Phyre 2 Results for Q9VPU1

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	Q9VPU1
Date	Tue Jan 22 11:34:19 GMT 2013
Unique Job ID	1e0757b109763eb9

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M L E H P Q R F V R N I P D S S A S S Q Q Y P Q Q Q Q H P P Q L P Q H Q N L N L N Q N Q N L N Q N Q I Y Q Y R P Q V P V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence P V P G S P A H H Q R H S S L S Q Q Q Q L H H H R T L S T A S S C S A Q H K S V T F G Q P A L D C G G N G S G S A N G S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence G S G N S S S G S A A G N A G T Q S M A G N M K H G K S Q D D V C Y V V A K Y D Y A A Q G A Q E L D L R K N E R Y L L L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence D D S K H W W R V Q N S R N Q S G Y V P S N Y V K K E K P S L F D S I K K K V K K G S G S K T L P N C S P S R Q V E S P

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence T M S R R L P P D P A E A I G T A V V K Y N Y Q A Q Q P D E L S L T K G T R I L I L E K S N D G W W R G Q S G N S V G W

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence F P S N Y T T E D C D N D G E I H T Y A M A E N V L D I V V A L Y S F T S N N D Q E L S F E K G D R L E I V D R P A S D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence P D W Y K A R N N Q G Q V G L V P R N Y L Q E L N D Y L A T P Y R N A S A S A G N G N G G G S N G G A G G G G G N D S M

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence E R R N E G N K P A A Q S S G Q P I E R P N L A G K S W Y Y G A I T R S Q C D T V L N G H G H D G D F L I R D S E T N M

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?
? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence G D Y S V S L K A P G R N K H F R V H V E Q N M Y C I G Q R K F H S L D Q L V D H Y Q R A P I Y T N K Q G E K L Y L V R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . .

Sequence S L P K A N G T

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand