HHsearch 1.5 NAME d2d4pa1 FAM FILE d2d4pa1 COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d2d4pa1.a3m DATE Tue Mar 9 23:45:25 2010 LENG 130 match states, 130 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.4344 0.5593 SEQ >ss_dssp CEEECCCGGGHHHHHHTSTTSCCCHHHHHHHHHHSCCEEEEETTEEEEEEEEEEEECSSSEEEEEEEEEESSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCSEEEECCC TTCHHHHHHHHHTTCCCCSSCCCCCCCCCC >sa_dssp BECCEBDDEBCECACEBBEEEEBDDECADDBDECEBBBAABDEEDACAAABACDDEEDEDCBACBDBACCDCCEAADBAADCACEBAEEEECEDCCCECD EECEDACEABEDCECEEDEEEEEEEEEEEE >ss_pred CCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCC HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9657555300899997316357771452245422730333100247899999986158860220014321879999999999986554100122232158 035789998742002420275565433379 >Consensus MrfRxFaEpDxxrLxalaGxxpxslxaLrFfxRsgHSFxAxeeexxxGfaLAQavWQGdxxtVLvtrixxxxxexxxGLLrAvVKSAYDagVYEValhLd Pxxxelxxalxaxxfxlgpxxlavrvlgsr >d2d4pa1 MRFRPFTEEDLDRLNRLAGKRPVSLGALRFFARTGHSFLAEEGEEPMGFALAQAVWQGEATTVLVTRIEGRSVEALRGLLRAVVKSAYDAGVYEVALHLD PERKELEEALKAEGFALGPLVLAVRVLGSR >UniRef50_Q1IZG2(1-125:171) Acetyltransferase, GNAT family n=3 Tax=Deinococcus RepID=Q1IZG2_DEIGD E=7e-11 s/c=0.55 id=47% cov=78% MRYRSFAEPDYEALQALdlaaqrradpafdalpdrerAGRLSTSLPALKFYERSEHSFVAQDEAgQLQGLILAQHVWQGDRPIVLVRAVIlapDAPEDTA AGLLRATVKSAYDSAVYEVHFPLLP----------------------------- >UniRef50_C1XQH6(1-139:150) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Meiothermus silvanus DSM 9946 RepID=C1XQH6_9DEIN E=6e-47 s/c=1.35 id=61% cov=101% MVFRDFAEPDFARLEAYEkaklGEQPphvyrCTPAGLRFFSRSGHSFMALEEERIVGFALAQALWQGDQVTVLLTRILADAQEVYQGLLGAVVKSAYDAG VYEVALHLDPAHTELKSALEAHSFVLGPKILAVRVLGSR # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1653 0 0 R 2 * * * * * * * * * * * * * * 565 * * 1625 * * 2 0 * * * * * * 1653 0 0 F 3 * * * * 641 * * * * * * * * * * * * * * 1478 3 0 * * * * * * 1653 0 0 R 4 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 4 0 * * * * * * 1653 0 0 P 5 * * 1625 * * * * * * * * * 1658 * * 1478 * * * * 5 0 * * * * * * 1653 0 0 F 6 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1653 0 0 T 7 550 * * * * * * * * * * * * * * * 1658 * * * 7 0 * * * * * * 1653 0 0 E 8 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1653 0 0 E 9 * * * 1658 * * * * * * * * 550 * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1653 0 0 D 10 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1653 0 0 L 11 * * * * 1625 * * * * 1658 * * * * * * * * * 1478 11 0 * * * * * * 1653 0 0 D 12 1625 * 1658 1478 * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1653 0 0 R 13 1478 * * * * * * * * * * * * * 641 * * * * * 13 0 * * * * * * 1653 0 0 L 14 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1653 0 0 N 15 * * * 1625 * * * * * * * 1658 * 1478 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1653 0 0 R 16 550 * * * * * * * * * * * * * 1658 * * * * * 16 0 * * * * * * 1653 0 0 L 17 * * * * * * * * * 565 * * * * * * * * * 1625 17 641 1478 * 4322 74 * * 1653 1000 0 A 18 565 * * 1625 * * * * * * * * * * * * * * * * 18 565 1625 * 2000 415 * * 1653 1000 0 G 19 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1653 0 0 K 20 * * * 1625 * * * * 1658 * * * * * 1478 * * * * * 20 0 * * * * * * 1653 0 0 R 21 * * * * * * * * * 1478 * * * 1625 1658 * * * * * 21 0 * * * * * * 1653 0 0 P 22 * * * * * * * * * * * * 641 * * 1478 * * * * 22 565 1625 * 2322 322 * * 1653 1000 0 V 23 * 1625 * * * * * * * * * * * * * * 1478 1658 * * 23 0 * * * * * * 1653 0 0 S 24 * * * * * * * * * * * * * * * 565 1625 * * * 24 0 * * * * * * 1653 0 0 L 25 * * * * * * * * * 565 * * 1625 * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1653 0 0 G 26 1625 * * * * 1658 * * * * * * 1478 * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1653 0 0 A 27 565 * * * * 1625 * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1653 0 0 L 28 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1653 0 0 R 29 * * * * * * * * 1478 * * * * * 641 * * * * * 29 0 * * * * * * 1653 0 0 F 30 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1653 0 0 F 31 * * * * 641 * * * * * * * * * * * * * * 1478 31 0 * * * * * * 1653 0 0 A 32 1658 * * 1478 * * * * * * * * * * * 1625 * * * * 32 0 * * * * * * 1653 0 0 R 33 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 33 0 * * * * * * 1653 0 0 T 34 * * * * * * * * * * * * * * * 550 1658 * * * 34 0 * * * * * * 1653 0 0 G 35 * * * 1478 * 641 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1653 0 0 H 36 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1653 0 0 S 37 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 37 0 * * * * * * 1653 0 0 F 38 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1653 0 0 L 39 * * * * * * * * * 1658 1625 * * * * * * 1478 * * 39 0 * * * * * * 1653 0 0 A 40 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1653 0 0 E 41 * * * 1658 * * * * * 1625 * * * 1478 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1653 0 0 E 42 * * 1478 641 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1653 0 0 G 43 * * * 550 * 1658 * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1653 0 0 E 44 1478 * * 641 * * * * * * * * * * * * * * * * 44 641 1478 * 0 * * * 1653 1000 0 E 45 * * * 1658 * * * * * * * * * 1478 1625 * * * * * 45 0 * * * * * * 1653 0 0 P 46 * * * * * * * 1625 * 1478 * * 1658 * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1653 0 0 M 47 * * * * * * * * * * 1658 * * 1478 * * * 1625 * * 47 0 * * * * * * 1653 0 0 G 48 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1653 0 0 F 49 * * * * 641 * * * * 1478 * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1653 0 0 A 50 641 * * * * * * 1478 * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1653 0 0 L 51 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1653 0 0 A 52 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1653 0 0 Q 53 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 53 0 * * * * * * 1653 0 0 A 54 641 * * * * * 1478 * * * * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1653 0 0 V 55 * * * * * * * * * 1625 * * * * * * * 565 * * 55 0 * * * * * * 1653 0 0 W 56 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 56 0 * * * * * * 1653 0 0 Q 57 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 57 0 * * * * * * 1653 0 0 G 58 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1653 0 0 E 59 * * 550 1658 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1653 0 0 A 60 1658 * * * * * * * * * * * * 1625 1478 * * * * * 60 0 * * * * * * 1653 0 0 T 61 * * * * * * * * * * * * 1478 * * * 1658 1625 * * 61 0 * * * * * * 1653 0 0 T 62 * * * * * * * 1478 * * * * * * * * 641 * * * 62 0 * * * * * * 1653 0 0 V 63 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 63 0 * * * * * * 1653 0 0 L 64 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1653 0 0 V 65 * * * * * * * * * 1625 * * * * * * * 565 * * 65 0 * * * * * * 1653 0 0 T 66 * * * * * * * * * * * * * * 1478 * 641 * * * 66 0 * * * * * * 1653 0 0 R 67 1478 * * * * * * * * * * * * * 641 * * * * * 67 0 * * * * * * 1653 0 0 I 68 * * * * * * * 641 * * * * * * * * * 1478 * * 68 0 * * * * * * 1653 0 0 E 69 * * * 1658 * * * 1478 * 1625 * * * * * * * * * * 69 641 1478 * 1585 585 * * 1653 1000 0 G 70 1625 * 1478 * * 1658 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1653 0 0 R 71 1478 * 1625 * * * * * * * * * * * 1658 * * * * * 71 0 * * * * * * 1653 0 0 S 72 1625 * * * * * * * * * * * 1478 * * 1658 * * * * 72 0 * * * * * * 1653 0 0 V 73 * * * 1478 * * * * * * * * * 1625 * * * 1658 * * 73 0 * * * * * * 1653 0 0 E 74 * * 1478 641 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1653 0 0 A 75 1658 * * * * * * * * * * * * * * * 1478 1625 * * 75 0 * * * * * * 1653 0 0 L 76 1478 * * * * * * * * 1658 * * * * * * * * * 1625 76 0 * * * * * * 1653 0 0 R 77 1478 * * * * * * * * * * * * 1625 1658 * * * * * 77 0 * * * * * * 1653 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1653 0 0 L 79 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1653 0 0 L 80 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1653 0 0 R 81 * * * * * 1625 * * * * * * * * 565 * * * * * 81 0 * * * * * * 1653 0 0 A 82 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 82 0 * * * * * * 1653 0 0 V 83 * * * * * * * * * * * * * * * * 1478 641 * * 83 0 * * * * * * 1653 0 0 V 84 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 84 0 * * * * * * 1653 0 0 K 85 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 85 0 * * * * * * 1653 0 0 S 86 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 86 0 * * * * * * 1653 0 0 A 87 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 1653 0 0 Y 88 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 88 0 * * * * * * 1653 0 0 D 89 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1653 0 0 A 90 641 * * * * * * * * * * * * * * 1478 * * * * 90 0 * * * * * * 1653 0 0 G 91 1478 * * * * 641 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1653 0 0 V 92 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 92 0 * * * * * * 1653 0 0 Y 93 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 93 0 * * * * * * 1653 0 0 E 94 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1653 0 0 V 95 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 95 0 * * * * * * 1653 0 0 A 96 641 * * * * * 1478 * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1653 0 0 L 97 * * * * 1478 * * * * 641 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1653 0 0 H 98 * * * * * * 641 * * * * * 1478 * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1653 0 0 L 99 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1653 0 0 D 100 * * 641 * * * * * * 1478 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1653 0 0 P 101 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1653 0 0 E 102 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1306 0 0 R 103 * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * 103 0 * * * * * * 1306 0 0 K 104 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 104 0 * * * * * * 1306 0 0 E 105 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1306 0 0 L 106 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1306 0 0 E 107 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1306 0 0 E 108 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 108 0 * * * * * * 1306 0 0 A 109 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1306 0 0 L 110 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1306 0 0 K 111 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1306 0 0 A 112 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1306 0 0 E 113 * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 113 0 * * * * * * 1306 0 0 G 114 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 114 0 * * * * * * 1306 0 0 F 115 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1306 0 0 A 116 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 116 0 * * * * * * 1306 0 0 L 117 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1306 0 0 G 118 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1306 0 0 P 119 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1306 0 0 L 120 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1306 0 0 V 121 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 121 0 * * * * * * 1306 0 0 L 122 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1306 0 0 A 123 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1306 0 0 V 124 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 124 0 * * * * * * 1306 0 0 R 125 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 125 0 * * * * * * 1306 0 0 V 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 126 0 * * * * * * 1306 0 0 L 127 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 1306 0 0 G 128 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1306 0 0 S 129 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 129 0 * * * * * * 1306 0 0 R 130 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 130 0 * * 0 * * * 1306 0 0 //