HHsearch 1.5 NAME d2cqia1 FAM FILE d2cqia1 COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d2cqia1.a3m DATE Tue Mar 9 06:53:55 2010 LENG 90 match states, 90 columns in multiple alignment FILT 131 out of 10838 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 9.1 EVD 0.4526 1.2640 SEQ >ss_dssp CCCCSCCCCEEEEESCCTTCCHHHHHHHHHHHSCEEEEEEECCCCSSCCEEEEEESSHHHHHHHHHHHTTEEETTEEEEEEECCCTTCCC >sa_dssp EEEEEDDDDDACAACACEDBDDECACECADEDBDCDDBECCEEDEEECBBACADADDDEAACDACEDAECDEBEECDADAECCEEEEEEE >ss_pred CCCCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCEECCEEEEEEECCCCCCCC >ss_conf 965279987899868878889999999974028827987630478610001466469999999999837969888899998457621069 >Consensus xxxxxxxxxtlfVxnLpxxxxxxxlxxxfxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxaxvxfxxxxxaxxAixxlxgxxxxgrxixVxxaxxxxxxr >d2cqia1 MMEDDGQPRTLYVGNLSRDVTEVLILQLFSQIGPCKSCKMITEHTSNDPYCFVEFYEHRDAAAALAAMNGRKILGKEVKVNWATTPSSQK >UniRef50_C5XB16(431-527:551) Putative uncharacterized protein Sb02g004470 n=2 Tax=Poaceae RepID=C5XB16_SORBI E=1e-05 s/c=0.52 id=16% cov=100% -MSDRDEEmqqvKSIFVEGIPESWDNLKLTEIFSKYGVIQRtvLSHDIQSAKRSDFAFVHYTTHEAAILCLELFDKEELtgNGSKVNIKVSLDKPVRK >UniRef50_Q4DHB4(287-401:416) RNA-binding protein, putative n=2 Tax=Trypanosoma cruzi RepID=Q4DHB4_TRYCR E=4e-05 s/c=0.43 id=16% cov=99% -MRKERRGRTVFLGNMPARFTVQEVKDFVSSVFDAYCARKnedvnkadeereeisvgvavvdlvdflPAPPRVKHRHMFVTLQSKEVAEQVVKLLDAYKL DGVTLRCNFASDKAQR- >UniRef50_A2EJ33(1-83:167) Putative uncharacterized protein n=2 Tax=Trichomonas vaginalis RepID=A2EJ33_TRIVA E=0.0003 s/c=0.56 id=16% cov=81% ----------VYIAHLPDGFEEKEMKKALGEFGTVKNVQLARstKTGNSKHYGWAEFDNPETAKIVAKSFNNYLIFDKKLEAKY-------- >UniRef50_Q0DZR5(188-273:415) Os02g0602600 protein n=4 Tax=Poaceae RepID=Q0DZR5_ORYSJ E=0.0004 s/c=0.54 id=18% cov=57% -----SPDRKLFVDNVPARAAHDELRRLFSRFGEIEAGPLGADRATGQFRGYAIF----------------------------------- >UniRef50_B2WDQ6(219-309:319) RNA binding domain containing protein n=2 Tax=Pleosporineae RepID=B2WDQ6_PYRTR E=3e-10 s/c=0.73 id=16% cov=100% -FDANAPSKTLFIGNMSFEMSDKDLNDLFRDIRnvMDVRVAIDRRTGQPRGFAHADFIDVASATKAKEVLSEKVIYGRQLRIDYSKPGTSEQ >UniRef50_B7QBY1(345-435:440) Putative uncharacterized protein (Fragment) n=1 Tax=Ixodes scapularis RepID=B7QBY1_IXOSC E=7e-07 s/c=0.61 id=16% cov=94% -----NPASRLYVKNVAKGVEVEDLFRIYGGYVDlkselerYTFDIRLMKEGRMKGQAFLTFASESQAERARRDTNGFLLKGRPLVVHFARSAKAK- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * 1619 * 2219 2357 * * * * * * 1919 * * 1 0 * * * * * * 6181 0 0 M 2 4184 * * 4423 3746 * * 2650 * 2479 1523 5478 * * * * 5294 4396 * 4576 2 0 * * * * * * 7599 0 0 E 3 6288 * 2904 1327 * * 4386 * 4393 * * 5846 5895 3803 5613 2101 * * * * 3 0 * * * * * * 8200 0 0 D 4 4772 * 1517 3466 * 6121 * * 4093 6156 * 3247 * 2704 6250 2787 * * 5670 * 4 57 5229 6337 1369 706 * * 8563 1611 0 D 5 6433 * 1505 2859 * 5318 * 6505 4010 5208 * 2761 6180 4760 3887 4459 4786 6204 * 6394 5 0 * * * * * 0 8697 0 1000 G 6 5074 * 3538 3905 * 3199 5376 5395 3543 4268 6842 3788 2872 3792 3925 3280 5061 4860 * * 6 16 6460 * 0 * 0 * 8725 1000 1000 Q 7 4656 * 2749 3006 * * 5749 5168 4286 6669 * 4033 1904 4303 4683 3243 4800 6440 * 6835 7 34 5416 * 1350 718 * * 8974 1824 0 P 8 5075 5173 3986 3849 6662 4405 5318 * 3419 5781 * 3033 2926 4691 4253 2444 4110 5078 * * 8 59 4643 * 1613 571 * * 8983 3010 0 R 9 4852 6572 * * 6889 4844 5694 * 3006 5895 * 2889 5874 5051 1940 4139 2428 * * 3930 9 75 4909 5827 1120 890 * * 9053 2720 0 T 10 4940 5313 * 5769 * * * 4498 3271 * * 4251 * * 3076 2732 1311 4279 * * 10 30 5602 * 971 1029 0 * 9104 1783 1770 L 11 * * * * * * * 1929 * 1153 * * * * * * * 1797 * * 11 0 * * * * * * 9173 0 0 Y 12 * 6650 * * 1271 * 3944 5146 * 4998 6760 * * 7066 5296 * 5477 3948 5130 1770 12 0 * * * * * * 9177 0 0 V 13 5982 5976 * * 5199 * * 1505 * 3738 6039 * * * * * * 1004 * * 13 13 6832 * 0 * * * 9255 1000 0 G 14 5241 5105 5838 4420 6677 1622 5429 * 3018 7230 6938 4172 * 5916 3026 3229 4370 6517 6094 6832 14 0 * * * * * * 9255 0 0 N 15 6063 * 3932 * * 1952 5452 * 7141 * * 917 7016 5965 4942 4812 * * * 6655 15 0 * * * * * * 9261 0 0 L 16 * * * * 5993 * * 2302 6842 812 4138 7037 * * * * 6688 3051 * 6890 16 0 * * * * * * 9261 0 0 S 17 4360 * 3330 5732 7418 4120 7146 * 5496 6107 * 3816 1144 5372 5851 3009 4769 * * * 17 8 * 7421 * * * * 9261 0 0 R 18 4456 6727 4659 4149 3523 5531 4909 7189 3581 4196 6544 4838 2580 5467 4055 3799 4187 5262 5353 3487 18 0 * * * * 0 * 9266 0 1000 D 19 5034 7190 2372 2900 * 4359 5087 * 3726 6113 6003 3549 6842 5926 4020 3081 3136 6776 * 4701 19 47 6047 5886 0 * * * 9261 1736 0 V 20 3055 3794 * * 4352 * 6962 2394 * 4061 4224 * * * * * 2822 1990 4217 * 20 0 * * * * 964 1037 9232 0 1722 T 21 4865 * 2770 4656 * 5410 6226 * 4127 6967 * 3296 6018 6127 4136 2902 1567 5828 * * 21 0 * * * * * 0 9239 0 1000 E 22 4057 6755 3610 1489 6682 * 5169 5466 3417 4902 6971 5620 4056 3953 6517 4696 4529 4071 * * 22 16 6477 * 1585 585 0 * 9239 1000 1000 V 23 3636 * 2588 1729 * 6497 5825 6663 4168 6171 * 4053 4744 4030 4533 4083 4676 5081 * 6181 23 23 5970 * 1290 759 * * 9264 1758 0 L 24 5578 7243 1758 2012 6330 5523 4545 * 4350 5108 5099 5472 * 3248 * 3829 5022 * * 5989 24 9 * 7337 * * * * 9264 0 0 I 25 * 6759 * * 3828 * * 2542 * 900 4465 * * 5623 * * * 2766 * * 25 11 * 7076 * * 0 * 9270 0 1000 L 26 5005 6040 6726 3818 4513 6912 4631 4547 2638 3795 5752 4522 * 4417 2099 5577 4662 4509 7185 4270 26 70 4666 7032 1798 489 0 * 9254 2992 1000 Q 27 3933 * 3022 1944 * 5423 5900 6988 3415 6967 7161 2982 5803 3220 3891 4931 5650 6808 * 6146 27 25 5837 * 662 1442 * 0 9262 1774 1000 L 28 4117 * 7319 4576 2398 * 3989 2896 5106 2093 3988 * * 6967 5889 6505 5199 4186 * 3994 28 28 * 5721 * * * 0 9262 0 1000 F 29 5886 4552 * 6732 865 * * 6394 * 2110 4212 * * * 6484 6900 7164 4590 * 5919 29 41 5618 6983 1496 632 563 1630 9217 2326 2354 S 30 4337 * 4866 2712 4104 3462 5838 * 3701 4137 5529 4143 * 4181 4132 2260 4790 5739 * 6726 30 28 5717 * 1325 735 981 1019 9245 1747 1776 Q 31 4768 7086 3994 3692 6780 4416 5156 5225 2146 6886 6803 4213 3718 3294 4115 3066 4758 * 6908 7064 31 9 7395 * 1000 1000 0 * 9255 1000 1000 I 32 4473 4312 5447 * 2148 4971 3746 3977 5812 3403 6677 6811 7080 5991 * 4718 4382 3701 6064 2698 32 139 3737 5913 2450 292 * * 9264 4750 0 G 33 4248 5263 4684 4852 3574 1324 7279 6196 5657 4731 6986 5205 4327 4982 5233 4404 5447 4517 6902 5542 33 21 7186 7040 1000 1000 1000 1000 9246 1000 1793 P 34 5456 6481 3570 3694 7039 3094 6745 5004 3584 6259 7188 4650 2532 4151 5181 3466 4470 3267 * * 34 55 4732 * 1258 781 944 1058 9237 3273 1824 C 35 3789 6196 6151 3934 4218 5394 6065 2257 4962 3265 6548 4714 4462 6046 6996 5352 4797 2352 6949 6043 35 9 7383 * 1000 1000 * 0 9258 1000 1000 K 36 4861 7241 4711 3265 6705 5037 7139 3073 3375 4209 * 4523 6804 4826 4968 3354 4069 2452 6712 5008 36 29 6313 7075 1991 418 * 0 9258 1708 1000 S 37 4577 6196 3808 4137 5786 4185 5002 4022 3710 5879 * 3688 6116 4419 3412 2912 5398 3113 7179 4466 37 66 4783 6905 1895 452 921 1084 9255 3326 1659 C 38 3322 4089 4332 5703 4481 6927 5785 2823 4747 4326 5551 5357 5522 6754 3646 5163 4405 2344 5880 5197 38 39 5996 6549 2778 227 1019 981 9243 1832 1693 K 39 4355 5882 4329 4704 5816 6100 5170 3012 3187 4057 4080 5506 4526 4764 3298 5138 4411 3354 * 4164 39 28 5694 * 1514 622 0 * 9232 2344 1766 M 40 5161 6187 4979 5004 3501 6849 6174 2686 3909 2652 3873 7036 * 4794 3887 4912 5244 3292 * 4004 40 42 5109 * 3347 149 * * 9264 2806 0 I 41 4388 5657 3592 4652 4145 4929 6198 3059 4504 3905 3685 4623 3637 5093 4437 4183 5290 3221 * 6161 41 55 5081 7002 1583 586 * * 9264 2833 0 T 42 5720 6978 3768 5301 3693 5994 5547 3818 3752 6211 5345 3442 4093 4400 3090 3852 4097 4120 6742 3905 42 11 6991 * 0 * 0 * 9254 1000 1000 E 43 4818 * 2728 4376 6650 4384 4154 5797 3466 4923 5303 3625 4447 3438 3637 3384 5187 5013 * 5014 43 20 6207 * 576 1603 * * 9264 1792 0 H 44 4684 * 5036 4008 7141 3988 4473 5007 2835 4073 5741 3719 3676 4711 3278 3840 3504 5104 * 5543 44 10 7151 * 0 * * * 9264 1000 0 T 45 4482 6099 4408 4131 5496 2210 4307 7201 3827 6736 5503 3689 3992 4195 3481 4291 4052 6159 6765 5653 45 20 6188 * 583 1589 * * 9264 1832 0 S 46 5076 6939 4191 3786 5355 3651 4897 5455 3825 4866 4193 3555 4125 4928 3229 3787 3173 4553 * 7097 46 50 5138 7423 1542 607 * * 9264 2740 0 N 47 4852 5434 4230 5438 4466 3152 4620 5313 2812 6842 4850 3647 3664 5454 4155 2656 4903 6855 * 5786 47 79 4234 * 1021 980 * 0 9269 4200 1000 D 48 5317 * 6294 4246 5126 4611 5271 5436 2308 4869 5608 4133 5229 4407 2404 3647 4056 4381 * 5236 48 52 4823 * 1613 571 * 0 9269 3299 1000 P 49 6116 5033 6124 * 4869 1610 5078 5608 3934 4863 6980 4478 4806 5417 2622 3772 4051 6194 7070 * 49 53 5162 6980 870 1142 0 * 9269 2836 1000 Y 50 5994 4341 4417 4753 2435 3839 4729 4555 4784 4520 4653 7306 5904 5167 4746 5038 4470 3515 * 2784 50 52 5151 7138 2928 203 * 0 9258 2892 1000 C 51 1253 4282 * * 4496 2017 6849 6999 6903 4595 6963 * 6750 * 4406 4666 6455 4649 * 5944 51 35 5380 * 2619 256 * 0 9254 2368 1756 F 52 5889 6097 5034 6127 1297 3951 5902 3896 6966 4228 5770 * * 7007 6012 5876 5502 5966 5142 2460 52 61 4915 6897 1638 559 0 * 9254 2896 1756 V 53 3299 5018 * * 3841 6255 * 2395 * 4191 7195 6675 * 4812 6649 6880 6946 1172 * 5845 53 32 5525 * 425 1969 * 0 9249 2369 1000 E 54 4130 6089 3689 2478 4524 5376 4787 5316 3605 5444 * 3891 * 4340 4192 4461 3001 3896 * 5148 54 22 6024 * 3266 158 0 * 9249 1644 1000 F 55 6769 7051 * 5696 930 * * 5740 * 5433 4234 7009 * * * 4608 6889 5636 * 1906 55 23 6916 7089 1585 585 * * 9264 1000 0 Y 56 3307 5921 3669 3508 5202 5418 5265 5331 3121 4949 4804 4931 4927 4650 5523 2816 4085 3857 * 4868 56 27 5765 * 2055 397 * 0 9261 1723 1000 E 57 5382 * 2174 5482 5438 5649 6901 * 5414 5934 * 3023 * 6744 5048 2213 2057 6761 * 6251 57 10 7114 * 0 * * 0 9261 1000 1000 H 58 3605 * 5506 2924 5738 6995 3983 4063 3705 4032 5071 5856 3185 5433 3239 4183 5357 3355 * 6220 58 11 * 7004 * * 0 * 9261 0 1000 R 59 4038 * 2730 1611 4316 5156 6088 6027 4302 4635 * 4564 * 4544 4599 3711 7084 5640 7085 5361 59 0 * * * * 0 * 9269 0 1000 D 60 2757 * 2055 2559 * 7024 4457 6007 5448 4580 6690 5387 6258 4249 * 3125 4849 4067 * * 60 12 6956 * 1585 585 * * 9264 1000 0 A 61 765 4979 * 5441 * 5387 * 5972 6103 4315 5307 * * 5832 6748 3898 4235 3648 * * 61 14 6650 * 1000 1000 * * 9264 1000 0 A 62 3803 6742 2925 2792 5958 * 7229 4251 3436 4148 6113 4769 6946 3035 4012 4526 4331 3951 6509 7174 62 44 5060 * 1946 433 * * 9264 2955 0 A 63 3694 * 4119 3556 5154 6089 6814 5165 2173 3379 7143 3998 * 4253 2584 5211 5070 5913 * 5609 63 19 6258 * 1000 1000 * * 9264 1000 0 A 64 572 3510 * * * * * 3891 7121 6781 6790 * * * 7009 5721 6409 3207 * * 64 24 5914 * 1298 753 * * 9264 1700 0 L 65 4596 5063 * * 6001 * * 1771 3979 2101 3714 * * * 4456 6509 * 2714 6258 5307 65 70 5862 5063 2804 223 * * 9264 1786 0 A 66 3418 5865 3666 2689 * 5995 5445 * 2742 4954 5446 3616 * 3527 3406 3668 4972 5109 * 6660 66 23 * 5956 * * 0 * 9251 0 2767 A 67 2564 * 5474 3001 5981 4228 4747 4592 2702 4046 5761 4768 * 4188 4489 3998 4407 5331 6130 5798 67 83 6735 4435 2000 415 0 * 9243 1000 1793 M 68 5288 5267 * 5197 3067 6736 * 5303 4976 1288 2404 6957 * * * 5394 4918 5463 * 4343 68 63 5221 5998 1000 1000 0 * 9194 2411 3406 N 69 * * 2417 4463 * * 2758 6472 4358 6637 * 1469 7143 3566 6256 4133 5884 6678 * * 69 25 6954 6757 0 * * 0 9234 1000 1230 G 70 5269 * 5445 4224 * 1099 5952 * 3652 6117 * 2681 5498 4325 4618 5936 5788 * * 5846 70 27 5766 * 521 1722 1172 846 9221 1732 1962 R 71 4501 7071 * 5423 4642 6728 4613 4810 2498 3779 4628 4900 5758 3889 4056 5093 2821 3791 * 3536 71 0 * * * * 0 * 9234 0 1230 K 72 5883 5415 4489 2976 5525 * 5108 3825 3261 3747 4431 4663 4577 4039 3865 4694 3623 3774 * 4726 72 18 6347 * 0 * * * 9264 1716 0 I 73 6160 6510 * * 2186 * * 2075 * 1957 4782 * 6547 * * * * 2842 5518 4263 73 30 5588 * 1422 674 * * 9264 2379 0 L 74 4652 * 2896 4564 5715 2569 4289 6647 3166 3755 4180 3236 5198 4177 3748 7013 * * 6892 6061 74 24 5902 * 590 1575 * * 9264 1824 0 G 75 * 6979 2498 6111 * 853 * * * * * 3084 6575 5821 5366 4033 6011 * * * 75 31 5542 * 1000 1000 * * 9259 2411 0 K 76 5709 4903 * 5442 7042 6724 3709 * 2245 * * 4454 7058 3637 1438 4031 6822 4954 * 6049 76 56 4718 * 1332 730 * * 9259 2908 0 E 77 4553 * 5054 4046 6843 7025 4578 4259 2628 5088 5913 4825 2611 4753 3111 4277 3756 4296 6689 6575 77 37 5295 * 665 1438 * * 9259 2384 0 V 78 * 6251 * * * * * 1369 * 1457 3429 * * * * * * 2923 * 6556 78 0 * * * * * * 9259 0 0 K 79 5908 * 4310 4662 5542 * 4279 3861 2279 5237 6073 3767 * 4495 2152 4871 4057 4446 * 5555 79 12 6889 * 2585 263 * * 9259 1000 0 V 80 4444 4373 * * 5864 6281 * 2183 * 2936 5258 * * * * * * 1004 * * 80 0 * * * * * * 9259 0 0 N 81 5154 5819 3368 2455 5762 4223 4381 * 3894 6019 5480 3496 * 4015 3318 2399 6719 * * * 81 11 7053 * 2807 222 * * 9087 1000 0 W 82 4864 * * 4582 2145 * 7000 3841 4724 4091 5407 * 5224 5737 4163 7201 6456 4908 2671 2394 82 11 * 7040 * * * * 9064 0 0 A 83 733 6490 6867 6730 * 3449 6721 6540 5940 6421 * 6733 6634 * * 2588 5941 5724 * 6864 83 32 5526 * 2000 415 0 * 9024 1775 1000 T 84 4596 6697 4188 3853 * * 5764 5703 1925 5271 6405 3935 * 4477 2466 3612 3518 5847 * 6848 84 0 * * * * * * 8919 0 0 T 85 4290 * 3506 4556 * 3993 6410 * 3702 * * 3404 2029 * 3781 2501 3677 * * * 85 0 * * * * * * 8801 0 0 P 86 5263 * 4127 3602 6224 4337 5983 * 1862 * * 6262 2383 3565 2928 4396 6327 * * * 86 0 * * * * * * 8622 0 0 S 87 4649 * 4076 5130 * 3693 6339 * 2645 * * 3369 2233 4469 6696 2447 4044 * * 6103 87 0 * * * * * * 8575 0 0 S 88 4062 * 5807 3484 * 4051 * * 2879 4892 6003 3333 4978 3064 4576 2269 4078 5147 * * 88 0 * * * * * * 8424 0 0 Q 89 5799 * 4811 3170 * * 5910 * 1929 * 4759 * 4870 2433 1942 5642 5676 * * * 89 0 * * * * * * 8168 0 0 K 90 * * * 3961 * * * * 1522 * * * * 3023 1106 * * * * * 90 0 * * 0 * * * 7422 0 0 //