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ANALYSIS FOR NEODYMIUM (III) CHLORIDE [LIO]
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Formula : ND1,CL3
Solution chemistry: ND1 +3
All distances below are to the element ND [ neodymium ]
| PROTEIN: 3ICB CALCIUM-BINDING PROTEIN (INTESTINAL)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION: SO4 SULFATE ION:
Hev Atom conc.: 1.000 mM
Precip & conc.: 90.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.020 M TRIS
Addict & conc.:
Comments :
Reference : MOFFAT et.al. 1986 :SZEBENYI et.al. 1981 :1987 :1989 :
pH 8.7 Soak time = 48.00 Hours Reference number = 114.00
Site 1: 22 GLN OE1 4.81 ( 8.15) . s . [Het: CACA - C 3.40]
: 53 LEU O 5.72 ( 7.78) . . H
: 54 ASP OD1 2.91 ( 4.79) . s H [Het: CACA - CG 3.50]
: 55 LYS CB 5.86 ( 5.38) . s .
: 56 ASN OD1 1.92 ( 4.46) . s . [Het: CACA - CG 3.70]
: 57 GLY C 5.61 ( 5.52) . s .
: 58 ASP OD1 2.34 ( 4.98) . s . [Het: CACA - CG 3.20]
: 59 GLY N 5.44 ( 6.30) . s .
: 60 GLU CG 5.92 ( 4.86) . s . [Het: CACA - C 3.40]
: 61 VAL C 5.47 ( 4.95) . s .
: 62 SER OG 5.12 ( 5.95) . s H
: 65 GLU OE1 2.33 ( 6.81) . s H [Het: CACA - CD 2.80]
: 2 CA CA 0.73 (-1.00) . . .
: 4 HOH O 1.84 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 3TLN THERMOLYSIN (NATIVE)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM(II) ION: ZN ZINC(II) ION:
Hev Atom conc.: 10.000 mM
Precip & conc.:
Buffer & conc.: 0.010 M TRIS/ACETATE
Addict & conc.: 5.000 % DMSO
Comments : PRESOAK 1.0 HR 'CALCIUM FREE BUFFER'
Reference : COLMAN et.al. 1972a:1972b:MATTHEWS et.al. 1974 :1972a:1972b:WEAVER et.al. 1974 :
pH 5.5 Soak time = 144.00 Hours Reference number = 139.01
Site 1: 138 ASP OD1 2.84 ( 5.59) . . H [Het: CACA - CB 4.10]
: 174 THR OG1 5.11 ( 5.70) . . H
: 177 GLU OE1 2.30 ( 6.19) . . H [Het: CACA - CD 3.00]
: 183 ASN O 5.24 ( 7.53) . . T [Het: CACA - C 3.60]
: 184 PRO C 5.35 ( 5.53) . . T
: 185 ASP OD1 3.54 ( 4.65) . . T [Het: CACA - O 4.20]
: 186 TRP C 5.34 ( 5.59) . . T
: 187 GLU CG 5.85 ( 4.50) . . T [Het: CACA - N 4.20]
: 188 ILE CD1 5.42 ( 4.82) . . T [Het: CACA - N 4.20]
: 189 GLY N 5.09 ( 5.98) . . T
: 190 GLU OE1 2.77 ( 6.12) . . H [Het: CACA - CD 2.80]
: 1 CA CA 0.52 (-1.00) . . .
: 2 CA CA 3.53 (-1.00) . . .
: 346 HOH O 2.45 (-1.00) . . .
: 350 HOH O 4.84 (-1.00) . . .
: 353 HOH O 4.75 (-1.00) . . .
: 469 HOH O 4.30 (-1.00) . . .
: 475 HOH O 5.30 (-1.00) . . .
Site 2: 138 ASP OD1 5.85 ( 8.10) . . H [Het: CACA - CB 4.10]
: 177 GLU OE1 4.15 ( 7.09) . . H [Het: CACA - CD 3.00]
: 182 LYS O 4.07 ( 6.46) . . T [Het: CACA - O 3.80]
: 183 ASN ND2 4.69 ( 4.47) . . T [Het: CACA - C 3.60]
: 184 PRO CD 5.75 ( 4.15) . . T
: 185 ASP OD1 1.98 ( 4.64) . . T [Het: CACA - O 4.20]
: 187 GLU O 5.84 ( 6.80) . . T [Het: CACA - N 4.20]
: 190 GLU OE1 4.34 ( 6.39) . . H [Het: CACA - CD 2.80]
: 191 ASP OD1 4.61 ( 6.70) . . H
: 1 CA CA 3.90 (-1.00) . . .
: 2 CA CA 0.51 (-1.00) . . .
: 346 HOH O 5.51 (-1.00) . . .
: 350 HOH O 5.69 (-1.00) . . .
: 353 HOH O 2.95 (-1.00) . . .
: 469 HOH O 5.10 (-1.00) . . .
: 475 HOH O 2.17 (-1.00) . . .
Site 3: 57 ASP OD1 2.96 ( 5.69) . . E [Het: CACA - CG 2.80]
: 58 ALA CB 5.93 ( 5.83) . . T
: 59 ASP OD1 2.48 ( 5.13) . . T [Het: CACA - CG 3.40]
: 60 ASN N 5.38 ( 6.15) . . T
: 61 GLN CG 5.79 ( 4.50) . . E [Het: CACA - N 3.90]
: 62 PHE C 5.86 ( 5.08) . . E
: 63 PHE N 5.41 ( 6.55) . . T
: 67 ASP OD1 5.79 ( 8.35) . . T
: 3 CA CA 0.88 (-1.00) . . .
: 356 HOH O 5.19 (-1.00) . . .
: 419 HOH O 2.27 (-1.00) . . .
: 477 HOH O 5.86 (-1.00) . . .
: 482 HOH O 1.59 (-1.00) . . .
: 484 HOH O 3.58 (-1.00) . . .
: 503 HOH O 2.13 (-1.00) . . .
: 507 HOH O 5.95 (-1.00) . . .
: 508 HOH O 4.71 (-1.00) . . .
Site 4: 190 GLU O 4.30 ( 5.99) . . H [Het: CACA - CD 2.80]
: 193 TYR CD2 5.42 ( 4.86) . . T [Het: CACA - C 3.30]
: 194 THR OG1 3.06 ( 3.99) . . T [Het: CACA - N 3.80]
: 195 PRO CD 5.46 ( 4.54) . . T
: 196 GLY O 5.88 ( 5.71) . . T
: 197 ILE CG1 5.45 ( 4.10) . . T [Het: CACA - CA 4.20]
: 198 SER OG 5.80 ( 4.38) . . T
: 199 GLY N 5.05 ( 6.00) . . T
: 200 ASP OD1 2.82 ( 5.36) . . T [Het: CACA - CG 3.40]
: 4 CA CA 0.73 (-1.00) . . .
: 354 HOH O 2.55 (-1.00) . . .
: 476 HOH O 4.81 (-1.00) . . .
: 480 HOH O 1.66 (-1.00) . . .
: 505 HOH O 4.24 (-1.00) . . .
| PROTEIN: 4TNC TROPONIN C (CHICKEN)
|
Bound Ligands : CA CALCIUM ION:
Hev Atom conc.: 75% SATURATION
Precip & conc.: 43.000 % AMMONIUM SULPHATE
Buffer & conc.: 0.050 M SODIUM ACETATE
Addict & conc.: 0.005 M MANGANESE CHLORIDE/SODIUM AZIDE
Comments :
Reference : SUNDARALINGAM et.al. 1985 :
pH 4.9 Soak time = Hours Reference number = 270.03
Site 1: 106 ASP OD1 4.85 ( 5.05) . . .
: 107 LYS CB 5.83 ( 5.76) . . .
: 108 ASN OD1 1.85 ( 4.45) . . .
: 109 ALA C 5.12 ( 5.13) . . .
: 110 ASP OD1 2.85 ( 4.48) . . .
: 111 GLY N 5.19 ( 6.24) . . .
: 112 PHE CD1 5.86 ( 5.05) . . .
: 113 ILE C 5.32 ( 5.27) . . .
: 114 ASP OD1 5.22 ( 5.91) . . .
: 117 GLU OE1 2.33 ( 7.10) . . H
: 163 CA CA 1.14 (-1.00) . . .
: 166 HOH O 4.43 (-1.00) . . .
: 171 HOH O 5.23 (-1.00) . . .
: 176 HOH O 2.18 (-1.00) . . .
: 187 HOH O 4.79 (-1.00) . . .
: 235 HOH O 5.37 (-1.00) . . .
Site 2: 112 PHE CE2 5.99 ( 8.02) . . .
: 141 SER O 5.60 ( 7.36) . . H
: 142 ASP OD1 4.40 ( 4.19) . . H
: 143 LYS CB 5.95 ( 5.36) . . .
: 144 ASN OD1 2.31 ( 4.76) . . .
: 145 ASN C 5.55 ( 5.49) . . .
: 146 ASP OD1 3.67 ( 5.03) . . .
: 147 GLY C 5.53 ( 5.90) . . .
: 148 ARG NE 5.92 ( 4.63) . . .
: 149 ILE CB 5.86 ( 4.61) . . .
: 150 ASP OD1 4.91 ( 5.57) . . .
: 153 GLU OE1 2.52 ( 6.42) . . H
: 164 CA CA 0.22 (-1.00) . . .
: 169 HOH O 5.04 (-1.00) . . .
: 209 HOH O 2.38 (-1.00) . . .
: 210 HOH O 4.66 (-1.00) . . .
: 231 HOH O 5.08 (-1.00) . . .