HHsearch 1.5 NAME d2fzta1 FAM FILE d2fzta1 COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d2fzta1.a3m DATE Tue Mar 9 04:14:10 2010 LENG 78 match states, 78 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4292 -0.3826 SEQ >ss_dssp CCHHHHHHHHHHHHHHTCHHHHHHHHHHHHHHHTTSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EECEBABDDADDABEEDCCDDBEEBCDCBEEDCEECEEECDEDADDDCDDBEDDCDECDEDDEEEECDECEDDDEEEE >ss_pred CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 988999999999985764899999999999996277889999999989999999999999999999999999975349 >Consensus xnvdeierkideaiexedyexlxxllxxrxxllxxlxxxklseilekdrxrlxiiexrksxlfxexxxxrxxxxslqk >d2fzta1 XNIDEIERKIDEAIEKEDYETLLSLLNKRKELXEGLPKDKLSEILEKDRKRLEIIEKRKTALFQEINVIREARSSLQK >UniRef50_B9KAT5(5-81:93) Putative uncharacterized protein n=6 Tax=Thermotogaceae RepID=B9KAT5_THENN E=2e-14 s/c=1.04 id=62% cov=100% -NVDEIERKIDEAIEREDYEHLRVLLKEREKLLKDLSAEKLSEILEKDRERLRIIEERKSSLFRELSGLRNIKGSLQK # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * X 1 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 1 * * * * * * * 0 0 0 N 2 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1287 0 0 I 3 * * * * * * * 1019 * * * * * * * * * 981 * * 3 0 * * * * * * 1287 0 0 D 4 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1287 0 0 E 5 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1287 0 0 I 6 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1287 0 0 E 7 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1287 0 0 R 8 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 8 0 * * * * * * 1287 0 0 K 9 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1287 0 0 I 10 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1287 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1287 0 0 E 12 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1287 0 0 A 13 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1287 0 0 I 14 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1287 0 0 E 15 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1287 0 0 K 16 * * * * * * * * 1019 * * * * * 981 * * * * * 16 0 * * * * * * 1287 0 0 E 17 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1287 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1287 0 0 Y 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 19 0 * * * * * * 1287 0 0 E 20 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1287 0 0 T 21 * * * * * * 981 * * * * * * * * * 1019 * * * 21 0 * * * * * * 1287 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1287 0 0 L 23 * * * * * * * * * 1019 * * * * 981 * * * * * 23 0 * * * * * * 1287 0 0 S 24 * * * * * * * * * * * * * * * 1019 * 981 * * 24 0 * * * * * * 1287 0 0 L 25 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1287 0 0 L 26 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1287 0 0 N 27 * * * * * * * * 981 * * 1019 * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1287 0 0 K 28 * * * 981 * * * * 1019 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1287 0 0 R 29 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 29 0 * * * * * * 1287 0 0 K 30 * * * 981 * * * * 1019 * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1287 0 0 E 31 * * * 1019 * * * * 981 * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1287 0 0 L 32 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1287 0 0 X 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 E 34 * * * 1019 * * * * 981 * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1287 0 0 G 35 * * 981 * * 1019 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1287 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1287 0 0 P 37 * * * * * * * * * * * * 1019 * * 981 * * * * 37 0 * * * * * * 1287 0 0 K 38 981 * * * * * * * 1019 * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1287 0 0 D 39 * * 1019 981 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1287 0 0 K 40 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1287 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1287 0 0 S 42 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 42 0 * * * * * * 1287 0 0 E 43 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1287 0 0 I 44 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1287 0 0 L 45 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1287 0 0 E 46 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1287 0 0 K 47 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1287 0 0 D 48 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1287 0 0 R 49 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 49 0 * * * * * * 1287 0 0 K 50 * * * 981 * * * * 1019 * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1287 0 0 R 51 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 51 0 * * * * * * 1287 0 0 L 52 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1287 0 0 E 53 * * * 1019 * * * * * * * * * * 981 * * * * * 53 0 * * * * * * 1287 0 0 I 54 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1287 0 0 I 55 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 1287 0 0 E 56 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1287 0 0 K 57 * * * 981 * * * * 1019 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1287 0 0 R 58 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 58 0 * * * * * * 1287 0 0 K 59 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1287 0 0 T 60 * * * * * * * * * * * * * * * 981 1019 * * * 60 0 * * * * * * 1287 0 0 A 61 1019 * * * * * * * * * * * * * * 981 * * * * 61 0 * * * * * * 1287 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1287 0 0 F 63 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1287 0 0 Q 64 * * * * * * * * * * * * * 1019 981 * * * * * 64 0 * * * * * * 1287 0 0 E 65 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1287 0 0 I 66 * * * * * * * 1019 * 981 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1287 0 0 N 67 * * * * * * * * * * * 1019 * * * 981 * * * * 67 0 * * * * * * 1287 0 0 V 68 * * * * * 981 * * * * * * * * * * * 1019 * * 68 0 * * * * * * 1287 0 0 I 69 * * * * * * * 1019 * 981 * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1287 0 0 R 70 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 70 0 * * * * * * 1287 0 0 E 71 * * * 1019 * * * * * * * 981 * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1287 0 0 A 72 1019 * * * * * * 981 * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1287 0 0 R 73 * * * * * * * * 981 * * * * * 1019 * * * * * 73 0 * * * * * * 1287 0 0 S 74 * * * * * 981 * * * * * * * * * 1019 * * * * 74 0 * * * * * * 1287 0 0 S 75 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 75 0 * * * * * * 1287 0 0 L 76 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1287 0 0 Q 77 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 77 0 * * * * * * 1287 0 0 K 78 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 78 0 * * 0 * * * 1287 0 0 //