Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description O13559 Date Mon Jul 2 19:10:15 BST 2012 Unique Job ID 0bc39b7e84ab543b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	W	K	T	L	G	R	V	E	Q	L	L	P	Y	A	S	L	I	L	R	N	R	E	V	L	F	R	E	P	K	R	G	I	D	E	Y	L	E	N	D	S	F	F	Q	M	I	P	V	K	Y	R	E	I	V	L	P	K	L	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?	?	?											?	?	?	?	?	?						?																								?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	T	N	K	M	T	A	A	L	K	N	K	V	A	V	A	I	D	E	L	T	V	P	L	M	W	M	I	H	F	A	V	G	Y	P	Y	R	Y	P	E	L	Q	L	L	A	F	A	G	P	Q	R	N	V	Y	V	D	D	T	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	I	Q	L	Y	T	D	Y	N	K	N	G	S	S	E	P	R	L	K	T	L	D	G	L	T	S	D	Y	V	F	Y	F	V	T	V	L	R	Q	M	Q	I	C	A	L	G	N	S	Y	D	A	F	N	H	D	P	W	M	D	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?																																		?				?	?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	F	E	D	P	D	Q	V	T	N	R	D	I	S	R	I	V	L	Y	S	Y	M	F	L	N	T	A	K	G	C	L	V	E	Y	A	T	F	R	Q	Y	M	R	E	L	P	K	N	A	P	Q	K	L	N	F	R	E	M	R	Q	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?														?				?	?	?																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	I	A	L	G	R	H	C	V	G	S	R	F	E	T	D	L	Y	E	S	A	T	S	E	L	M	A	N	H	S	V	Q	T	G	R	N	I	Y	G	V	D	S	F	S	L	T	S	V	S	G	T	T	A	T	L	L	Q	E	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	E	R	W	I	Q	W	L	G	L	E	S	D	Y	H	C	S	F	S	S	T	R	N	A	E	D	V	V	A	G	E	A	A	S	S	D	H	H	Q	K	I	S	R	V	T	R	K	R	P	R	E	P	K	S	T	N	D	I	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	G	R	K	L	F	G	S	S	F	E	F	R	D	L	H	Q	L	R	L	C	H	E	I	Y	M	A	D	T	P	S	V	A	V	Q	A	P	P	G	Y	G	K	T	E	L	F	H	L	P	L	I	A	L	A	S	K	G	D	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?																					?	?	?			?	?	?	?	?																?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	V	S	F	L	F	V	P	Y	T	V	L	L	A	N	C	M	I	R	L	S	R	C	G	C	L	N	V	A	P	V	R	N	F	I	E	E	G	C	D	G	V	T	D	L	Y	V	G	I	Y	D	D	L	A	S	T	N	F	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		R	I	A	A	W	E	N	I	V	E	C	T	F	R	T	N	N	V	K	L	G	Y	L	I	V	D	E	F	H	N	F	E	T	E	V	Y	R	Q	S	Q	F	G	G	I	T	N	L	D	F	D	A	F	E	K	A	I	F	L	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?		?	?																					?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	A	P	E	A	V	A	D	A	A	L	Q	R	I	G	L	T	G	L	A	K	K	S	M	D	I	N	E	L	K	R	S	E	D	L	S	R	G	L	S	S	Y	P	T	R	M	F	N	L	I	K	E	K	S	E	V	P	L	G	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		V	H	K	I	W	K	K	V	E	S	Q	P	E	E	A	L	K	L	L	L	A	L	F	E	I	E	P	E	S	K	A	I	V	V	A	S	T	T	N	E	V	E	E	L	A	C	S	W	R	K	Y	F	R	V	V	W	I	H	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		L	G	A	A	E	K	V	S	R	T	K	E	F	V	T	D	G	S	M	R	V	L	I	G	T	K	L	V	T	E	G	I	D	I	K	Q	L	M	M	V	I	M	L	D	N	R	L	N	I	I	E	L	I	Q	G	V	G	R	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		D	G	G	L	C	Y	L	L	S	R	K	N	S	W	A	A	R	N	R	K	G	E	L	P	P	I	K	E	G	C	I	T	E	Q	V	R	E	F	Y	G	L	E	S	K	K	G	K	K	G	Q	H	V	G	C	C	G	S	R	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		L	S	A	D	T	V	E	L	I	E	R	M	D	R	L	A	E	K	Q	A	T	A	S	M	S	I	I	A	L	P	S	S	F	Q	E	S	N	S	S	D	R	C	R	K	Y	C	S	S	D	E	D	S	D	T	C	I	H	G	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		N	A	S	T	N	A	T	T	N	S	S	T	N	A	T	T	T	A	S	T	N	V	R	T	S	A	T	T	T	A	S	I	N	V	R	T	S	A	I	T	T	E	S	T	N	S	S	T	N	A	T	T	T	A	S	T	N	V	R	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		S	A	T	T	T	A	S	I	N	V	R	T	S	A	T	T	T	E	S	T	N	S	N	T	S	A	T	T	T	E	S	T	D	S	N	T	S	A	T	T	T	E	S	T	D	S	N	T	S	A	T	T	T	A	S	T	N	S	S	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		N	A	T	T	T	A	S	T	N	S	S	T	N	A	T	T	T	E	S	T	N	A	S	A	K	E	D	A	N	K	D	G	N	A	E	D	N	R	F	H	P	V	T	D	I	N	K	E	S	Y	K	R	K	G	S	Q	M	V	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		E	R	K	K	L	K	A	Q	F	P	N	T	S	E	N	M	N	V	L	Q	F	L	G	F	R	S	D	E	I	K	H	L	F	L	Y	G	I	D	V	Y	F	C	P	E	G	V	F	T	Q	Y	G	L	C	K	G	C	Q	K	M	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		E	L	C	V	C	W	A	G	Q	K	V	S	Y	R	R	M	A	W	E	A	L	A	V	E	R	M	L	R	N	D	E	E	Y	K	E	Y	L	E	D	I	E	P	Y	H	G	D	P	V	G	Y	L	K	Y	F	S	V	K	R	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		I	Y	S	Q	I	Q	R	N	Y	A	W	Y	L	A	I	T	R	R	R	E	T	I	S	V	L	D	S	T	R	G	K	Q	G	S	Q	V	F	R	M	S	G	R	Q	I	K	E	L	Y	Y	K	V	W	S	N	L	R	E	S	K	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?			?	?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		E	V	L	Q	Y	F	L	N	W	D	E	K	K	C	R	E	E	W	E	A	K	D	D	T	V	F	V	E	A	L	E	K	V	G	V	F	Q	R	L	R	S	M	T	S	A	G	L	Q	G	P	Q	Y	V	K	L	Q	F	S	R	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?																								?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		H	R	Q	L	R	S	R	Y	E	L	S	L	G	M	H	L	R	D	Q	L	A	L	G	V	T	P	S	K	V	P	H	W	T	A	F	L	S	M	L	I	G	L	F	Y	N	K	T	F	R	Q	K	L	E	Y	L	L	E	Q	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence		E	V	W	L	L	P	H	W	L	D	L	A	N	V	E	V	L	A	A	D	N	T	R	V	P	L	Y	M	L	M	V	A	V	H	K	E	L	D	S	D	D	V	P	D	G	R	F	D	I	I	L	L	C	R	D	S	S	R	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.
Sequence		G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?
Disorder confidence