Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q9VXH3 Date Wed Feb 13 11:23:55 GMT 2013 Unique Job ID 2eb76761bdeaa822

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	C	F	S	A	M	S	A	P	L	L	G	E	M	E	Q	T	I	G	M	L	E	R	G	T	I	V	T	K	L	Y	G	K	Q	R	R	P	D	R	R	H	L	M	L	I	R	E	T	R	Q	L	L	W	A	T	V	A	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	P	R	T	D	Y	E	G	A	I	Q	L	R	E	I	R	E	I	R	V	G	K	H	S	K	E	F	R	L	F	A	D	D	C	Q	R	F	E	S	S	K	C	F	V	I	L	H	G	N	H	F	K	L	K	S	F	S	V	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	S	E	I	E	A	D	N	W	V	R	G	L	R	Y	M	V	K	D	T	L	G	A	P	Y	P	L	Q	I	D	R	W	L	R	R	E	Y	Y	Q	I	E	N	V	N	T	H	S	A	K	A	T	E	Q	S	P	A	Q	V	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	D	F	K	L	F	L	A	G	V	S	C	K	M	T	T	G	K	F	M	E	H	F	T	E	D	V	R	R	K	H	D	L	K	F	D	D	F	S	R	L	Y	Q	K	L	L	L	P	N	G	F	A	S	V	L	S	G	S	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?		?	?	?	?	?	?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	N	F	P	Y	S	E	D	Q	Q	V	V	R	P	A	E	L	K	Q	F	L	E	T	E	Q	R	D	V	S	A	S	E	I	S	S	A	A	I	A	S	F	I	R	D	F	V	Q	D	V	E	R	D	V	Q	E	P	Y	L	T	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?							?																																								?	?		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	E	F	V	D	F	L	F	S	K	Q	N	D	L	W	N	S	K	Y	D	Q	V	F	M	D	M	N	L	P	L	S	S	Y	W	I	A	S	S	H	N	T	Y	L	T	G	D	Q	F	S	S	E	S	S	C	E	A	Y	A	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	R	M	G	C	R	C	I	E	L	D	C	W	N	G	P	D	N	L	P	Y	I	F	H	G	H	T	I	T	S	K	I	K	F	M	D	V	I	K	T	I	K	D	H	A	F	T	S	S	E	Y	P	V	I	L	S	I	E	Q	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		C	S	L	E	Q	Q	R	N	M	A	Q	A	L	I	E	V	F	G	D	M	L	L	T	Q	P	C	D	R	N	E	Q	H	L	P	S	P	Y	Q	L	R	R	K	I	I	L	K	H	K	K	L	P	Q	F	D	D	I	A	N	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?		?													?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	S	T	G	S	L	G	H	R	S	S	L	G	G	A	G	G	G	A	H	G	E	N	D	G	E	N	V	R	K	V	F	K	E	G	L	L	Y	F	K	D	P	V	D	K	S	W	N	L	Y	Q	F	V	L	T	H	Q	E	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Y	S	S	E	I	N	E	S	R	N	G	N	S	E	D	D	D	F	G	L	S	S	S	C	S	L	N	S	N	M	Q	Q	K	Q	K	D	T	S	A	N	D	E	L	H	F	G	E	N	W	F	H	G	K	L	E	G	G	R	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	D	D	L	L	K	K	Y	K	H	F	G	D	G	T	F	L	V	R	E	S	A	T	F	V	G	D	Y	S	L	S	F	W	R	R	N	R	P	N	H	C	R	I	K	L	K	H	E	N	G	S	I	K	Y	Y	L	V	E	N	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	F	D	S	L	Y	S	L	I	V	Y	Y	R	K	N	M	L	R	S	S	E	F	S	I	I	L	K	E	P	V	P	Q	P	K	K	H	E	D	Q	E	W	F	H	P	N	T	T	K	E	Q	A	E	Q	G	L	Y	R	L	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		G	S	F	L	V	R	P	S	V	Q	S	I	N	A	F	V	I	S	F	T	I	N	R	K	I	K	H	C	R	I	M	Q	E	G	R	L	Y	G	I	D	T	M	N	F	E	S	L	V	S	L	I	N	Y	Y	T	R	N	P	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?																						?									?																?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		R	N	V	K	L	S	H	P	V	S	Q	E	L	L	R	Q	A	L	A	E	A	A	Q	G	D	H	S	G	G	H	D	D	N	G	A	S	N	Y	M	G	S	N	L	E	E	N	V	T	C	K	A	L	Y	S	Y	K	A	N	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?					?	?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		D	E	L	S	F	P	K	H	A	I	I	T	N	V	Q	R	D	N	S	M	W	W	I	G	D	Y	G	G	M	I	K	K	H	L	P	A	N	Y	V	K	V	I	D	S	T	T	E	D	Y	N	S	L	N	E	E	G	T	D	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																		?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		T	D	S	I	E	I	F	G	A	V	A	S	L	F	E	S	N	D	P	G	I	I	F	K	L	Q	I	Q	T	P	T	M	Q	N	P	F	V	I	G	F	D	N	Q	E	T	A	Y	E	W	I	K	A	I	Q	E	A	A	L	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?		?					?	?	?	?		?	?						?	?	?	?	?				?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		S	Q	L	A	S	E	R	R	K	K	E	R	T	A	R	V	A	K	E	M	S	D	L	I	I	Y	F	R	S	V	P	F	R	E	H	S	W	I	F	Q	E	M	S	S	F	P	E	T	K	A	E	K	Q	F	F	Q	Q	N	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?				?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		L	F	L	S	Y	H	R	N	Q	I	S	R	V	Y	P	K	G	Q	R	L	D	S	S	N	F	N	P	M	P	F	W	N	V	G	S	Q	M	I	A	L	N	Y	Q	T	G	D	K	A	M	Q	L	N	Q	A	K	F	R	N	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		Q	C	G	Y	I	L	K	P	S	F	M	K	S	D	S	F	N	P	N	N	P	L	C	D	G	L	S	E	V	K	V	S	I	R	L	I	A	A	R	H	L	F	R	G	G	K	S	N	N	P	Q	I	V	V	E	L	I	G	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?										?		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		F	D	T	G	V	K	Y	R	T	K	V	N	E	N	G	F	N	P	V	W	N	E	S	C	E	F	N	V	R	N	P	Q	F	A	I	L	R	F	E	V	Q	D	E	D	M	F	A	E	T	H	F	I	A	Q	A	C	Y	P	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?																																							?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.
Sequence		C	I	R	Q	G	Y	R	S	V	I	L	R	N	K	F	S	E	E	L	E	L	S	S	L	L	I	N	I	K	I	A	N	V	T	A	P
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SS confidence
Disorder																	?																?	?	?	?	?
Disorder confidence