Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description D6VTK4 Date Mon Jul 2 19:10:02 BST 2012 Unique Job ID 1e960aed19b3fa90

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	D	A	A	P	S	L	S	N	L	F	Y	D	P	T	Y	N	P	G	Q	S	T	I	N	Y	T	S	I	Y	G	N	G	S	T	I	T	F	D	E	L	Q	G	L	V	N	S	T	V	T	Q	A	I	M	F	G	V	R	C	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	A	A	L	T	L	I	V	M	W	M	T	S	R	S	R	K	T	P	I	F	I	I	N	Q	V	S	L	F	L	I	I	L	H	S	A	L	Y	F	K	Y	L	L	S	N	Y	S	S	V	T	Y	A	L	T	G	F	P	Q	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																								?		?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	R	G	D	V	H	V	Y	G	A	T	N	I	I	Q	V	L	L	V	A	S	I	E	T	S	L	V	F	Q	I	K	V	I	F	T	G	D	N	F	K	R	I	G	L	M	L	T	S	I	S	F	T	L	G	I	A	T	V	T	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		Y	F	V	S	A	V	K	G	M	I	V	T	Y	N	D	V	S	A	T	Q	D	K	Y	F	N	A	S	T	I	L	L	A	S	S	I	N	F	M	S	F	V	L	V	V	K	L	I	L	A	I	R	S	R	R	F	L	G	L	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	D	S	F	H	I	L	L	I	M	S	C	Q	S	L	L	V	P	S	I	I	F	I	L	A	Y	S	L	K	P	N	Q	G	T	D	V	L	T	T	V	A	T	L	L	A	V	L	S	L	P	L	S	S	M	W	A	T	A	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?			?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	A	S	K	T	N	T	I	T	S	D	F	T	T	S	T	D	R	F	Y	P	G	T	L	S	S	F	Q	T	D	S	I	N	N	D	A	K	S	S	L	R	S	R	L	Y	D	L	Y	P	R	R	K	E	T	T	S	D	K	H	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	R	T	F	V	S	E	T	A	D	D	I	E	K	N	Q	F	Y	Q	L	P	T	P	T	S	S	K	N	T	R	I	G	P	F	A	D	A	S	Y	K	E	G	E	V	E	P	V	D	M	Y	T	P	D	T	A	A	D	E	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?			?		?	?								?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.
Sequence		R	K	F	W	T	E	D	N	N	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand