Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q24145 Date Tue Jan 22 11:35:34 GMT 2013 Unique Job ID 8157dca3e4a2af7d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	R	D	S	D	P	M	K	W	Y	H	G	N	L	S	R	E	A	A	D	E	L	L	K	Q	G	Y	E	D	G	T	F	L	V	R	E	S	S	T	A	A	G	D	F	V	L	S	L	L	C	Q	G	E	V	C	H	Y	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	R	H	G	G	E	D	A	F	F	S	I	D	D	K	V	Q	T	K	I	L	H	G	L	D	T	L	V	D	Y	Y	Q	Q	A	A	N	G	L	P	T	K	L	T	V	P	L	I	R	D	L	P	P	H	N	T	R	S	H	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?									?	?	?	?		?																																?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	N	L	L	H	R	A	T	S	K	N	E	S	K	V	V	F	E	L	L	K	C	G	Y	R	N	F	D	A	K	N	Q	D	G	Q	T	A	L	H	L	A	A	L	H	S	D	E	D	I	L	K	H	L	L	N	A	K	V	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?														?	?	?	?	?	?	?	?																									?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	S	S	D	S	F	G	C	Q	P	L	H	Y	A	A	R	S	K	P	A	S	F	I	R	T	L	I	S	A	Q	A	N	V	Q	G	R	N	I	D	N	G	Y	V	P	L	H	E	A	A	K	H	G	N	L	E	A	V	Q	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?		?									?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	L	A	E	A	P	P	L	P	R	T	S	S	G	E	F	P	F	D	L	A	K	E	A	G	Q	T	A	V	E	E	F	L	L	N	Y	K	L	P	P	A	N	T	T	R	D	Q	W	Y	H	G	T	L	T	R	E	E	A	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																	?		?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	L	K	K	H	A	K	E	L	L	A	K	Q	P	E	V	D	T	S	G	C	F	L	V	R	Y	S	E	S	P	A	A	S	G	L	V	L	T	L	L	C	D	Q	V	V	K	N	F	R	I	S	Q	A	D	L	Y	Q	N	G	N
Secondary structure
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Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?													?	?																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	V	Q	S	G	G	S	K	F	L	Y	I	D	D	G	P	Y	W	P	S	V	E	H	L	I	A	H	F	M	R	F	S	Y	G	L	P	V	S	L	K	Y	P	V	P	P	Q	P	K	P	E	V	P	S	F	A	T	I	P	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?																																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		N	M	K	P	K	A	A	S	P	A	T	P	P	T	P	V	S	P	H	S	H	H	Q	H	P	H	V	P	A	L	T	I	T	K	K	K	Q	K	E	N	S	S	S	M	F	N	T	L	R	L	T	S	P	K	K	A	L	F	D	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		N	S	L	R	K	N	K	S	K	G	K	R	S	D	S	E	S	S	V	S	G	S	L	A	G	T	E	Q	E	L	Q	A	A	A	P	M	L	K	S	L	S	F	S	T	E	F	S	T	F	N	A	D	G	V	T	G	S	G	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence
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Sequence		A	A	G	E	V	Y	N	V	P	R	N	N	T	P	I	E	I	D	L	P	P	I	A	Q	K	T	E	A	E	V	E	Y	F	T	K	S	D	V	A	I	E	R	E	R	A	G	Q	W	I	G	N	G	Y	Q	P	T	M	D	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?									?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?			?	?		?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?		?				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		S	L	L	D	Q	Q	I	K	A	P	A	V	A	R	L	N	S	L	G	P	N	A	S	T	E	S	E	M	A	S	Y	L	H	R	K	C	S	G	T	P	S	T	P	S	A	T	E	V	E	A	A	K	L	R	F	F	I	E	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		K	L	V	L	D	R	E	I	G	H	G	E	F	G	S	V	H	S	G	W	L	L	R	K	S	G	A	G	E	E	S	R	L	E	V	A	I	K	M	L	S	D	E	H	S	N	K	Q	E	F	L	R	E	A	S	V	M	M	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?																	?	?	?	?	?	?												?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		E	H	K	C	I	V	R	L	I	G	I	A	K	G	E	M	L	M	M	V	Q	E	L	A	P	L	G	S	M	L	Q	Y	I	L	D	H	G	H	E	I	T	A	N	A	E	L	K	V	W	A	S	Q	I	A	C	G	M	H	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		E	S	Q	H	F	V	H	R	D	L	A	A	R	N	I	L	L	T	A	R	H	Q	A	K	I	S	D	F	G	M	S	R	S	L	R	P	G	S	T	E	Y	Q	F	T	Q	G	G	R	W	P	I	R	W	Y	A	P	E	S	F	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?					?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		L	G	I	F	S	H	A	S	D	V	W	S	F	G	V	T	I	W	E	M	F	S	L	G	A	P	P	Y	G	E	I	S	N	V	D	A	I	K	L	V	D	S	G	E	R	L	P	Q	P	N	L	C	P	A	Y	I	Y	A	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?		?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	S	C	W	K	E	R	P	K	D	R	P	T	F	V	Y	L	T	E	F	F	A	R	D	P	D	Y	Q	N	L	P	E	L	V	Q	T	V	H	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?				?	?														?				?						?	?	?	?
Disorder confidence