Phyre 2 Results for Q9VYM1

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	Q9VYM1
Date	Tue Jan 22 11:43:10 GMT 2013
Unique Job ID	0718478ff70c60d8

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M P L S F L F R P F F I S V L P A I R T K Q L P F G E A Q Q A L Q L Q P A A A A A T A A A T T S A A A A A N A T A A A P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence Q L P P P L P V P V A T L P N Q A A T A A A A A T A A I L A T H Q Q Q Q Q Q Q H Q H L S N N N N N G G S T H G Q Q H T H

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence S N N N N T L P V G A Q Q Q Q Q Q Q H Q Q Q R A T L Q H P P L P N S N I K Q A S V K L I E G Y S D P K D T R N H K K V Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence H K K A K K R S T T G H K R H Q Q Q Q Q Q Q Q P H Q Q Q L Q Q Q Q Q Q T L P T P R S A Q Q Q Q Q L Q Q K L Q Q R H S T Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence N N N N G N S R K D K R N S Q Y N S D S S A P K S S D D E A D I D E E V E Q Q P L P V P Q A P V Q S A S Q P A A G L N S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence P D S I S D D L V R P L P P Q L Q R S P R K L T V A P A E H N K R Q P S P Y Y Y S D L L K S R D K D K D K D K D K D K D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence K D K D K D K D K D K D K E R D K D R E D F K L K C R Q S T A S E P P Q Q T Q T Q L G G Y R K S S S L D V P P A E E Q P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence E A E S H E E E D P R T G Q D S Q S T P K R Y S F T E E G V H I I R C E T P S T S T S E E S D C S E C L K R R E W H A R

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence A L A L V R K T C N V Q P R N Q N P T G S E L Q L Q L Q H C D A G E G E L L K C C P P P P A P A E N Q S Q V Q P M P P H

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence R L L G P A A V C G A C I T S A P A S S L A G G R G S E L G D D L E E E Y F R P R S I F Y V H P H G V H E C I E C A Q P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence A Q P A T V P A P T L S N P S L D I Y G D D E D E V D G D E D E D E E D D S E D I M G S R R R Q I Y E T A F D C K I A K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence S D D D L D E V D R I T N C S V L L Q L S N G N G G D I S K V T G S S K T R A E C K R A K N S K N Q A L Q E Q T G E A H

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence V Q V H H V E A E L G K L Q L S Q V D Q Q N Q N Q N Q S Q N Q Q H G V S A T G S G A S A S S T Q Q L P V R G Y T P S P P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence S T A P L P M K F P G K H D R Y L N M N S I R S A P N L P A A N P A H P R L R D L R L P I Q S M R H Q C G G S S N D N S

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ?
?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence L T D S A Y V N P P S T N S N S N A A S A S A S A S V S A T G S A A P R R P R S F V L E S G R V L E L R R S A Q G H Q G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence G Q S T H H H H H H H H H A P G S R R N R H G Q S Q G Q T T G G G H N Y S S T E S I A T S S S G G S M E S L R S S T S E

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence G N R S T S S S E S R H S S S L S S H S S E S G S G G S G G S G G S S V A Y P L R P A P L L L H S K L H I L S P I S D K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence S S Q E P A S A S A S E Q S Q Q P S Q Q L A P M A S Q E D D S T T S G A P A G N Q V Q V N A S L K Q P R S N R G A P N K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence A L L Q L A D E L L G S D S G I S L H S R E D G K P Q A L A L Q R L T L P K L Q L I G A E G T T T S A T A S G A G G S S

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence A T G G S S G A G G S G S G S V V A S G S T G I Q Q D L R D L P F D M P K L R R R K T L Q Q E A A C T S G S A T S V D L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . . . . . . . 1230 . . . . . . . . . 1240 . . . . . . . . . 1250 . . . . . . . . . 1260

Sequence G E L P F D M P K L R R R L R A N Q A E I N N L L M H S T E S S G I S Q A S S S H S M R D D Q K M S S K L D T A L F R Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ?
? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1270 . . . . . . . . . 1280 . . . . . . . . . 1290 . . . . . . . . . 1300 . . . . . . . . . 1310 . . . . . . . . . 1320

Sequence N L T L N L N E S R Q A T K Q F G S L D L R G L N S N K E L N M N L S Q G Y V T A V D L I D V T I P L E R Q G W Y H G A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1330 . . . . . . . . . 1340 . . . . . . . . . 1350 . . . . . . . . . 1360 . . . . . . . . . 1370 . . . . . . . . . 1380

Sequence I T R I E A E T T L R P L S E G S F L V R N C E S T K Q D Y S L S L K G A K G F M H M R I Q R N E T G Q Y I L G Q F S R

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1390 . . . . . . . . . 1400 . . . . . . . . . 1410 . . . . . .

Sequence P F E T V P E M I R H F C L N R L P V R G A E H M C L I E P V I A Q L L

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ?
? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand