Job Description Q9VXH3 Confidence 99.60% Date Wed Feb 13 11:23:55 GMT 2013 Rank 30 Aligned Residues 149 % Identity 35% Template c2fjlA_ PDB info PDB header:hydrolase Chain: A: PDB Molecule:1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate PDBTitle: solution structure of the split ph domain in phospholipase2 c-gamma1 Resolution UNK

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		511	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		V	F	K	E	G	L	L	Y	F	K	D	P	V	D	K	S	W	N	L	Y	Q	F	V	L	T	H	Q	E	L	I	Y	S	S	E	I	N	E	S	R	N	G	N	S	E	D	D	D	F	G	L	S	S	S	C	S	L	N	S	N	M	Q	Q	K	Q	K	D	T	S	A	N	D	E	L	H	F	G	E	N	W	F
Query Conservation
Alig confidence																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Conservation																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template Sequence		S	I	K	N	G	I	L	Y	L	E	D	P	V	N	H	E	W	Y	P	H	Y	F	V	L	T	S	S	K	I	Y	Y	S	E	E	T	S	S	D	Q	G	N	E	D	E	E	E	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	E	A	S	G	S	T	E	L	H	S	S	L	E	.	.
Template Known Secondary structure													T	T	T	T											T	T									S		S	S			S					S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.						S							S	S	.	.
Template Predicted Secondary structure																																																	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.															.	.
Template SS confidence
		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.																		.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.
		591	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		H	G	K	L	E	G	G	R	K	E	A	D	D	L	L	K	K	Y	K	H	F	G	D	G	T	F	L	V	R	E	S	A	T	F	V	G	D	Y	S	L	S	F	W	R	R	N	R	P	N	H	C	R	I	K	L	K	H	E	N	G	S	I	K	Y	Y	L	V	E	N	F	V	F	D	S	L	Y	S	L	I	V
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		671	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	Y	R	K	N	M	L	R	S	S	E	F	S	I	I	L	K	E	P	V	P	Q	P	K	K	H	E	D	Q	E	W	F	H	P	N	T	T	K	E	Q	A	E	Q	G	L	Y	R	L	E	I	G	S	F	L	V	R	P	S	V	Q	S	I	N	A	F	V	I	S	F	T	I	N	R	K	I	K	H	C	R	I
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	V	L	F	Q	G	P	N	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	S	G	G	G	S	S		S	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
															62	.	.	.	.	.	.	.
		751	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		M	Q	E	G	R	L	Y	G	I	D	T	M	N	F	E	S	L	V	S	L	I	N	Y	Y	T	R	N	P	L	Y	R	N	V	K	L	S	H	P	V	S	Q	E	L	L	R	Q	A	L	A	E	A	A	Q	G	D	H	S	G	G	H	D	D	N	G	A	S	N	Y	M	G	S	N	L	E	E	N	V	T	C	K
Query Conservation
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		831	.	.	.	.	.	.	.	.	840	.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900	.	.	.	.	.	.	.	.	.	910
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		A	L	Y	S	Y	K	A	N	K	P	D	E	L	S	F	P	K	H	A	I	I	T	N	V	Q	R	D	N	S	M	W	W	I	G	D	Y	G	G	M	I	K	K	H	L	P	A	N	Y	V	K	V	I	D	S	T	T	E	D	Y	N	S	L	N	E	E	G	T	D	G	R	T	D	S	I	E	I	F	G	A	V
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	A	I	L	E	P	E	R	E	H	L	D	E	N	S	P	L	G	D	L	L	R	G	V	L	D	V	P	A	C	Q
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	T	T	S		T	T		S	S	S		T	T	T	T	T	T	T								S	T	T
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
																																																				70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		911	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.		930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Predicted Secondary structure																					.
Query SS confidence																					.
Query Sequence		A	S	L	F	E	S	N	D	P	G	I	I	F	K	L	Q	I	Q	T	.	P	T	M	Q	N	P	F	V	I	G	F	D	N	Q	E	T	A	Y	E	W	I	K	A	I	Q	E	A	A	L	I	A
Query Conservation																					.
Alig confidence																					.
Template Conservation
Template Sequence		I	A	I	R	P	E	G	K	N	N	R	L	F	V	F	S	I	S	M	P	S	V	A	Q	W	S	L	D	V	A	A	D	S	Q	E	E	L	Q	D	W	V	K	K	I	R	E	V	A	Q	T	A
Template Known Secondary structure						T	T		S	S	S		S								T	T	T	S	S								S	S																T	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150

No model constructed - rank, confidence too low

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Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX]
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