Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P38753 Date Mon Jul 2 19:20:20 BST 2012 Unique Job ID 574dcf2a2f45462e

Secondary structure and disorder prediction

1

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10

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20

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30

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40

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50

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60

Sequence

M

S

S

S

A

I

K

I

R

N

A

L

L

K

A

T

D

P

K

L

R

S

D

N

W

Q

Y

I

L

D

V

C

D

L

V

K

E

D

P

E

D

N

G

Q

E

V

M

S

L

I

E

K

R

L

E

Q

Q

D

A

N

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

Disorder confidence

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70

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80

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90

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100

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110

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120

Sequence

V

I

L

R

T

L

S

L

T

V

S

L

A

E

N

C

G

S

R

L

R

Q

E

I

S

S

K

N

F

T

S

L

L

Y

A

L

I

E

S

H

S

V

H

I

T

L

K

K

A

V

T

D

V

V

K

Q

L

S

D

S

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

?

?

?

Disorder confidence

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130

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140

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150

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160

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170

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180

Sequence

F

K

D

D

P

S

L

R

A

M

G

D

L

Y

D

K

I

K

R

K

A

P

Y

L

V

Q

P

N

V

P

E

K

H

N

M

S

T

Q

A

D

N

S

D

D

E

E

L

Q

K

A

L

K

M

S

L

F

E

Y

E

K

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

Disorder confidence

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190

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200

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210

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220

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230

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240

Sequence

Q

K

K

L

Q

E

Q

E

K

E

S

A

E

V

L

P

Q

Q

Q

Q

Q

H

Q

Q

Q

N

Q

A

P

A

H

K

I

P

A

Q

T

V

V

R

R

V

R

A

L

Y

D

L

T

T

N

E

P

D

E

L

S

F

R

K

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

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?

?

?

?

?

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?

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?

?

Disorder confidence

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250

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260

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270

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280

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290

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300

Sequence

G

D

V

I

T

V

L

E

Q

V

Y

R

D

W

W

K

G

A

L

R

G

N

M

G

I

F

P

L

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Y

V

T

P

I

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E

P

S

K

E

E

I

E

K

E

K

N

K

E

A

I

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F

S

Q

K

T

T

I

D

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

?

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Disorder confidence

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310

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320

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330

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340

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350

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360

Sequence

Q

L

H

N

S

L

N

A

A

S

K

T

G

N

S

N

E

V

L

Q

D

P

H

I

G

D

M

Y

G

S

V

T

P

L

R

P

Q

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T

R

M

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K

Y

A

K

E

K

E

D

M

L

S

L

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Q

V

L

A

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

?

?

?

?

?

?

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Disorder confidence

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370

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380

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390

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400

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410

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420

Sequence

N

A

E

R

S

Y

N

Q

L

M

D

R

A

A

N

A

H

I

S

P

P

V

P

G

P

A

L

Y

A

G

M

T

H

A

N

N

T

P

V

M

P

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Q

R

Q

S

Y

Q

S

N

E

Y

S

P

Y

P

S

N

L

P

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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?

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?

?

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?

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?

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Disorder confidence

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430

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440

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450

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Sequence

I

Q

H

P

T

N

S

A

N

N

T

P

Q

Y

G

Y

D

L

G

Y

S

V

V

S

Q

P

P

P

G

Y

E

Q

Secondary structure

SS confidence

Disorder

?

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?

?

?

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?

Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand