Job Description P36006 Confidence 100.00% Date Mon Jul 2 19:17:52 BST 2012 Rank 11 Aligned Residues 713 % Identity 36% Template d1kk8a2 SCOP info P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases Motor proteins Resolution 2.30

Show / Hide SS confidence

Show / Hide Conservation and Alignment quality

		10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30						.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																							.	.	.	.	.
Query SS confidence																							.	.	.	.	.
Query Sequence		R	K	D	V	K	E	P	K	K	R	S	A	K	I	K	K	A	T	F	D	A	.	.	.	.	.	N	K	K	K	E	V	G	I	S	D	L	T	L	L	S	K	I	S	D	E	S	I	N	E	N	L	K	K	R	F	K	N	G	I	I	Y	T	Y	I	G	H	V	L	I	S	V	N	P	F	R	D	L	G	I
Query Conservation																							.	.	.	.	.
Alig confidence																							.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		N	I	D	F	S	D	P	D	F	Q	Y	L	A	V	D	R	K	K	L	M	K	T	A	A	F	M	N	P	P	K	F	E	K	L	E	D	M	A	N	M	T	Y	L	N	E	A	S	V	L	Y	N	L	R	S	R	Y	T	S	G	L	I	Y	T	Y	S	G	L	F	C	I	A	V	N	P	Y	R	R	L	P	I
Template Known Secondary structure						S		G	G	G	T	T	T				S	S	S	S										G	G	G	T	T		S	B	G	G	G	S	S			S														T	T							T	T								S	S			S	T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		2	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60	.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.
		85	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Y	T	N	A	V	L	E	S	Y	K	G	K	N	R	L	E	V	P	P	H	V	F	A	I	A	E	S	M	Y	Y	N	L	K	S	Y	N	E	N	Q	C	V	I	I	S	G	E	S	G	A	G	K	T	E	A	A	K	R	I	M	Q	Y	I	A	A	A	S	N	S	H	S	E	S	I	G	K	I	K	D	M	V
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		Y	T	D	S	V	I	A	K	Y	R	G	K	R	K	T	E	I	P	P	H	L	F	S	V	A	D	N	A	Y	Q	N	M	V	T	D	R	E	N	Q	S	C	L	I	T	G	E	S	G	A	G	K	T	E	N	T	K	K	V	I	M	Y	L	A	K	V	A	C	A	V	K	K	K	E	G	S	L	E	D	Q	I
Template Known Secondary structure		T	S								T	T			G	G	G	S																			T	S									S	T	T	S	S																S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		132	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.
		165	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	A	T	N	P	L	L	E	S	F	G	C	A	K	T	L	R	N	N	N	S	S	R	H	G	K	Y	L	E	I	K	F	N	S	Q	F	E	P	C	A	G	N	I	T	N	Y	L	L	E	K	Q	R	V	V	G	Q	I	K	N	E	R	N	F	H	I	F	Y	Q	F	T	K	G	A	S	D	T	Y	K	Q	M
Query Conservation
Alig confidence
Template Conservation
Template Sequence		I	Q	A	N	P	V	L	E	A	Y	G	N	A	K	T	T	R	N	N	N	S	S	R	F	G	K	F	I	R	I	H	F	G	P	T	G	K	I	A	G	A	D	I	E	T	Y	L	L	E	K	S	R	V	T	Y	Q	Q	S	A	E	R	N	Y	H	I	F	Y	Q	I	C	S	N	A	I	P	E	L	N	D	V
Template Known Secondary structure																	S	S		T	T			S	S										T	T	S	S													G	G	G	G	T				T	T			S	B							T	S		S	S	G	G	G
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.
		245	.	.		.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.
Predicted Secondary structure					.
Query SS confidence					.
Query Sequence		F	G	V	.	Q	M	P	E	Q	Y	I	Y	T	A	A	A	G	C	T	T	A	D	T	I	D	D	V	K	D	Y	E	G	T	L	E	A	M	R	T	I	G	L	V	Q	E	E	Q	D	Q	I	F	R	M	L	A	A	I	L	W	I	G	N	I	S	F	I	E	N	E	E	G	N	A	Q	V	G	D	T	S	V
Query Conservation					.
Alig confidence					.												.																																																							.	.	.
Template Conservation																	.																																																							.	.	.
Template Sequence		M	L	V	T	P	D	S	G	L	Y	S	F	I	N	Q	.	G	C	L	T	V	D	N	I	D	D	V	E	E	F	K	L	C	D	E	A	F	D	I	L	G	F	T	K	E	E	K	Q	S	M	F	K	C	T	A	S	I	L	H	M	G	E	M	K	F	K	Q	E	Q	A	.	.	.	E	S	D	G	T	A	E
Template Known Secondary structure			T			S		G	G	G		T	T	T		S	.	S		S		B	T	T	B																T	T																				T	T									.	.	.			S		S
Template Predicted Secondary structure																	.																																																							.	.	.
Template SS confidence
		300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.		.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.				.	370	.	.	.	.	.
		324	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		T	D	F	V	A	Y	L	L	Q	V	D	A	S	L	L	V	K	C	L	V	E	R	I	M	Q	T	S	H	G	M	K	R	G	S	V	Y	H	V	P	L	N	P	V	Q	A	T	A	V	R	D	A	L	A	K	A	I	Y	N	N	L	F	D	W	I	V	D	R	V	N	V	S	L	Q	A	F	P	G	A	D	K
Query Conservation
Alig confidence																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		A	E	K	V	A	F	L	C	G	I	N	A	G	D	L	L	K	A	L	L	K	P	K	V	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	M	V	T	K	G	Q	N	M	N	Q	V	V	N	S	V	G	A	L	A	K	S	L	Y	D	R	M	F	N	W	L	V	R	R	V	N	K	T	L	D	T	K	A	K	R	N	Y
Template Known Secondary structure										T	S											S				.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																										.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.										.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450
		404	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.		.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.
Predicted Secondary structure																																																													.
Query SS confidence																																																													.
Query Sequence		S	I	G	I	L	D	I	Y	G	F	E	I	F	E	H	N	S	F	E	Q	I	C	I	N	Y	V	N	E	K	L	Q	Q	I	F	I	Q	L	T	L	K	A	E	Q	E	T	Y	E	R	E	K	I	K	W	T	P	I	K	Y	F	.	D	N	K	V	V	C	D	L	I	E	A	K	N	P	P	G	I	L	A	A
Query Conservation																																																													.
Alig confidence																																																													.											.	.
Template Conservation																																																																								.	.
Template Sequence		Y	I	G	V	L	D	I	A	G	F	E	I	F	D	F	N	S	F	E	Q	L	C	I	N	Y	T	N	E	R	L	Q	Q	F	F	N	H	H	M	F	I	L	E	Q	E	E	Y	K	K	E	G	I	A	W	E	F	I	D	F	G	M	D	L	Q	M	C	I	D	L	I	E	.	.	K	P	M	G	I	L	S	I
Template Known Secondary structure															S	S	B																																	T	T					S																.	.	S	T	T	S
Template Predicted Secondary structure																																																																								.	.
Template SS confidence
		455	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.			.	.	.	.	.	530	.	.
		483	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.		.	.	.	510	.	.	.	.											.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Predicted Secondary structure																										.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		M	N	D	S	I	A	T	A	H	A	D	S	N	A	A	D	Q	A	F	A	Q	R	L	N	.	L	F	N	S	N	P	Y	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	E	L	R	A	N	K	F	V	I	K	H	Y	A	G	D	V	T	Y	D	I	N	G	I	T	D	K	N	K	D	Q	L	Q	K	D	L	I	E
Query Conservation																										.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence									.	.	.	.														.									.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation									.	.	.	.
Template Sequence		L	E	E	E	C	M	F	.	.	.	.	P	K	A	D	D	K	S	F	Q	D	K	L	Y	Q	N	H	M	G	K	N	R	M	F	T	K	P	G	K	P	T	R	P	N	Q	G	P	A	H	F	E	L	H	H	Y	A	G	N	V	P	Y	S	I	T	G	W	L	E	K	N	K	D	P	I	N	E	N	V	V	A
Template Known Secondary structure						T	T		.	.	.	.	T	T															T	T	T		S	S						S		S	S	T	T					S						T	T								S	S						S
Template Predicted Secondary structure									.	.	.	.
Template SS confidence
		533	.	.	.	.	.	.					540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.
		552	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	I	G	T	T	T	N	T	F	L	S	T	I	F	P	D	D	V	D	K	D	S	K	R	R	P	P	T	A	G	D	K	I	I	K	S	A	N	E	L	V	E	T	L	S	K	A	E	P	S	Y	I	R	T	I	K	P	N	Q	T	K	S	P	N	D	Y	D	D	H	Q	V	L	H	Q	V	K	Y	L	G	L
Query Conservation
Alig confidence																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	L	G	A	S	K	E	P	L	V	A	E	L	F	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	A	Q	T	I	S	A	V	H	R	E	S	L	N	K	L	M	K	N	L	Y	S	T	H	P	H	F	V	R	C	I	I	P	N	E	L	K	Q	P	G	L	V	D	A	E	L	V	L	H	Q	L	Q	C	N	G	V
Template Known Secondary structure					T		S	S							T	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																					T	T													S	S			T	T												T	T	S	S	S
Template Predicted Secondary structure																.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		609	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.											.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.
		632	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		Q	E	N	V	R	I	R	R	A	G	F	A	Y	R	Q	T	F	E	K	F	V	E	R	F	Y	L	L	S	P	D	C	S	Y	A	G	D	Y	T	W	D	G	D	T	L	E	A	V	K	L	I	L	R	D	A	M	I	P	E	K	E	F	Q	L	G	V	T	S	V	F	I	K	T	P	E	S	L	F	A	L	E
Query Conservation
Alig confidence				.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Conservation				.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template Sequence		L	E	.	.	.	.	.	R	K	G	F	P	S	R	L	I	Y	S	E	F	K	Q	R	Y	S	I	L	A	P	N	A	.	.	.	.	.	.	.	I	P	Q	D	G	K	T	V	S	E	K	I	L	A	G	L	Q	M	D	P	A	E	Y	R	L	G	T	T	K	V	F	F	K	A	.	G	V	L	G	N	L	E
Template Known Secondary structure				.	.	.	.	.				S														G	G	G	S	G	G	G	.	.	.	.	.	.	.																	T			G	G	G					S	S						T	.	T
Template Predicted Secondary structure				.	.	.	.	.																									.	.	.	.	.	.	.																																			.
Template SS confidence
		697	.						.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.								.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.		.	.	.	760	.	.	.
		712	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.									.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query SS confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.
Query Sequence		D	M	R	D	K	Y	W	Y	N	M	A	A	R	I	Q	R	A	W	R	R	F	L	Q	R	R	I	D	.	.	.	.	.	.	.	.	A	A	I	K	I	Q	R	T	I	R	E	K	K	G	G	N	K	Y	V	K	L	R	D	Y	G	T
Query Conservation																													.	.	.	.	.	.	.	.
Alig confidence																													.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		E	M	R	D	E	R	L	S	K	I	I	S	M	F	Q	A	H	I	R	G	Y	L	I	R	K	A	Y	K	K	L	Q	D	Q	R	I	G	L	S	V	I	Q	R	N	I	R	K	W	L	V	L	R	N	W	Q	W	W	K	L	Y	S	K
Template Known Secondary structure																																																					T
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		772	.	.	.	.	.	.	.	780	.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.