Phyre 2 Results for O13736

Email	l.a.kelley@imperial.ac.uk
Description	O13736
Date	Sun Jul 8 11:46:01 BST 2012
Unique Job ID	df41d93244967786

Secondary structure and disorder prediction

1 . . . . . . . . 10 . . . . . . . . . 20 . . . . . . . . . 30 . . . . . . . . . 40 . . . . . . . . . 50 . . . . . . . . . 60

Sequence M A N L P I I G I Y K V L Y S Y E P Q E I N P G E E I P E N E R E I S I V E D E I V C L L E K G E D D W Y L V K R N V N

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 70 . . . . . . . . . 80 . . . . . . . . . 90 . . . . . . . . . 100 . . . . . . . . . 110 . . . . . . . . . 120

Sequence S N D D D E E I G I V P S N Y I T E A E P S T K M K A L Y D Y T Q Q S V D E I S F Q A D Q T L D C Y G D T D S D W I L V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ?
?
?
? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 130 . . . . . . . . . 140 . . . . . . . . . 150 . . . . . . . . . 160 . . . . . . . . . 170 . . . . . . . . . 180

Sequence G F N N N F G L A P R N Y V E G M D A S S A P A S Q E P S A S G V N A P T V S A P N S M V S P P P S F Q P P S A A A P A

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 190 . . . . . . . . . 200 . . . . . . . . . 210 . . . . . . . . . 220 . . . . . . . . . 230 . . . . . . . . . 240

Sequence T S L P S D Y N P P P P P P P P P A V E D Q A A D A N E P D D Y Y S S G R A V S P E I P P T Y T P K Q A D P L P A P P P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 250 . . . . . . . . . 260 . . . . . . . . . 270 . . . . . . . . . 280 . . . . . . . . . 290 . . . . . . . . . 300

Sequence P P P P T L P P Q S T N T S Q L P M P S R N V N N L G S Q V N I P P P P A T P S Q P P R P P T N A S T R S T G T S S S M

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 310 . . . . . . . . . 320 . . . . . . . . . 330 . . . . . . . . . 340 . . . . . . . . . 350 . . . . . . . . . 360

Sequence A H S Y D S P P S P S S P S D A Y G D P N Q H L K L R T D S H D D S R A Y D S S S S M G N P A Y E K W E V R E V V G K K

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?
? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 370 . . . . . . . . . 380 . . . . . . . . . 390 . . . . . . . . . 400 . . . . . . . . . 410 . . . . . . . . . 420

Sequence K K R T G I L A I N N K S I V L T F T K T M D A A Q V W P V T D L V N Y S S E R K H V F I E F N S D S G I T S L H L H A

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ?
? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 430 . . . . . . . . . 440 . . . . . . . . . 450 . . . . . . . . . 460 . . . . . . . . . 470 . . . . . . . . . 480

Sequence S S N T N A D N I I R A L G D V A G S A R A A G L R E I A A A S G S P M P K L P S D S A L H R L N A A S D A A G V N G G

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 490 . . . . . . . . . 500 . . . . . . . . . 510 . . . . . . . . . 520 . . . . . . . . . 530 . . . . . . . . . 540

Sequence R T G D Y E M S T V Y G D R S A R A E D H K P K D S S A G Q K M G T V L Y D F I A E A A D E L T V K A N M R V V I V N D

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?
?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 550 . . . . . . . . . 560 . . . . . . . . . 570 . . . . . . . . . 580 . . . . . . . . . 590 . . . . . . . . . 600

Sequence T A S S D W W K C S V D G K E G V V P S N F I K P D T E G D A K S P P S S S K S G Q G S S L S R R A S K H E S K H K R D

Secondary structure

SS confidence

Disorder
?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 610 . . . . . . . . . 620 . . . . . . . . . 630 . . . . . . . . . 640 . . . . . . . . . 650 . . . . . . . . . 660

Sequence S K H E A R P E S K H E S H R E S K S A E K D K K D K K D K K E D S K R S R S H S V S K P D S S K L R T W T D R T G A F

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ?
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 670 . . . . . . . . . 680 . . . . . . . . . 690 . . . . . . . . . 700 . . . . . . . . . 710 . . . . . . . . . 720

Sequence K V E A E F L G Y S D D K I H L H K T N G V K I S V P S A K M S Y K D L D Y V E L M T G K K V Y S R T E R K K D T Q K Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 730 . . . . . . . . . 740 . . . . . . . . . 750 . . . . . . . . . 760 . . . . . . . . . 770 . . . . . . . . . 780

Sequence S H D H G H S H S K S H D R E K E K E K K K D R E H R K H R E T E E E D E G P P P Q P A R P E S T R P A L A P P S S S H

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 790 . . . . . . . . . 800 . . . . . . . . . 810 . . . . . . . . . 820 . . . . . . . . . 830 . . . . . . . . . 840

Sequence S N D K Y D V I Q E R P K I S Y D W F D F F L R C G V D F T V C N R Y T H N F N N E H L D E A C I P S L N P D T L R T L

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 850 . . . . . . . . . 860 . . . . . . . . . 870 . . . . . . . . . 880 . . . . . . . . . 890 . . . . . . . . . 900

Sequence G L K E G D I I R V M N H V N E L N G V S T K P A S A I T P E T K S T V N Q I M S G G E A L A A P V A V P A P I P A P V

Secondary structure

SS confidence

Disorder
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 910 . . . . . . . . . 920 . . . . . . . . . 930 . . . . . . . . . 940 . . . . . . . . . 950 . . . . . . . . . 960

Sequence A E P A P P A A P A K E V V E K A P S P P A T R P K S T T P Q K F D D D A W A N K P V T E P P V R A S S V T V E P A R V

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 970 . . . . . . . . . 980 . . . . . . . . . 990 . . . . . . . . . 1000 . . . . . . . . . 1010 . . . . . . . . . 1020

Sequence T E S M N K M N I S E E A K K P E A P S R P R T A P I P E P E E Q K K A P V E K K D A E K S V Q A P I P A Q P T G N I T

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1030 . . . . . . . . . 1040 . . . . . . . . . 1050 . . . . . . . . . 1060 . . . . . . . . . 1070 . . . . . . . . . 1080

Sequence I Q N A Y F T A P Q P M A A D P F Q S P L Y V Q P T G F Q P P P S A L P I Q P T G Y M Q P I P V Q A T G Y Q P L M V Q P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1090 . . . . . . . . . 1100 . . . . . . . . . 1110 . . . . . . . . . 1120 . . . . . . . . . 1130 . . . . . . . . . 1140

Sequence T G L Q P H M T G V M P Q V T G V M P Q M T G V V P Q M T G V M P Q M T G V Q V Q K T G A M P Q Q P V N Y G Y Q V A G M

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1150 . . . . . . . . . 1160 . . . . . . . . . 1170 . . . . . . . . . 1180 . . . . . . . . . 1190 . . . . . . . . . 1200

Sequence Q P Q A T G I I S Q P T G I R A Q A T G I M T Q P T G L H T Q A T G M M Q P T G M Q P Q A T G I M P Q A T G M M Q P T G

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1210 . . . . . . . . . 1220 . . . . . . . . . 1230 . . . . . . . . . 1240 . . . . . . . . . 1250 . . . . . . . . . 1260

Sequence M Q P Q V T G I M P Q S M P M Q P Q M T G V Q V Q K T G M V A Q P M L S Q Y T G Y Q Q N Y T P T A M P A A D G Y G M Q P

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1270 . . . . . . . . . 1280 . . . . . . . . . 1290 . . . . . . . . . 1300 . . . . . . . . . 1310 . . . . . . . . . 1320

Sequence S M N D T Q A Y Y N M N A Q T P V N Y G F A G G Q D T S F G Y E Q Q Q M Y S P M Q Q Q Q Q Q Y Y G T E M Q P D M G Y Q Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1330 . . . . . . . . . 1340 . . . . . . . . . 1350 . . . . . . . . . 1360 . . . . . . . . . 1370 . . . . . . . . . 1380

Sequence P M M S N Y Y D P M Q M Q Q Q T P Y G Y N Q T G M E G Y S E Y G Y A Q P A G N M A N P M S Y D P V S N A S L Y M P S D Y

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

. . . . . . . . . 1390 . . . . . . . . . 1400 . . . . . . . . . 1410 . . . . . . . . . 1420

Sequence N Q Q T Q P A N Y Y D S S F G G A Q G A N E A G K K A S I Y Q A T P D N P F G F

Secondary structure

SS confidence

Disorder ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9) Low (0)

? Disordered

Alpha helix

Beta strand