Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q9W4A9 Date Wed Feb 13 11:40:50 GMT 2013 Unique Job ID 6a634b058052ce20

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	P	R	N	T	E	A	G	A	G	N	A	N	T	G	G	S	G	G	V	G	G	A	P	E	P	S	S	P	V	Q	K	V	W	K	P	E	L	Y	K	L	Q	L	E	A	P	A	P	C	P	L	R	C	Q	R	T	L	P	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?						?													?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	A	K	S	T	A	E	A	V	E	A	N	N	L	A	G	R	L	Y	G	S	E	Y	H	G	L	M	G	H	L	E	A	E	Q	L	L	A	N	A	R	D	G	S	Y	F	V	R	R	S	P	Q	S	D	G	Y	Y	T	L	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?					?	?	?		?	?						?	?	?		?		?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	F	N	K	R	P	K	H	Y	K	L	L	Y	K	P	G	V	G	H	Y	L	R	G	Q	D	K	R	F	D	T	V	H	D	M	V	A	D	G	L	I	N	F	H	M	Q	L	H	A	S	P	I	I	Q	Q	I	N	Q	Q	T	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?				?		?	?	?	?														?																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	C	Y	Q	Q	S	P	Y	M	T	L	N	G	R	K	L	R	A	L	S	N	E	L	G	K	A	A	A	K	E	S	K	E	S	P	A	E	E	K	E	Q	K	Q	E	E	P	P	P	P	A	V	D	P	M	P	L	V	Y	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	H	H	F	K	V	H	T	F	K	G	L	N	W	C	E	F	C	A	N	F	L	W	G	F	T	A	Q	G	V	K	C	E	A	C	G	F	V	A	H	S	K	C	S	E	L	V	P	P	K	C	V	P	D	L	K	R	I	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?		?	?	?	?		?	?	?														?	?				?										?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	F	G	T	D	L	T	T	M	V	Q	L	E	P	H	H	Q	I	P	F	V	V	R	R	C	V	E	E	V	E	A	R	G	M	L	Q	E	G	I	Y	R	V	S	G	F	A	D	E	I	E	A	L	K	L	A	L	D	R	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	K	T	D	M	S	E	T	A	Y	G	N	V	N	V	I	A	G	T	L	K	L	Y	L	R	L	L	P	V	P	L	I	T	F	Q	A	Y	P	S	F	M	A	A	G	R	T	G	K	Q	A	E	Q	R	Q	L	M	A	E	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	R	L	P	P	A	H	H	S	C	L	Q	Y	M	L	E	H	L	K	R	V	A	S	H	Y	A	V	N	K	M	N	E	H	N	L	A	T	V	F	A	P	T	L	I	A	T	P	Q	H	M	T	N	L	T	E	E	I	F	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?	?	?																	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Sequence		S	S	L	I	T	H	C	K	T	I	F	A	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand