Job Description O13585 Confidence 100.00% Date Mon Jul 2 19:10:20 BST 2012 Rank 2 Aligned Residues 284 % Identity 22% Template c3mmiB_ PDB info PDB header:motor protein Chain: B: PDB Molecule:myosin-4; PDBTitle: crystal structure of the globular tail of myo4p Resolution 2.30 Å

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		285	.	.	.	.	290	.	.	.				.	.	.	.	.	.	300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360	.
Predicted Secondary structure											.	.	.
Query SS confidence											.	.	.
Query Sequence		P	Q	I	L	N	L	L	I	S	.	.	.	L	P	Q	K	E	P	H	M	T	T	Y	P	A	G	L	I	Y	Q	C	I	R	Y	A	D	H	K	I	K	S	K	P	L	V	E	S	L	I	N	L	S	L	T	K	I	L	T	S	V	S	S	N	G	A	A	G	L	V	S	T	E	A	S	L	Q	A	G	D	I
Query Conservation											.	.	.
Alig confidence											.	.	.																																	.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																																														.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		L	E	V	T	E	G	Y	L	K	K	V	N	V	T	E	V	N	G	D	N	V	L	G	P	I	H	V	I	T	T	V	V	S	S	L	V	R	N	G	L	L	I	Q	S	.	S	K	F	I	S	K	V	L	L	T	V	E	S	I	V	M	S	L	P	K	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	D	E	T	M
Template Known Secondary structure						T	T	T	G	G	G			T	T	T			S	S		T	T																T	T						.																				G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	G	G
Template Predicted Secondary structure																																														.																					.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1116	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.		1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.												1180	.	.	.
		362	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.			.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.						.	420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																										.	.																																		.	.	.	.	.
Query SS confidence																										.	.																																		.	.	.	.	.
Query Sequence		V	L	Q	S	Y	W	L	S	C	L	S	F	L	Y	Y	Y	L	C	R	D	D	S	F	F	.	.	K	R	H	P	S	V	L	Q	E	L	I	N	T	I	H	S	I	I	I	E	L	T	S	S	I	H	C	R	L	I	S	L	I	.	.	.	.	.	D	S	T	L	L	A	Y	T	T	I	Q	D	V	K	Q	T
Query Conservation																										.	.																																		.	.	.	.	.
Alig confidence																										.	.																																		.	.	.	.	.
Template Conservation
Template Sequence		L	G	G	I	F	W	L	S	N	L	S	R	L	P	A	F	A	A	N	Q	K	T	L	Y	K	D	K	L	T	L	I	Y	L	N	D	L	E	N	E	T	L	K	V	F	D	K	I	Y	S	T	W	L	V	K	F	M	K	H	A	S	A	H	I	E	I	F	D	M	V	L	N	E	K	L	F	K	N	S	G	D
Template Known Secondary structure												T	T											T																																								T	T						T		G	G	G	T	T	S
Template Predicted Secondary structure
Template SS confidence
		1184	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260	.	.	.
		435	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480	.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		L	Y	K	R	D	W	N	F	F	K	K	R	K	Q	A	K	L	L	L	K	E	K	N	R	K	Q	L	K	E	Q	Q	K	K	E	L	H	R	K	S	Q	G	Q	E	N	H	E	E	E	E	G	Q	Q	D	G	N	D	S	D	D	R	A	S	T	N	D	D	N	N	S	S	V	S	L	F	Y	D	K	E	I	L
Query Conservation
Alig confidence			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure			.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1271
		515	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540	.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		R	H	L	Y	P	P	S	F	E	E	Q	M	K	P	S	P	L	K	I	V	Q	I	F	G	A	L	S	Y	V	L	N	L	H	Q	T	H	P	I	F	Q	Q	Q	C	L	S	I	S	V	N	W	F	A	T	T	L	F	N	K	I	L	K	D	K	K	K	R	S	L	S	R	A	H	A	I	Q	I	R	L	N	L
Query Conservation
Alig confidence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template Conservation		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template Sequence		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	K	F	A	K	L	F	T	F	L	N	E	F	D	A	V	L	C	K	F	Q	V	V	D	S	M	H	T	K	I	F	N	D	T	L	K	Y	L	N	V	M	L	F	N	D	L	I	T	.	.	K	C	P	A	L	N	W	K	Y	G	Y	E	V	D	R	N	I
Template Known Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																			T	T																												.	.					B
Template Predicted Secondary structure		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.																																																.	.
Template SS confidence
																1272	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.			.	1320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.
		595	.	.	.	.	600	.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660	.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.
Predicted Secondary structure
Query SS confidence
Query Sequence		S	T	L	E	S	W	I	Q	N	N	D	F	C	V	P	K	P	M	L	I	D	D	F	M	W	Q	R	F	P	M	T	L	I	R	D	V	G	E	I	D	L	S	D	P	I	L	R	N	V	A	T	Y	K	P	I	D	E	N	N	K	D	L	I	Y	D	T	S	N	S	L	F	Y	Y	Q	P	F	H	K	I	A
Query Conservation
Alig confidence																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Conservation																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Sequence		E	R	L	V	S	W	F	E	P	R	I	E	D	V	R	P	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Known Secondary structure							T	T	T	T	T	S	S			G	G	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template Predicted Secondary structure																		.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Template SS confidence
		1336	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.
		675	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690		.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720	.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.
Predicted Secondary structure																		.
Query SS confidence																		.
Query Sequence		Q	I	H	L	E	P	V	F	Q	L	L	Q	W	L	Q	V	.	A	T	T	L	D	S	E	E	S	L	I	S	T	M	N	L	L	P	R	I	T	P	V	Q	L	L	K	S	M	E	K	Y	N	Y	E	L	N	E	N	K	F	N	S	K	L	K	K	F	L	N	N	K	I	K	D	S
Query Conservation																		.
Alig confidence		.	.															.											.	.	.																										.	.
Template Conservation		.	.																										.	.	.																										.	.
Template Sequence		.	.	N	L	I	Q	I	I	Q	A	V	K	I	L	Q	L	K	I	S	N	L	N	E	F	K	L	L	.	.	.	F	D	F	W	Y	A	L	N	P	A	Q	I	Q	A	I	L	L	K	Y	K	P	A	N	A	G	.	.	V	P	N	E	I	L	N	Y	L	A	N	V	I	K	R	E
Template Known Secondary structure		.	.	G	G																								.	.	.	T	T	T		T	T	S										T	T	B							.	.	S
Template Predicted Secondary structure		.	.																										.	.	.																										.	.
Template SS confidence
				1352	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.				.	.	.	1380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.			.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.