Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description O13585 Date Mon Jul 2 19:10:20 BST 2012 Unique Job ID 038ae451182d46d3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	S	V	W	D	D	A	R	I	E	D	R	T	V	D	K	P	V	G	S	S	H	A	Q	E	K	L	A	L	V	K	S	T	L	F	K	L	D	Q	E	D	R	P	E	C	D	S	W	V	Q	L	V	K	L	I	C	D	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	E	E	E	F	T	T	F	K	E	L	L	R	E	V	K	N	V	N	D	K	S	V	T	G	V	A	L	I	H	Y	I	I	V	F	D	R	A	D	Y	I	E	L	L	H	D	N	P	S	G	A	K	L	D	L	N	L	V	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	V	G	Y	T	P	L	M	W	S	F	S	L	Q	R	R	N	C	C	L	E	L	F	N	A	F	D	E	I	N	F	N	M	T	N	K	A	G	L	T	A	W	D	M	V	P	P	Y	S	P	L	S	E	F	L	E	Q	N	N	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	R	Y	R	T	E	V	K	H	E	I	P	Q	I	S	Q	P	K	D	T	S	L	L	M	S	N	E	D	S	T	T	K	E	T	F	D	N	I	D	L	Q	V	A	G	L	T	L	S	P	G	A	N	D	N	M	F	L	D	S	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?	?	?				?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	K	N	M	N	H	S	Q	G	A	A	T	L	I	D	P	T	Y	T	E	D	Y	H	G	T	F	D	Y	D	K	L	S	P	D	Q	Y	L	E	F	S	D	F	D	I	P	Q	I	L	N	L	L	I	S	L	P	Q	K	E	P	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	T	T	Y	P	A	G	L	I	Y	Q	C	I	R	Y	A	D	H	K	I	K	S	K	P	L	V	E	S	L	I	N	L	S	L	T	K	I	L	T	S	V	S	S	N	G	A	A	G	L	V	S	T	E	A	S	L	Q	A	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	V	L	Q	S	Y	W	L	S	C	L	S	F	L	Y	Y	Y	L	C	R	D	D	S	F	F	K	R	H	P	S	V	L	Q	E	L	I	N	T	I	H	S	I	I	I	E	L	T	S	S	I	H	C	R	L	I	S	L	I	D	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	L	L	A	Y	T	T	I	Q	D	V	K	Q	T	L	Y	K	R	D	W	N	F	F	K	K	R	K	Q	A	K	L	L	L	K	E	K	N	R	K	Q	L	K	E	Q	Q	K	K	E	L	H	R	K	S	Q	G	Q	E	N	H	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	E	E	G	Q	Q	D	G	N	D	S	D	D	R	A	S	T	N	D	D	N	N	S	S	V	S	L	F	Y	D	K	E	I	L	R	H	L	Y	P	P	S	F	E	E	Q	M	K	P	S	P	L	K	I	V	Q	I	F	G	A	L
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	Y	V	L	N	L	H	Q	T	H	P	I	F	Q	Q	Q	C	L	S	I	S	V	N	W	F	A	T	T	L	F	N	K	I	L	K	D	K	K	K	R	S	L	S	R	A	H	A	I	Q	I	R	L	N	L	S	T	L	E	S	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		I	Q	N	N	D	F	C	V	P	K	P	M	L	I	D	D	F	M	W	Q	R	F	P	M	T	L	I	R	D	V	G	E	I	D	L	S	D	P	I	L	R	N	V	A	T	Y	K	P	I	D	E	N	N	K	D	L	I	Y	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		S	N	S	L	F	Y	Y	Q	P	F	H	K	I	A	Q	I	H	L	E	P	V	F	Q	L	L	Q	W	L	Q	V	A	T	T	L	D	S	E	E	S	L	I	S	T	M	N	L	L	P	R	I	T	P	V	Q	L	L	K	S	M	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		K	Y	N	Y	E	L	N	E	N	K	F	N	S	K	L	K	K	F	L	N	N	K	I	K	D	S	K	M	S	K	A	D	A	Y	L	Q	E	H	E	I	P	Y	L	V	L	P	T	I	P	E	M	T	D	L	Y	S	K	G	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?		?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?				?		?	?	?						?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		S	H	S	F	Q	P	F	L	P	G	S	I	Q	D	D	V	Y	E	I	H	D	V	N	F	K	Q	R	Q	N	E	P	Q	I	S	R	T	N	S	G	T	S	D	F	T	G	D	E	D	K	A	Q	Y	E	T	E	G	V	G	E	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?				?																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	D	I	N	E	T	V	E	P	E	S	N	A	F	N	V	G	N	D	D	Y	F	K	E	L	N	I	P	S	S	T	A	Q	R	P	A	W	S	N	N	D	D	M	E	Q	N	P	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
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