	S	E	K	R	E	L	R	Q	F	Q	F	M	A	W	P	D	H	G	V	P	E	Y
Template Known Secondary structure									S		S	B	S	S	S	S	B	S	S				S		S	S	S					T	T												S	S											T	T																	S	S	S	S		S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1417	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.
		375	.																	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.																.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Query Sequence		P	S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	S	G	S	G	P	G	S	S	G	T	S	G	V	S	S	V	N	G	P	G	T	P	T	N	L	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	S	G	T	A	G	C	L	V	G	L	L	K	R	H	S	N	D	S	.
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																												.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																				.
Template Conservation
Template Sequence		P	T	P	I	L	A	F	L	R	R	V	K	A	C	N	P	L	D	A	G	P	M	V	V	H	C	S	A	G	V	G	R	T	G	C	F	I	V	I	D	A	M	L	E	R	M	K	H	E	K	T	V	D	I	Y	G	H	V	T	C	M	R	S	Q	R	N	Y	M	V	Q	T	E	D	Q	Y	V	F	I	H	E
Template Known Secondary structure		S														S		T	T								S	S	S	S	S	S																			S															S	T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1497	.	.	1500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1570	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	L	L	E	A	A	T	C	G	H	T	E	V	P	A	R	N	L	Y	A	H	I	Q	K	L	G	Q	V	P	P	G	E	S	V	T	A	M	E	L	E	F	K	L	L	A	S	S	S	R	F	I	S	A	N	L	P	C	N	K	F	K	N	R	L	V	N	I	M	P	Y	E	L	T	R	V	C	L	Q	P	I
Template Known Secondary structure																T	T	S									T	S			T	T		S	S									T	T	T										S	G	G	G	G	G	G		S	S	T	T					T	T	T	B						B
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1577	.	.	1580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1650	.	.	.	.	.	.
		423	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	G	A	V	S	I	S	M	A	E	R	E	R	E	R	E	R	E	M	F	K	T	Y	I	A	T	Q	G	C	L	L	T	Q	Q	V	N	T	V	T	D	F	W	N	M	V	W	Q	E	N	T	R	V	I	V	M	T	T	K	E	Y	E	R	G	K	E	K	C	A	R	Y	W	P	D	E	G	R	S	E	Q	F
Query Conservation
Alig confidence																																.	.	.	.																																									.
Template Conservation																																.	.	.	.																																									.
Template Sequence		R	G	V	E	G	S	D	Y	I	N	A	S	F	L	D	G	Y	R	Q	Q	K	A	Y	I	A	T	Q	G	P	L	.	.	.	.	A	E	S	T	E	D	F	W	R	M	L	W	E	H	N	S	T	I	I	V	M	L	T	K	L	R	E	M	G	R	E	K	C	H	Q	Y	W	P	A	E	.	R	S	A	R	Y
Template Known Secondary structure		T	T	B	T	T	T	T			S							S	S	S	T	T										.	.	.	.	G	G	G											T	T								S		S			T	T			S	S				S		S	S	.	S
Template Predicted Secondary structure																																.	.	.	.																																									.
Template SS confidence
		1661	.	.	.	.	.	.	.	.	1670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1690					.	.	.	.	.	.	.	.	.	1700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1730		.	.	.	.	.
		503	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.		.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.
Predicted Secondary structure																											.
Query SS confidence																											.
Query Sequence		G	H	A	R	I	Q	C	V	S	E	N	S	T	S	D	Y	T	L	R	E	F	L	V	S	W	.	R	D	Q	P	A	R	R	I	F	H	Y	H	F	Q	V	W	P	D	H	G	V	P	A	D	P	G	C	V	L	N	F	L	Q	D	V	N	T	R	Q	S	H	L	A	Q	A	G	E	K	P	G	P	I	C	V
Query Conservation																											.
Alig confidence																											.																																													.	.	.	.
Template Conservation																																																																								.	.	.	.
Template Sequence		Q	Y	F	V	V	D	P	M	A	E	Y	N	M	P	Q	Y	I	L	R	E	F	K	V	T	D	A	R	D	G	Q	S	R	T	I	R	Q	F	Q	F	T	D	W	P	E	Q	G	V	P	K	T	G	E	G	F	I	D	F	I	G	Q	V	H	K	T	K	E	Q	F	G	Q	.	.	.	.	D	G	P	I	T	V
Template Known Secondary structure		T	T												S	S											T	T	T														S		S	S	S			S	S																		T	T		.	.	.	.		S
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.	.	.
Template SS confidence
		1736	.	.	.	1740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1800	.	.	.	.	.					.	.	.	.	1810	.
		582	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	C	S	A	G	I	G	R	T	G	T	F	I	V	I	D	M	I	L	D	Q	I	V	R	N	G	L	D	T	E	I	D	I	Q	R	T	I	Q	M	V	R	S	Q	R	S	G	L	V	Q	T	E	A	Q	Y	K	F	V	Y	Y	A	V	Q	H	Y	I	Q	T
Query Conservation
Alig confidence																													.	.	.
Template Conservation																													.	.	.
Template Sequence		H	C	S	A	G	V	G	R	T	G	V	F	I	T	L	S	I	V	L	E	R	M	R	Y	E	G	V	.	.	.	V	D	M	F	Q	T	V	K	T	L	R	T	Q	R	P	A	M	V	Q	T	E	D	Q	Y	Q	L	C	Y	R	A	A	L	E	Y	L	G	S
Template Known Secondary structure			S	S	S	S	S	S																			S		.	.	.												T	T	S	T	T	S	S		S
Template Predicted Secondary structure																													.	.	.
Template SS confidence
		1812	.	.	.	.	.	.	.	1820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1830	.	.	.	.	.	.	.	.				.	1840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1870	.	.	.	.	.