Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description O13329 Date Mon Jul 2 19:10:05 BST 2012 Unique Job ID 938146df6a231f86

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	K	P	R	Y	N	D	V	L	F	D	D	D	D	S	V	P	S	E	S	V	T	R	K	S	Q	R	R	K	A	T	S	P	G	E	S	R	E	S	S	K	D	R	L	L	I	L	P	S	M	G	E	S	Y	T	E	Y	V	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?		?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	Y	L	N	L	E	L	L	E	R	G	E	R	E	T	P	I	F	L	E	S	L	T	R	Q	L	T	Q	K	I	Y	E	L	I	K	T	K	S	L	T	A	D	T	L	Q	Q	I	S	D	K	Y	D	G	V	V	A	E	N	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?							?	?																?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	F	L	Q	R	Q	Y	Y	V	D	D	E	G	N	V	R	D	G	R	N	N	D	K	I	Y	C	E	P	K	H	V	Y	D	M	V	M	A	T	H	L	M	N	K	H	L	R	G	K	T	L	H	S	F	L	F	S	H	F	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		I	S	H	A	I	I	D	W	V	Q	Q	F	C	S	K	C	N	K	K	G	K	I	K	P	L	K	E	Y	K	R	P	D	M	Y	D	K	L	L	P	M	E	R	I	H	I	E	V	F	E	P	F	N	G	E	A	I	E	G	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	Y	V	L	L	C	R	D	Y	R	S	S	F	M	W	L	L	P	L	K	S	T	K	F	K	H	L	I	P	V	V	S	S	L	F	L	T	F	A	R	V	P	I	F	V	T	S	S	T	L	D	K	D	D	L	Y	D	I	C	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?							?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	I	A	S	K	Y	G	L	R	I	G	L	G	L	K	S	S	A	R	F	H	T	G	G	I	L	C	I	Q	Y	A	L	N	S	Y	K	K	E	C	L	A	D	W	G	K	C	L	R	Y	G	P	Y	R	F	N	R	R	R	N	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	T	K	R	K	P	V	Q	V	L	L	S	E	V	P	G	H	N	A	K	F	E	T	K	R	E	R	V	I	E	N	T	Y	S	R	N	M	F	K	M	A	G	G	K	G	L	I	Y	L	E	D	V	N	T	F	A	L	A	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?					?			?	?													?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	D	N	S	C	N	N	N	G	I	L	H	N	N	N	I	G	N	D	N	F	E	E	E	V	Q	K	Q	F	D	L	T	E	K	N	Y	I	D	E	Y	D	D	L	A	H	D	S	S	E	G	E	F	E	P	N	T	L	T	P	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?									?		?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	K	P	P	H	N	V	D	E	D	R	I	E	S	T	G	V	A	A	P	M	Q	G	T	E	E	P	E	K	G	D	Q	K	E	S	D	G	A	S	Q	V	D	Q	S	V	E	I	T	R	P	E	T	S	Y	Y	Q	T	L	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?			?						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	S	T	K	R	Q	K	L	D	Q	Q	G	N	G	D	Q	T	R	D	F	G	T	S	M	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand