Phyre 2 Results for Q9VIF7

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	Q9VIF7
Date	Tue Jan 22 11:36:07 GMT 2013
Unique Job ID	603283f5cccf2ada

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M N S A V D A W A V T P R E R L K Y Q E Q F R A L Q P Q A G F V T G A Q A K G F F L Q S Q L P P L I L G Q I W A L A D T

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence D S D G K M N I N E F S I A C K L I N L K L R G M D V P K V L P P S L L S S L T G D V P S M T P R G S T S S L S P L D P

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence L K G I V P A V A P V V P V V A P P V A V A T V I S P P G V S V P S G P T P P T S N P P S R H T S I S E R A P S I E S V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence N Q G E W A V Q A A Q K R K Y T Q V F N A N D R T R S G Y L T G S Q A R G V L V Q S K L P Q V T L A Q I W T L S D I D G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence D G R L N C D E F I L A M F L C E K A M A G E K I P V T L P Q E W V P P N L R K I K S R P G S V S G V V S R P G S Q P A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ?
?
? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence S R H A S V S S Q S G V G V V D A D P T A G L P G Q T S F E D K R K E N Y V K G Q A E L D R R R K I M E D Q Q R K E R E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence E R E R K E R E E A D K R E K A R L E A E R K Q Q E E L E R Q L Q R Q R E I E M E K E E Q R K R E L E A K E A A R K E L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence E K Q R Q Q E W E Q A R I A E M N A Q K E R E Q E R V L K Q K A H N T Q L N V E L S T L N E K I K E L S Q R I C D T R A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence G V T N V K T V I D G M R T Q R D T S M S E M S Q L K A R I K E Q N A K L L Q L T Q E R A K W E A K S K A S G A A L G G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence E N A Q Q E Q L N A A F A H K Q L I I N Q I K D K V E N I S K E I E S K K E D I N T N D V Q M S E L K A E L S A L I T K

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence C E D L Y K E Y D V Q R T S V L E L K Y N R K N E T S V S S A W D T G S S S A W E E T G T T V T D P Y A V A S N D I S A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence L A A P A V D L G G P A P E G F V K Y Q A V Y E F N A R N A E E I T F V P G D I I L V P L E Q N A E P G W L A G E I N G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence H T G W F P E S Y V E K L E V G E V A P V A A V E A P V D A Q V A T V A D T Y N D N I N T S S I P A A S A D L T A A G D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence V E Y Y I A A Y P Y E S A E E G D L S F S A G E M V M V I K K E G E W W T G T I G S R T G M F P S N Y V Q K A D V G T A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence S T A A A E P V E S L D Q E T T L N G N A A Y T A A P V E A Q E Q V Y Q P L P V Q E P S E Q P I S S P G V G A E E A H E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence D L D T E V S Q I N T Q S K T Q S S E P A E S Y S R P M S R T S S M T P G M R A K R S E I A Q V I A P Y E A T S T E Q L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence S L T R G Q L I M I R K K T D S G W W E G E L Q A K G R R R Q I G W F P A T Y V K V L Q G G R N S G R N T P V S G S R I

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence E M T E Q I L D K V I A L Y P Y K A Q N D D E L S F D K D D I I S V L G R D E P E W W R G E L N G L S G L F P S N Y V G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . .

Sequence P F V T S G K P A K A N G T T K K

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand