Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P36006 Date Mon Jul 2 19:17:52 BST 2012 Unique Job ID 4e076328807e4d82

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	V	I	K	K	G	A	R	R	K	D	V	K	E	P	K	K	R	S	A	K	I	K	K	A	T	F	D	A	N	K	K	K	E	V	G	I	S	D	L	T	L	L	S	K	I	S	D	E	S	I	N	E	N	L	K	K	R	F
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Disorder		?	?				?	?		?	?	?	?		?	?	?	?	?											?	?		?	?	?			?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	N	G	I	I	Y	T	Y	I	G	H	V	L	I	S	V	N	P	F	R	D	L	G	I	Y	T	N	A	V	L	E	S	Y	K	G	K	N	R	L	E	V	P	P	H	V	F	A	I	A	E	S	M	Y	Y	N	L	K	S	Y	N
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Disorder																																				?	?	?	?	?	?	?																	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	N	Q	C	V	I	I	S	G	E	S	G	A	G	K	T	E	A	A	K	R	I	M	Q	Y	I	A	A	A	S	N	S	H	S	E	S	I	G	K	I	K	D	M	V	L	A	T	N	P	L	L	E	S	F	G	C	A	K	T	L
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	N	N	N	S	S	R	H	G	K	Y	L	E	I	K	F	N	S	Q	F	E	P	C	A	G	N	I	T	N	Y	L	L	E	K	Q	R	V	V	G	Q	I	K	N	E	R	N	F	H	I	F	Y	Q	F	T	K	G	A	S	D	T
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Sequence		Y	K	Q	M	F	G	V	Q	M	P	E	Q	Y	I	Y	T	A	A	A	G	C	T	T	A	D	T	I	D	D	V	K	D	Y	E	G	T	L	E	A	M	R	T	I	G	L	V	Q	E	E	Q	D	Q	I	F	R	M	L	A	A	I
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Disorder																			?	?	?	?	?	?		?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	W	I	G	N	I	S	F	I	E	N	E	E	G	N	A	Q	V	G	D	T	S	V	T	D	F	V	A	Y	L	L	Q	V	D	A	S	L	L	V	K	C	L	V	E	R	I	M	Q	T	S	H	G	M	K	R	G	S	V	Y	H
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Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	P	L	N	P	V	Q	A	T	A	V	R	D	A	L	A	K	A	I	Y	N	N	L	F	D	W	I	V	D	R	V	N	V	S	L	Q	A	F	P	G	A	D	K	S	I	G	I	L	D	I	Y	G	F	E	I	F	E	H	N	S
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Sequence		F	E	Q	I	C	I	N	Y	V	N	E	K	L	Q	Q	I	F	I	Q	L	T	L	K	A	E	Q	E	T	Y	E	R	E	K	I	K	W	T	P	I	K	Y	F	D	N	K	V	V	C	D	L	I	E	A	K	N	P	P	G	I	L
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	A	M	N	D	S	I	A	T	A	H	A	D	S	N	A	A	D	Q	A	F	A	Q	R	L	N	L	F	N	S	N	P	Y	F	E	L	R	A	N	K	F	V	I	K	H	Y	A	G	D	V	T	Y	D	I	N	G	I	T	D	K
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		N	K	D	Q	L	Q	K	D	L	I	E	L	I	G	T	T	T	N	T	F	L	S	T	I	F	P	D	D	V	D	K	D	S	K	R	R	P	P	T	A	G	D	K	I	I	K	S	A	N	E	L	V	E	T	L	S	K	A	E	P
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Disorder																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		S	Y	I	R	T	I	K	P	N	Q	T	K	S	P	N	D	Y	D	D	H	Q	V	L	H	Q	V	K	Y	L	G	L	Q	E	N	V	R	I	R	R	A	G	F	A	Y	R	Q	T	F	E	K	F	V	E	R	F	Y	L	L	S	P
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Disorder												?		?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		D	C	S	Y	A	G	D	Y	T	W	D	G	D	T	L	E	A	V	K	L	I	L	R	D	A	M	I	P	E	K	E	F	Q	L	G	V	T	S	V	F	I	K	T	P	E	S	L	F	A	L	E	D	M	R	D	K	Y	W	Y	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		M	A	A	R	I	Q	R	A	W	R	R	F	L	Q	R	R	I	D	A	A	I	K	I	Q	R	T	I	R	E	K	K	G	G	N	K	Y	V	K	L	R	D	Y	G	T	K	L	L	A	G	K	K	E	R	R	S	M	S	L	L	G
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		Y	R	A	F	M	G	D	Y	L	S	C	N	E	S	K	T	K	G	S	Y	I	R	R	Q	V	G	I	K	D	K	V	V	F	S	I	K	G	E	C	L	H	S	K	F	G	R	S	A	Q	R	L	K	K	V	F	I	L	T	K	K
Secondary structure
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		T	F	Y	I	I	G	Q	T	R	E	Q	N	A	M	K	Y	T	Q	D	Y	K	I	D	V	G	K	I	K	Q	V	S	L	T	N	L	Q	D	D	W	M	G	V	I	L	V	N	S	T	Q	S	D	P	L	I	N	T	P	F	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?								?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?		?	?			?					?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		E	L	M	T	R	L	K	K	L	N	E	K	I	M	I	K	V	G	P	T	I	E	Y	H	K	Q	P	N	K	L	H	T	V	R	S	K	I	S	D	S	A	P	K	Y	G	D	I	Y	K	S	S	T	I	Y	V	R	R	G	H	P
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Sequence		A	N	S	K	S	N	K	K	P	K	N	P	G	G	L	S	G	K	P	I	K	S	K	K	S	K	H	K	S	T	H	K	H	T	H	S	H	R	S	H	R	D	A	A	K	K	Q	P	L	P	S	Q	K	P	V	N	P	L	S	L
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		A	A	T	A	A	Q	A	A	Y	N	P	K	P	D	K	T	V	P	I	K	S	S	A	I	P	A	A	K	V	S	S	K	H	S	S	K	P	S	S	K	E	K	V	A	V	K	K	A	S	S	S	H	K	S	S	S	A	K	Q	N
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		Q	V	S	M	P	P	S	K	G	V	E	K	N	K	E	P	L	K	E	T	T	A	T	A	T	A	N	I	P	I	P	P	P	P	P	P	M	G	Q	P	K	D	P	K	F	E	A	A	Y	D	F	P	G	S	G	S	S	S	E	L
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SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		P	L	K	K	G	D	I	V	F	I	S	R	D	E	P	S	G	W	S	L	A	K	L	L	D	G	S	K	E	G	W	V	P	T	A	Y	M	T	P	Y	K	D	T	R	N	T	V	P	V	A	A	T	G	A	V	N	D	V	T	N
Secondary structure
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Disorder		?														?	?							?	?	?	?	?	?	?										?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		Q	K	S	S	Q	I	D	N	T	I	S	S	A	Q	E	G	V	Q	F	G	S	A	T	V	G	P	T	S	D	N	Q	S	N	P	V	G	T	F	S	D	G	L	A	S	A	L	A	A	R	A	N	K	M	R	A	E	S	A	D	D
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SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.
Sequence		D	D	N	D	D	G	D	D	D	D	D	W
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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