![]() |
| ||||||||||||||||||||||||
|   | Insertion relative to template |
|   | Deletion relative to template |
|   | Catalytic residue from the CSA |
|   | |
| Detailed help on interpreting your alignment | |
|   |   | 476 | . | . | . | 480 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 490 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 500 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 510 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 520 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 530 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 540 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 550 | . | . | . | . | . |
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | L | P | S | R | N | S | I | P | A | P | K | Q | E | E | A | P | E | Q | A | P | E | E | E | I | E | E | E | A | E | E | A | A | P | Q | L | P | S | R | S | S | A | A | P | P | P | P | P | R | R | A | T | P | E | K | K | P | K | E | N | P | W | A | T | A | E | Y | D | Y | D | A | A | E | D | N | E | L | T | F | V | E |
| Template Sequence |   | L | V | R | S | S | P | H | G | K | H | G | N | R | N | S | N | S | Y | G | I | P | E | P | A | H | A | Y | A | Q | P | Q | T | T | T | P | L | P | A | V | S | G | S | P | G | A | A | I | T | P | L | P | S | T | Q | N | G | P | V | F | A | K | A | I | Q | K | R | V | P | C | A | Y | D | K | T | A | L | A | L | E | V |
| Template Known Secondary structure |   | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | B | T | T | S | S | B | B | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 181 | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 |
|   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 556 | . | . | . | 560 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 570 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 580 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 590 | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Query Sequence |   | N | D | K | I | I | N | I | E | F | V | D | D | D | W | W | L | G | E | L | E | K | D | G | S | K | G | L | F | P | S | N | Y | V | S | L | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Sequence |   | G | D | I | V | K | V | T | R | M | N | I | N | G | Q | W | E | G | E | V | N | . | . | G | R | K | G | L | F | P | F | T | H | V | K | I | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Known Secondary structure |   | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | S | . | . | S | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Template Predicted Secondary structure |   | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | . | . | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |   | 261 | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|   |
| Download: | Text version | FASTA pairwise alignment | 3D Model in PDB format |
Phyre is for academic use only
| Please cite: Protein structure prediction on the web: a case study using the Phyre server | ||||||||
| Kelley LA and Sternberg MJE. Nature Protocols 4, 363 - 371 (2009) [pdf] [Import into BibTeX] | ||||||||
|   | ||||||||
|
| |||||||