Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description D6W196 Date Mon Jul 2 19:10:02 BST 2012 Unique Job ID 849b39711f9bb1ae

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	L	K	N	C	E	T	D	K	Q	R	D	I	R	Y	A	C	L	F	K	E	L	D	V	K	G	N	G	Q	V	T	L	D	N	L	I	S	A	F	E	K	N	D	H	P	L	K	G	N	D	E	A	I	K	M	L	F	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																?		?	?	?	?													?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		M	D	V	N	K	D	S	V	V	D	L	S	D	F	K	K	Y	A	S	N	A	E	S	Q	I	W	N	G	F	Q	R	I	D	L	D	H	D	G	K	I	G	I	N	E	I	N	R	Y	L	S	D	L	D	N	Q	S	I	C	N	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?	?																										?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	L	N	H	E	L	S	N	E	K	V	N	K	F	S	R	F	F	E	W	A	F	P	K	R	K	A	N	I	A	L	R	G	Q	A	S	H	K	K	N	T	D	N	D	R	S	K	K	T	T	D	S	D	L	Y	V	T	Y	D	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		W	R	D	F	L	L	L	V	P	R	K	Q	G	S	R	L	H	T	A	Y	S	Y	F	Y	L	F	N	E	D	V	D	L	S	S	E	G	D	V	T	L	I	N	D	F	I	R	G	F	G	F	F	I	A	G	G	I	S	G	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?														?		?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	R	T	C	T	A	P	F	D	R	L	K	V	F	L	I	A	R	T	D	L	S	S	I	L	L	N	S	K	T	D	L	L	A	K	N	P	N	A	D	I	N	K	I	S	S	P	L	A	K	A	V	K	S	L	Y	R	Q	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	K	A	F	Y	V	G	N	G	L	N	V	I	K	V	F	P	E	S	S	I	K	F	G	S	F	E	V	T	K	K	I	M	T	K	L	E	G	C	R	D	T	K	D	L	S	K	F	S	T	Y	I	A	G	G	L	A	G	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	Q	F	S	V	Y	P	I	D	T	L	K	F	R	V	Q	C	A	P	L	D	T	K	L	K	G	N	N	L	L	F	Q	T	A	K	D	M	F	R	E	G	G	G	Q	I	I	L	Q	R	C	H	S	R	Y	S	G	H	I	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		C	C	I	R	F	G	D	F	F	C	L	K	K	M	V	Y	C	Q	T	G	K	D	P	E	P	T	T	R	S	G	H	S	K	Q	P	G	C	T	S	N	G	C	I	Q	W	N	C	R	S	F	C	C	L	S	N	Q	S	F	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.
Sequence		K	T	T	S	P	R	N	I	C	T	S	L	C	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand