Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description O13527 Date Mon Jul 2 19:10:08 BST 2012 Unique Job ID d56b1bd2d8233ff8

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	T	F	T	G	Y	L	K	S	T	C	F	H	Q	I	S	P	Y	P	P	S	I	M	S	I	Q	V	K	V	H	A	N	I	L	I	L	S	F	I	E	C	L	R	M	P	M	H	R	Q	I	R	Y	S	L	K	N	N	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?			?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		T	Y	F	N	E	S	D	V	D	W	S	S	A	I	D	Y	Q	C	P	D	C	L	I	G	K	S	T	K	H	R	H	I	K	G	S	R	L	K	Y	Q	N	S	Y	E	P	F	Q	Y	L	H	T	D	I	F	G	P	V	H	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	K	S	A	P	S	Y	F	I	S	F	T	D	E	T	T	K	L	R	W	V	Y	P	L	H	D	R	R	E	D	S	I	L	D	V	F	T	T	I	L	A	F	I	K	N	Q	F	Q	A	S	V	L	V	I	Q	M	D	R	G	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	Y	T	N	R	T	L	H	K	F	L	E	K	N	G	I	T	P	C	Y	T	T	T	A	D	S	R	A	H	G	V	A	E	R	L	N	R	T	L	L	D	D	C	R	T	Q	L	Q	C	S	G	L	P	N	H	L	W	F	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	E	F	S	T	I	V	R	N	S	L	A	S	P	K	S	K	K	S	A	R	Q	H	A	G	L	A	G	L	D	I	S	T	L	L	P	F	G	Q	P	V	I	V	N	D	H	N	P	N	S	K	I	H	P	R	G	I	P	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?										?																				?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	L	H	P	S	R	N	S	Y	G	Y	I	I	Y	L	P	S	L	K	K	T	V	D	T	T	N	Y	V	I	L	Q	G	K	E	S	R	L	D	Q	F	N	Y	D	A	L	T	F	D	E	D	L	N	R	L	T	A	S	Y	H	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	I	A	S	N	E	I	Q	E	S	N	D	L	N	I	E	S	D	H	D	F	Q	S	D	I	E	L	H	P	E	Q	P	R	N	V	L	S	K	A	V	S	P	T	D	S	T	P	P	S	T	H	T	E	D	S	K	R	V	S	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	N	I	R	A	P	R	E	V	D	P	N	I	S	E	S	N	I	L	P	S	K	K	R	S	S	T	P	Q	I	S	N	I	E	S	T	G	S	G	G	M	H	K	L	N	V	P	L	L	A	P	M	S	Q	S	N	T	H	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	H	A	S	K	S	K	D	F	R	H	S	D	S	Y	S	E	N	E	T	N	H	T	N	V	P	I	S	S	T	G	G	T	N	N	K	T	V	P	Q	I	S	D	Q	E	T	E	K	R	I	I	H	R	S	P	S	I	D	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?		?		?				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	P	E	N	N	S	S	H	N	I	V	P	I	K	T	P	T	T	V	S	E	Q	N	T	E	E	S	I	I	A	D	L	P	L	P	D	L	P	P	E	S	P	T	E	F	P	D	P	F	K	E	L	P	P	I	N	S	H	Q	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		N	S	S	L	G	G	I	G	D	S	N	A	Y	T	T	I	N	S	K	K	R	S	L	E	D	N	E	T	E	I	K	V	S	R	D	T	W	N	T	K	N	M	R	S	L	E	P	P	R	S	K	K	R	I	H	L	I	A	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		K	A	V	K	S	I	K	P	I	R	T	T	L	R	Y	D	E	A	I	T	Y	N	K	D	I	K	E	K	E	K	Y	I	E	A	Y	H	K	E	V	N	Q	L	L	K	M	N	T	W	D	T	D	K	Y	Y	D	R	K	E	I	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?	?		?										?		?	?	?	?	?																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		P	K	R	V	I	N	S	M	F	I	F	N	K	K	R	D	G	T	H	K	A	R	F	V	A	R	G	D	I	Q	H	P	D	T	Y	D	T	G	M	Q	S	N	T	V	H	H	Y	A	L	M	T	S	L	S	L	A	L	D	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		Y	Y	I	T	Q	L	D	I	S	S	A	Y	L	Y	A	D	I	K	E	E	L	Y	I	R	P	P	P	H	L	G	M	N	D	K	L	I	R	L	K	K	S	L	Y	G	L	K	Q	S	G	A	N	W	Y	E	T	I	K	S	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		I	K	Q	C	G	M	E	E	V	R	G	W	S	C	V	F	K	N	S	Q	V	T	I	C	L	F	V	D	D	M	I	L	F	S	K	D	L	N	A	N	K	K	I	I	T	T	L	K	K	Q	Y	D	T	K	I	I	N	L	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		S	D	N	E	I	Q	Y	D	I	L	G	L	E	I	K	Y	Q	R	G	K	Y	M	K	L	G	M	E	K	S	L	T	E	K	L	P	K	L	N	V	P	L	N	P	K	G	K	K	L	R	A	P	G	Q	P	G	L	Y	I	D	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?																																			?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		D	E	L	E	I	D	E	D	E	Y	K	E	K	V	H	E	M	Q	K	L	I	G	L	A	S	Y	V	G	Y	K	F	R	F	D	L	L	Y	Y	I	N	T	L	A	Q	H	I	L	F	P	S	R	Q	V	L	D	M	T	Y	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		I	Q	F	M	W	D	T	R	D	K	Q	L	I	W	H	K	N	K	P	T	E	P	D	N	K	L	V	A	I	S	D	A	S	Y	G	N	Q	P	Y	Y	K	S	Q	I	G	N	I	Y	L	L	N	G	K	V	I	G	G	K	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		K	A	S	L	T	C	T	S	T	T	E	A	E	I	H	A	I	S	E	S	V	P	L	L	N	N	L	S	Y	L	I	Q	E	L	N	K	K	P	I	I	K	G	L	L	T	D	S	R	S	T	I	S	I	I	K	S	T	N	E	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																												?		?		?																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.
Sequence		K	F	R	N	R	F	F	G	T	K	A	M	R	L	R	D	E	V	S	G	N	N	L	Y	V	Y	Y	I	E	T	K	K	N	I	A	D	V	M	T	K	P	L	P	I	K	T	F	K	L	L	T	N	K	W	I	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																						?
Disorder confidence