Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description O13535 Date Mon Jul 2 19:10:10 BST 2012 Unique Job ID b73bcf582ec0214e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	S	Q	Q	L	S	N	Y	P	H	I	S	H	G	S	A	C	A	S	V	T	S	K	E	V	H	T	N	Q	D	P	L	D	V	S	A	S	K	I	Q	E	Y	D	K	A	S	T	K	A	N	S	Q	Q	T	T	T	P	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?							?	?		?			?		?	?	?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	A	V	P	E	N	L	H	H	A	S	P	Q	P	A	S	V	P	P	P	Q	N	G	P	Y	P	Q	Q	C	M	M	T	Q	N	Q	A	N	P	S	G	W	S	F	Y	G	H	P	S	M	I	P	Y	T	P	Y	Q	M	S	P	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Y	F	P	P	G	P	Q	S	Q	F	P	Q	Y	P	S	S	V	G	T	P	L	S	T	P	S	P	E	S	G	N	T	F	T	D	S	S	S	A	D	S	D	M	T	S	T	K	K	Y	V	R	P	P	P	M	L	T	S	P	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	P	N	W	V	K	T	Y	I	K	F	L	Q	N	S	N	L	G	G	I	I	P	T	V	N	G	K	P	V	P	P	M	L	T	S	P	N	D	F	P	N	W	V	K	T	Y	I	K	F	L	Q	N	S	N	L	G	G	I	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	V	N	G	K	P	V	R	Q	I	T	D	D	E	L	T	F	L	Y	N	T	F	Q	I	F	A	P	S	Q	F	L	P	T	W	V	K	D	I	L	S	V	D	Y	T	D	I	M	K	I	L	S	K	S	I	E	K	M	Q	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	Q	E	A	N	D	I	V	T	L	A	N	L	Q	Y	N	G	S	T	P	A	D	A	F	E	T	K	V	T	N	I	I	D	R	L	N	N	N	G	I	H	I	N	N	K	V	A	C	Q	L	I	M	R	G	L	S	G	E	Y	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	L	R	Y	T	R	H	R	H	L	N	M	T	V	A	E	L	F	L	D	I	H	A	I	Y	E	E	Q	Q	G	S	R	N	S	K	P	N	Y	R	R	N	P	S	D	E	K	N	D	S	R	S	Y	T	N	T	T	K	P	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	A	R	N	P	Q	K	T	N	N	S	K	S	K	T	A	R	A	H	N	V	S	T	S	N	N	S	P	S	T	D	N	D	S	I	S	K	S	T	T	E	P	I	Q	L	N	N	K	H	D	L	H	L	G	Q	K	L	T	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		T	V	N	H	T	N	H	S	D	D	E	L	P	G	H	L	L	L	D	S	G	A	S	R	T	L	I	R	S	A	H	H	I	H	S	A	S	S	N	P	D	I	N	V	V	D	A	Q	K	R	N	I	P	I	N	A	I	G	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?	?	?	?																																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		Q	F	H	F	Q	D	N	T	K	T	S	I	K	V	L	H	T	P	N	I	A	Y	D	L	L	S	L	N	E	L	A	A	V	D	I	T	A	C	F	T	K	N	V	L	E	R	S	D	G	T	V	L	A	P	I	V	K	Y	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		F	Y	W	V	S	K	K	Y	L	L	P	S	N	I	S	V	P	T	I	N	N	V	H	T	S	E	S	T	R	K	Y	P	Y	P	F	I	H	R	M	L	A	H	A	N	A	Q	T	I	R	Y	S	L	K	N	N	T	I	T	Y	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																									?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		N	E	S	D	V	D	W	S	S	A	I	D	Y	Q	C	P	D	C	L	I	G	K	S	T	K	H	R	H	I	K	G	S	R	L	K	Y	Q	N	S	Y	E	P	F	Q	Y	L	H	T	D	I	F	G	P	V	H	N	L	P	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		A	P	S	Y	F	I	S	F	T	D	E	T	T	K	F	R	W	V	Y	P	L	H	D	R	R	E	D	S	I	L	D	V	F	T	T	I	L	A	F	I	K	N	Q	F	Q	A	S	V	L	V	I	Q	M	D	R	G	S	E	Y	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		N	R	T	L	H	K	F	L	E	K	N	G	I	T	P	C	Y	T	T	T	A	D	S	R	A	H	G	V	A	E	R	L	N	R	T	L	L	D	D	C	R	T	Q	L	Q	C	S	G	L	P	N	H	L	W	F	S	A	I	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		S	T	I	V	R	N	S	L	A	S	P	K	S	K	K	S	A	R	Q	H	A	G	L	A	G	L	D	I	S	T	L	L	P	F	G	Q	P	V	I	V	N	D	H	N	P	N	S	K	I	H	P	R	G	I	P	G	Y	A	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?									?					?															?		?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		P	S	R	N	S	Y	G	Y	I	I	Y	L	P	S	L	K	K	T	V	D	T	T	N	Y	V	I	L	Q	G	K	E	S	R	L	D	Q	F	N	Y	D	A	L	T	F	D	E	D	L	N	R	L	T	A	S	Y	H	S	F	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		S	N	E	I	Q	Q	S	N	D	L	N	I	E	S	D	H	D	F	Q	S	D	I	E	L	H	P	E	Q	L	R	N	V	L	S	K	A	V	S	P	T	D	S	T	P	P	S	T	H	T	E	D	S	K	R	V	S	K	T	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		R	A	P	R	E	V	D	P	N	I	S	E	S	N	I	L	P	S	K	K	R	S	S	T	P	Q	I	S	D	I	E	S	T	G	S	G	G	M	H	R	L	D	V	P	L	L	A	P	M	S	Q	S	N	T	H	E	S	S	H	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?		?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		S	K	S	K	D	F	R	H	S	D	S	Y	S	D	N	E	T	N	H	T	N	V	P	I	S	S	T	G	G	T	N	N	K	T	V	P	Q	T	S	E	Q	E	T	E	K	R	I	I	H	R	S	P	S	I	D	T	S	S	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?				?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		S	N	S	L	H	H	V	V	P	I	K	T	S	D	T	C	P	K	E	N	T	E	E	S	I	I	A	D	L	P	L	P	D	L	P	P	E	P	P	T	E	L	S	D	S	F	K	E	L	P	P	I	N	S	H	Q	T	N	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		L	G	G	I	G	D	S	N	A	Y	T	T	I	N	S	K	K	R	S	L	E	D	N	E	T	E	I	K	V	S	R	D	T	W	N	T	K	N	M	R	S	L	E	P	P	R	S	K	K	R	I	H	L	I	A	A	V	K	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		K	S	I	K	P	I	R	T	T	L	R	Y	D	E	A	I	T	Y	N	K	D	I	K	E	K	E	K	Y	I	Q	A	Y	H	K	E	V	N	Q	L	L	M	M	K	T	W	D	T	D	R	Y	Y	D	R	K	E	I	D	P	K	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?										?	?	?	?	?	?	?																			?							?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence		V	I	N	S	M	F	I	F	N	R	K	R	D	G	T	H	K	A	R	F	V	A	R	G	D	I	Q	H	P	D	T	Y	D	P	G	M	Q	S	N	T	V	H	H	Y	A	L	M	T	S	L	S	L	A	L	D	N	N	Y	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence		T	Q	L	D	I	S	S	A	Y	L	Y	A	D	I	K	E	E	L	Y	I	R	P	P	P	H	L	G	M	N	D	K	L	I	R	L	K	K	S	L	Y	G	L	K	Q	S	G	A	N	W	Y	E	T	I	K	S	Y	L	I	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1500
Sequence		C	G	M	E	E	V	R	G	W	S	C	V	F	K	N	S	Q	V	T	I	C	L	F	V	D	D	M	I	L	F	S	K	D	L	N	A	N	K	K	I	I	T	T	L	K	K	Q	Y	D	T	K	I	I	N	L	G	E	S	D	N
Secondary structure
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Sequence		E	I	Q	Y	D	I	L	G	L	E	I	K	Y	Q	R	G	K	Y	M	K	L	G	M	E	N	S	L	T	E	K	I	P	K	L	N	V	P	L	N	P	K	G	R	K	L	S	A	P	G	Q	P	G	L	Y	I	D	Q	D	E	L
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Sequence		E	I	D	E	D	E	Y	K	E	K	V	H	E	M	Q	K	L	I	G	L	A	S	Y	V	G	Y	K	F	R	F	D	L	L	Y	Y	I	N	T	L	A	Q	H	I	L	F	P	S	R	Q	V	L	D	M	T	Y	E	L	I	Q	F
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Sequence		M	W	D	T	R	D	K	Q	L	I	W	H	K	N	K	P	T	E	P	D	N	K	L	V	A	I	S	D	A	S	Y	G	N	Q	P	Y	Y	K	S	Q	I	G	N	I	Y	L	L	N	G	K	V	I	G	G	K	S	T	K	A	S
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Sequence		L	T	C	T	S	T	T	E	A	E	I	H	A	I	S	E	S	V	P	L	L	N	N	L	S	H	L	V	Q	E	L	N	K	K	P	I	T	K	G	L	L	T	D	S	K	S	T	I	S	I	I	I	S	N	N	E	E	K	F	R
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Sequence		N	R	F	F	G	T	K	A	M	R	L	R	D	E	V	S	G	N	H	L	H	V	C	Y	I	E	T	K	K	N	I	A	D	V	M	T	K	P	L	P	I	K	T	F	K	L	L	T	N	K	W	I	H
Secondary structure
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