Job Description Q9VXH3 Confidence 100.00% Date Wed Feb 13 11:23:55 GMT 2013 Rank 3 Aligned Residues 669 % Identity 36% Template c2fjuB_ PDB info PDB header:signaling protein,apoptosis/hydrolase Chain: B: PDB Molecule:1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate PDBTitle: activated rac1 bound to its effector phospholipase c beta 2 Resolution 2.20 Å

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		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		P	L	L	G	E	M	E	Q	T	I	G	M	L	E	R	G	T	I	V	T	K	L	Y	G	K	Q	R	R	P	D	R	R	H	L	M	L	I	R	E	T	R	Q	L	L	W	A	T	V	A	T	Q	T	P	R	T	D	Y	E	G	A	I	Q	L	R	E	I	R	E	I	R	V	G	K	H	S	K	E	F	R	L
Query Conservation
Alig confidence						.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template Conservation						.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template Sequence		P	K	V	K	.	.	.	.	.	.	A	Y	L	S	Q	G	E	R	F	I	K	W	D	D	E	T	T	V	A	S	P	V	I	L	R	V	D	P	K	G	Y	Y	L	Y	W	T	Y	Q	S	K	E	M	E	.	.	.	.	.	.	F	L	D	I	T	S	I	R	D	T	R	F	G	K	F	A	K	M	P	K	S
Template Known Secondary structure						.	.	.	.	.	.													S	S	S	S	S											T	T	S								T	T	S				.	.	.	.	.	.				G	G	G							G	G	G	S					S
Template Predicted Secondary structure						.	.	.	.	.	.																																												.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		11	.	.	.							.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.							.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.
		90	.								.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.		.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.
Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.	.	.																					.
Query SS confidence				.	.	.	.	.	.	.																					.
Query Sequence		F	A	.	.	.	.	.	.	.	D	D	C	Q	R	F	E	S	S	K	C	F	V	I	L	H	G	N	H	F	.	K	L	K	S	F	S	V	V	A	L	S	E	I	E	A	D	N	W	V	R	G	L	R	Y	M	V	K	D	T	L	G	A	P	Y	P	L	Q	I	D	R	W	L	R	R	E	Y	Y	Q	I	E
Query Conservation				.	.	.	.	.	.	.																					.
Alig confidence				.	.	.	.	.	.	.																					.																																						.	.
Template Conservation																																																																					.	.
Template Sequence		Q	K	L	R	D	V	F	N	M	D	F	P	D	N	S	F	L	L	K	T	L	T	V	V	S	G	P	D	M	V	D	L	T	F	H	N	F	V	S	Y	K	E	N	V	G	K	A	W	A	E	D	V	L	A	L	V	K	H	P	L	T	A	N	A	S	R	S	.	.	T	F	L	D	K	I	L	V	K	L	K
Template Known Secondary structure								T	T	T	T	S	T	T			G	G	G	T								S	S	S	S	S									S	S	S	S														T						T					.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.
Template SS confidence
		79	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.			.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.
		162	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.			.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.		.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																.	.															.
Query SS confidence																																.	.															.
Query Sequence		N	V	N	T	H	S	A	K	A	T	E	Q	S	P	A	Q	V	T	I	K	D	F	K	L	F	L	A	G	V	S	.	.	C	K	M	T	T	G	K	F	M	E	H	F	T	E	.	D	V	R	R	K	H	D	L	K	F	D	D	F	S	R	L	Y	Q	K	L	L	L	P	N	G	F	A	S	V	L	S	G	S
Query Conservation																																.	.															.
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.																						.	.															.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		M	.	.	.	.	.	.	.	.	Q	L	N	S	E	G	K	I	P	V	K	N	F	F	Q	M	F	P	A	D	R	K	R	V	E	A	A	L	S	A	C	H	L	P	K	G	K	N	D	A	I	N	P	E	D	F	P	E	P	V	Y	K	S	F	L	M	S	L	C	P	R	P	E	I	D	E	I	F	T	S	Y
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	S			T	T	S											S	T	T												T	T				S	S	S					G	G	G	S		T	T										S
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		157									.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.
		239	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		G	V	A	N	F	P	Y	S	E	D	Q	Q	V	V	R	P	A	E	L	K	Q	F	L	E	T	E	Q	R	D	V	S	A	S	E	I	S	S	A	A	I	A	S	F	I	R	D	F	V	Q	D	V	E	R	D	V	Q	E	P	Y	L	T	F	P	E	F	V	D	F	L	F	S	K	Q	N	D	L	W	N	S	K
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.				.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.				.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	T	K	E	H	L	T	K	F	I	N	Q	K	Q	R	D	Q	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	L	I	D	K	Y	.	E	P	S	.	.	.	.	.	.	G	Q	L	S	P	E	G	M	V	W	F	L	C	G	P	E	N	S	V	L	A	Q	D
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.		B											T	S				.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.				.	.	.	.	.	.		B												S	T	T	S		S	B		G	G
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.							.				.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															236	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.												.	.	.	.	.	.		.	260	.							.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.
		319	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.			.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																																											.	.
Query SS confidence																																																											.	.
Query Sequence		Y	D	Q	V	F	M	D	M	N	L	P	L	S	S	Y	W	I	A	S	S	H	N	T	Y	L	T	G	D	Q	F	S	S	E	S	S	C	E	A	Y	A	R	A	L	R	M	G	C	R	C	I	E	L	D	C	W	N	G	.	.	P	D	N	L	P	Y	I	F	H	G	H	T	I	T	S	K	I	K	F	M	D
Query Conservation																																																											.	.
Alig confidence																																																											.	.
Template Conservation
Template Sequence		K	L	L	L	H	H	D	M	T	Q	P	L	N	H	Y	F	I	N	S	S	H	N	T	Y	L	T	A	G	Q	F	S	G	L	S	S	A	E	M	Y	R	Q	V	L	L	S	G	C	R	C	V	E	L	D	C	W	K	G	K	P	P	D	E	E	P	I	I	T	H	G	F	T	M	T	T	D	I	F	F	K	E
Template Known Secondary structure		G	G	S	S		S				S		G	G	G					B	B	S	S	T	T	B	S	S		S	S	S	S		B		T									T	T													T	T	T	T							T	T	S	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		307	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.
		397	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.		.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.					.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.
Predicted Secondary structure																											.																												.	.	.	.
Query SS confidence																											.																												.	.	.	.
Query Sequence		V	I	K	T	I	K	D	H	A	F	T	S	S	E	Y	P	V	I	L	S	I	E	Q	N	C	.	S	L	E	Q	Q	R	N	M	A	Q	A	L	I	E	V	F	G	D	M	L	L	T	Q	P	C	D	R	.	.	.	.	N	E	Q	H	L	P	S	P	Y	Q	L	R	R	K	I	I	L	K	H	K	K	L	P
Query Conservation																											.																												.	.	.	.
Alig confidence																											.																												.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		A	I	E	A	I	A	E	S	A	F	K	T	S	P	Y	P	I	I	L	S	F	E	N	H	V	D	S	P	R	Q	Q	A	K	M	A	E	Y	C	R	T	I	F	G	D	M	L	L	T	E	P	L	E	K	F	P	L	K	P	G	V	P	L	P	S	P	E	D	L	R	G	K	I	L	I	K	N	K	K	E	E
Template Known Secondary structure										T	T	T	S			S																												G	G	G	B			S			T	T	S		S	S	T	T						T	T	T	T	T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		387	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
		472	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	F	D	D	I	A	N	G	I	S	S	T	G	S	L	G	H	R	S	S	L	G	G	A	G	G	G	A	H	G	E	N	D	G	E	N	V	R	K	V	F	K	E	G	L	L	Y	F	K	D	P	V	D	K	S	W	N	L	Y	Q	F	V	L	T	H	Q	E	L	I	Y	S	S	E	I	N	E	S	R	N	G
Query Conservation
Alig confidence													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		S	G	N	L	D	E	E	E	I	K	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T	T	T	T	T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure													.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		514	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		N	S	E	D	D	D	F	G	L	S	S	S	C	S	L	N	S	N	M	Q	Q	K	Q	K	D	T	S	A	N	D	E	L	H	F	G	E	N	W	F	H	G	K	L	E	G	G	R	K	E	A	D	D	L	L	K	K	Y	K	H	F	G	D	G	T	F	L	V	R	E	S	A	T	F	V	G	D	Y	S	L	S
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		632	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		F	W	R	R	N	R	P	N	H	C	R	I	K	L	K	H	E	N	G	S	I	K	Y	Y	L	V	E	N	F	V	F	D	S	L	Y	S	L	I	V	Y	Y	R	K	N	M	L	R	S	S	E	F	S	I	I	L	K	E	P	V	P	Q	P	K	K	H	E	D	Q	E	W	F	H	P	N	T	T	K	E	Q	A
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		712	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	Q	G	L	Y	R	L	E	I	G	S	F	L	V	R	P	S	V	Q	S	I	N	A	F	V	I	S	F	T	I	N	R	K	I	K	H	C	R	I	M	Q	E	G	R	L	Y	G	I	D	T	M	N	F	E	S	L	V	S	L	I	N	Y	Y	T	R	N	P	L	Y	R	N	V	K	L	S	H	P	V	S	Q
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		792	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	L	L	R	Q	A	L	A	E	A	A	Q	G	D	H	S	G	G	H	D	D	N	G	A	S	N	Y	M	G	S	N	L	E	E	N	V	T	C	K	A	L	Y	S	Y	K	A	N	K	P	D	E	L	S	F	P	K	H	A	I	I	T	N	V	Q	R	D	N	S	M	W	W	I	G	D	Y	G	G	M	I	K
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		872	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		K	H	L	P	A	N	Y	V	K	V	I	D	S	T	T	E	D	Y	N	S	L	N	E	E	G	T	D	G	R	T	D	S	I	E	I	F	G	A	V	A	S	L	F	E	S	N	D	P	G	I	I	F	K	L	Q	I	Q	T	P	T	M	Q	N	P	F	V	I	G	F	D	N	Q	E	T	A	Y	E	W	I	K
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		952	.	.	.	.	.	.	.	960	.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.						.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																																												.	.	.	.	.
Query SS confidence																																												.	.	.	.	.
Query Sequence		A	I	Q	E	A	A	L	I	A	S	Q	L	A	S	E	R	R	K	K	E	R	T	A	R	V	A	K	E	M	S	D	L	I	I	Y	F	R	S	V	P	F	R	.	.	.	.	.	E	H	S	W	I	F	Q	E	M	S	S	F	P	E	T	K	A	E	K	Q	F	F	Q	Q	N	T	Q	L	F	L	S	Y	H
Query Conservation																																												.	.	.	.	.
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																.	.	.	.	.																						.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	M	Q	S	D	E	G	T	A	G	L	E	V	T	A	Y	E	E	M	S	S	L	V	N	Y	I	Q	P	T	K	F	V	S	F	E	F	S	A	Q	K	N	R	S	Y	V	I	S	S	F	T	E	L	K	A	Y	D	L	L	.	S	K	A	S	V	Q	F	V	D	Y	N
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	T	T	T	G	G	G	G											T	T		S	S																T		T	T															.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																										.
Template SS confidence
													525	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.		.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.
		1027	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	N	Q	I	S	R	V	Y	P	K	G	Q	R	L	D	S	S	N	F	N	P	M	P	F	W	N	V	G	S	Q	M	I	A	L	N	Y	Q	T	G	D	K	A	M	Q	L	N	Q	A	K	F	R	N	N	G	Q	C	G	Y	I	L	K	P	S	F	M	K	S	D	S	F	N	P	N	N	P	L	C	D	G	L
Query Conservation
Alig confidence																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		K	R	Q	M	S	R	I	Y	P	K	G	T	R	M	D	S	S	N	Y	M	P	Q	M	F	W	N	A	G	C	Q	M	V	A	L	N	F	Q	T	M	D	L	P	M	Q	Q	N	M	A	V	F	E	F	N	G	Q	S	G	Y	L	L	K	H	E	F	M	R	R	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure				S								T	T		T	T												T	T						B		T	T			S										T	T	T	G	G	G		S						G	G	G	T		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		593	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		1107	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.			.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.		.	.	.	.	.	.		.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.
Predicted Secondary structure																																										.	.																.							.
Query SS confidence																																										.	.																.							.
Query Sequence		S	E	V	K	V	S	I	R	L	I	A	A	R	H	L	F	R	G	G	K	S	N	N	P	Q	I	V	V	E	L	I	G	A	S	F	D	T	G	V	K	.	.	Y	R	T	K	V	N	E	N	G	F	N	P	V	W	N	.	E	S	C	E	F	N	.	V	R	N	P	Q	F	A	I	L	R	F	E	V	Q	D
Query Conservation																																										.	.																.							.
Alig confidence		.																		.	.																					.	.																.							.
Template Conservation		.																		.	.
Template Sequence		.	P	T	T	L	S	I	T	V	I	S	G	Q	F	L	S	E	R	.	.	S	V	R	T	Y	V	E	V	E	L	F	G	L	P	G	D	P	K	R	R	Y	R	T	K	L	S	P	S	T	N	S	I	N	P	V	W	K	E	E	P	F	V	F	E	K	I	L	M	P	E	L	A	S	L	R	V	A	V	M	E
Template Known Secondary structure		.													S			S	S	.	.														T	T	S											S	S	S			S	S		B												S		G	G	G
Template Predicted Secondary structure		.																		.	.
Template SS confidence
			660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.			.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.
		1183	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		E	D	M	F	A	E	T	H	F	I	A	Q	A	C	Y	P	L	T	C	I	R	Q	G	Y	R	S	V	I	L	R	N	K	F	S	E	E	L	E	L	S	S	L	L	I	N	I	K	I	A	N
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.
Template Conservation				.	.	.	.
Template Sequence		E	G	.	.	.	.	N	K	F	L	G	H	R	I	I	P	I	N	A	L	N	S	G	Y	H	H	L	C	L	H	S	E	S	N	M	P	L	T	M	P	A	L	F	I	F	L	E	M	K	D
Template Known Secondary structure		T	T	.	.	.	.	T										G	G	G	B												T	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.
Template SS confidence
		754	.					.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.