Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q09746 Date Sun Jul 8 11:56:56 BST 2012 Unique Job ID b0e8ecbef6aa74c1

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	L	E	T	Y	K	F	S	D	E	L	H	D	D	F	K	V	V	D	S	W	I	N	N	G	A	K	W	L	E	D	I	Q	L	Y	Y	K	E	R	S	S	I	E	K	E	Y	A	Q	K	L	A	S	L	S	N	K	Y	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	K	S	R	K	S	S	A	L	S	V	G	D	T	P	A	M	S	A	G	S	L	E	C	A	S	L	T	T	W	S	K	I	L	D	E	L	T	R	S	S	K	T	H	Q	K	L	S	D	D	Y	S	L	D	I	A	E	K	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	L	E	S	H	I	E	A	L	R	K	V	Y	D	D	L	Y	K	K	F	S	S	E	K	E	T	L	L	N	S	V	K	R	A	K	V	S	Y	H	E	A	C	D	D	L	E	S	A	R	Q	K	N	D	K	Y	R	E	Q	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Q	R	N	L	K	L	S	E	S	D	M	L	D	K	K	N	K	Y	L	L	R	M	L	V	Y	N	A	H	K	Q	K	F	Y	N	E	T	L	P	T	L	L	N	H	M	Q	V	L	N	E	Y	R	V	S	N	L	N	E	I	W	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	S	F	S	I	E	K	S	L	H	D	T	L	S	Q	R	T	V	E	I	Q	S	E	I	A	K	N	E	P	V	L	D	S	A	M	F	G	R	H	N	S	K	N	W	A	L	P	A	D	L	H	F	E	P	S	P	I	W	H	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	D	A	L	V	V	D	G	S	C	K	N	Y	L	R	N	L	L	V	H	S	K	N	D	L	G	K	Q	K	G	E	L	V	S	L	D	S	Q	L	E	G	L	R	V	D	D	P	N	S	A	N	Q	S	F	E	S	K	K	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																				?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	N	L	E	G	K	E	L	M	V	K	A	R	I	E	D	L	E	V	R	I	N	K	I	T	S	V	A	N	N	L	E	E	G	G	R	F	H	D	F	K	H	V	S	F	K	L	P	T	S	C	S	Y	C	R	E	I	I	W	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	S	K	R	G	C	V	C	K	N	C	G	F	K	C	H	A	R	C	E	L	L	V	P	A	N	C	K	N	G	E	P	E	V	A	D	D	D	A	V	D	T	S	V	T	A	T	D	D	F	D	A	S	A	S	S	S	N	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	S	Y	R	N	T	Y	T	D	D	M	D	S	S	S	I	Y	Q	T	S	L	S	N	V	K	T	E	E	T	T	P	A	E	P	A	S	K	V	D	G	V	V	L	Y	D	F	T	G	E	H	E	G	V	I	T	A	S	E	G	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?			?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?			?		?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	F	T	L	L	E	P	D	D	G	S	G	W	V	R	V	K	I	D	G	T	D	G	L	I	P	A	S	Y	V	K	L	N	D	E	L	N	T	S	V	T	L	D	G	D	S	S	Y	V	K	A	L	Y	A	Y	T	A	Q	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?		?						?	?	?	?		?			?		?	?	?	?	?	?	?		?	?																			?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.
Sequence		M	E	L	S	I	Q	E	G	D	I	I	Q	V	T	N	R	N	A	G	N	G	W	S	E	G	I	L	N	G	V	T	G	Q	F	P	A	N	Y	V	T	D	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																								?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand