HHsearch 1.5 NAME d2atza1 FAM FILE d2atza1 COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d2atza1.a3m DATE Mon Mar 8 16:03:34 2010 LENG 176 match states, 176 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.8 EVD 0.3944 -1.4414 SEQ >ss_dssp CCCCCCSCCCCSCEEEECSSSCEEEEETTEEEEECEEEECSCCCHHHHHHHHTTSSCEEEESSBTTTEESCEEEEECSSCHHHHHHHHHHHHHHTTCCCE EEEECSSTTCEEEEECCCSEEHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCCCEEEESCTTSCGGGCEEECCCEEEEEECCCCCCC >sa_dssp ECEECEBECCDDBBBCDDEDECEECECEEEDCDCDCDDCEDEBCDECCDDACEEECCAAABBBCEEDDABBAAABADBEDBEDABDCABDBADEDECCDA AAACCDDECCABAAACDCEBDBDEACECADCAAEDBDEEBEDDBDBBABEEBBDDCABACBBBDCCCDCDDEEEEE >ss_pred CCEEEEEEECCCCEEEECCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHEECCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCE EEECCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHCCCCCC >ss_conf 9704899960772266537711125437831477899888642089999852061687411015888254899985399789999999999864075412 5543688745999998066545679999999879987401022100636337200166531099864431530349 >Consensus xxxxxlikintsHYxiKrxxivekixyxgrtFynKFerixexLtxslixxHlxrxitiAhxLilxgdkveniVfdYnGrxpeRFyhxaqlLlReegxxnf taYxxKtpghlhlyihkghttLxEaxqlxxxlSxkLxqxLxKeWkxfPsxxxPkefNIltLPykxxxkergxswxk >d2atza1 EXELKLIKIDTSHYFEKKPGLGERVDYAGRCFYNKFQRVNAXLTSSLIQKHLKREIEIAHNLILRNDKVENIVFDYNGRNPERFYHKAQLLLREEGFXNF TAYNTKTPGHLHLYVHKGHTELGEGERLVKTLSXKLAQGLPKEWKVFPSNEWPKEFNILALPYEVFAKERGSSWAK >UniRef50_A7GX49(8-178:180) Putative uncharacterized protein n=9 Tax=Epsilonproteobacteria RepID=A7GX49_CAMC5 E=9e-59 s/c=1.33 id=60% cov=98% -----LIKINTSHYWIKRDNIVSKIEYKGKTFFNKFERIDEPLNYSVIKEHEEGKITVAHSLILPGDKVENIVFDYNGRTPERFWHRAQLLLREEGYINF TAYESKTPGHLHLYIHKGHTTLNEAYQLANMLSMKLSQRLAKEWRMFPTMDMPKEFNILTLPYKLYQKERGASWSK >UniRef50_A6Q7H7(6-163:165) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Sulfurovum sp. NBC37-1 RepID=A6Q7H7_SULNB E=7e-55 s/c=1.35 id=27% cov=90% ------LELNDGHYYIKRKTIVEKIHFDNRTFYAKFELIEESLTPLLLTQHLNRQYTIAAPLLNEGGLTNYLVLEYRGDEHQRFYYLVKQLFRTLSIEDY HIYQGKHEETIQVFIEVKPLTLEEADQALQKISDTLKEKLGKKWKTLPSASLPEAYNIVTLPHK------------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 X 2 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 2 * * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 L 4 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 K 5 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1301 0 0 I 7 * * * * * * * 706 * 1369 * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1829 0 0 K 8 * * * 1369 * * * * 706 * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1829 0 0 I 9 * * * * * * * 706 * 1369 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1829 0 0 D 10 * * 1699 * * * * * * * * 531 * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1829 0 0 T 11 * * 1369 * * * * * * * * * * * * * 706 * * * 11 0 * * * * * * 1829 0 0 S 12 * * * * * 1369 * * * * * * * * * 706 * * * * 12 0 * * * * * * 1829 0 0 H 13 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1829 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1829 0 0 F 15 * * * * 1699 * * * * * * * * * * * * * 1714 1369 15 0 * * * * * * 1829 0 0 E 16 * * * 1699 * * * 531 * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1829 0 0 K 17 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1829 0 0 K 18 * * * * * * * * 1699 * * * * * 531 * * * * * 18 0 * * * * * * 1829 0 0 P 19 * * 1714 * * * * * 1369 * * * 1699 * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1829 0 0 G 20 * * * * * 1699 * * * * * 1714 * * * * 1369 * * * 20 0 * * * * * * 1829 0 0 L 21 * * * * * * * 531 * 1699 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1829 0 0 G 22 * * * * * 1699 * * * * * * * * * * * 531 * * 22 0 * * * * * * 1829 0 0 E 23 * * * 525 * * * * * * * * * * * 1714 * * * * 23 0 * * * * * * 1829 0 0 R 24 * * * * * * * * 531 * * * * * 1699 * * * * * 24 0 * * * * * * 1829 0 0 V 25 * * * * * * * 531 * * * * * * * * * 1699 * * 25 0 * * * * * * 1829 0 0 D 26 * * 1699 1714 * * 1369 * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1829 0 0 Y 27 * * * * 1369 * * * * * * * * * * * * * * 706 27 0 * * * * * * 1829 0 0 A 28 1699 * 1369 * * * * * 1714 * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1829 0 0 G 29 * * * * * 706 * * * * * 1369 * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1829 0 0 R 30 * * * * * * * * 1714 * * * * * 525 * * * * * 30 0 * * * * * * 1829 0 0 C 31 * 1699 * * * * * * * * * * * * * * 531 * * * 31 0 * * * * * * 1829 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1829 0 0 Y 33 * * * * 1714 * * * * * * * * * * * * * * 525 33 0 * * * * * * 1829 0 0 N 34 1369 * * * * * * * * * * 706 * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1829 0 0 K 35 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1829 0 0 F 36 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1829 0 0 Q 37 * * * 531 * * * * * * * * * 1699 * * * * * * 37 0 * * * * * * 1829 0 0 R 38 * * * * * * * * * 1369 * * * * 706 * * * * * 38 0 * * * * * * 1829 0 0 V 39 * * * * * * * 531 * * * * * * * * * 1699 * * 39 0 * * * * * * 1829 0 0 N 40 * * 1714 1369 * * * * * * * 1699 * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1829 0 0 A 41 1699 * * 531 * * * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1829 0 0 X 42 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * 42 0 * * * * * * 1599 0 0 L 43 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1829 0 0 T 44 * * * * * * * * * * * 1714 * * * * 525 * * * 44 0 * * * * * * 1829 0 0 S 45 * * * * * * * * * * * * 1369 * * 1699 * * * 1714 45 0 * * * * * * 1829 0 0 S 46 * * * * * * * * * 1369 * * * * * 706 * * * * 46 0 * * * * * * 1829 0 0 L 47 * * * * * * * * * 525 * * * * * * * 1714 * * 47 0 * * * * * * 1829 0 0 I 48 * * * * * * * 706 * 1369 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1829 0 0 Q 49 * * * * * * * * 1714 * * * * 1699 * * 1369 * * * 49 0 * * * * * * 1829 0 0 K 50 * * * 1714 * * * * 1699 * * * * 1369 * * * * * * 50 0 * * * * * * 1829 0 0 H 51 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1829 0 0 L 52 * * * 1714 * * * * * 525 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1829 0 0 K 53 * * * 1714 * * * * 1699 * * 1369 * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1829 0 0 R 54 * * * * * 1714 * * * * * * * * 525 * * * * * 54 0 * * * * * * 1829 0 0 E 55 * * * 1699 * * * * 1714 * * * * 1369 * * * * * * 55 0 * * * * * * 1829 0 0 I 56 * * * * * * * 706 * * * * * * * * * * * 1369 56 0 * * * * * * 1829 0 0 E 57 * * * 1699 * * * * * * * * * * * * 531 * * * 57 0 * * * * * * 1829 0 0 I 58 * * * * * * * 525 * * * * * * * * * 1714 * * 58 0 * * * * * * 1829 0 0 A 59 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1829 0 0 H 60 1369 * * * * * 706 * * * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1829 0 0 N 61 * * * * * * * * * * * 1699 1369 * * 1714 * * * * 61 0 * * * * * * 1829 0 0 L 62 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1829 0 0 I 63 * * * * * * * 706 * 1369 * * * * * * * * * * 63 0 * * * * * * 1829 0 0 L 64 * * * * * * * * * 706 * 1369 * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1829 0 0 R 65 * * * 1369 * * * * * * * * 1714 * 1699 * * * * * 65 0 * * * * * * 1829 0 0 N 66 * * * * * 531 * * * * * 1699 * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1829 0 0 D 67 * * 706 * * 1369 * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1829 0 0 K 68 * * * * * * * * 706 1369 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1829 0 0 V 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 1369 706 * * 69 0 * * * * * * 1829 0 0 E 70 * * * 706 * * * * * * * 1369 * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1829 0 0 N 71 * * * * * * * * * * * 706 * * * * * * * 1369 71 0 * * * * * * 1829 0 0 I 72 * * * * * * * 706 * 1369 * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1829 0 0 V 73 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 73 0 * * * * * * 1829 0 0 F 74 * * * * 706 * * * * 1369 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1829 0 0 D 75 * * 706 1369 * * * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1829 0 0 Y 76 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 76 0 * * * * * * 1829 0 0 N 77 * * * * * * * * * * * 706 * * 1369 * * * * * 77 0 * * * * * * 1829 0 0 G 78 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1829 0 0 R 79 * * 1369 * * * * * * * * * * * 706 * * * * * 79 0 * * * * * * 1829 0 0 N 80 * * * 1369 * * * * * * * 1699 * * * * 1714 * * * 80 0 * * * * * * 1829 0 0 P 81 * * * * * * 1369 * * * * * 706 * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1829 0 0 E 82 * * * 706 * * * * * * * * * 1369 * * * * * * 82 0 * * * * * * 1829 0 0 R 83 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 83 0 * * * * * * 1829 0 0 F 84 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1829 0 0 Y 85 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1714 525 85 0 * * * * * * 1829 0 0 H 86 * * * * * * 706 * * * * * * * * * * * * 1369 86 0 * * * * * * 1829 0 0 K 87 * * * * * * * * 1699 1369 * * * * 1714 * * * * * 87 0 * * * * * * 1829 0 0 A 88 706 * * * * * * * * * * * * * * * * 1369 * * 88 0 * * * * * * 1829 0 0 Q 89 * * * * * * * * 1369 * * * * 706 * * * * * * 89 0 * * * * * * 1829 0 0 L 90 * * * * * * * * * 706 * * * 1369 * * * * * * 90 0 * * * * * * 1829 0 0 L 91 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1829 0 0 L 92 * * * * 1369 * * * * 706 * * * * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1829 0 0 R 93 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 93 0 * * * * * * 1829 0 0 E 94 * * * 706 * * * * * * * * * * * * 1369 * * * 94 0 * * * * * * 1829 0 0 E 95 * * * 706 * * * * * 1369 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1829 0 0 G 96 * * * * * 706 * * * * * * * * * 1369 * * * * 96 0 * * * * * * 1829 0 0 F 97 * * * * 1699 * * 1369 * * * * * * * * * * * 1714 97 0 * * * * * * 1829 0 0 X 98 * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 1599 0 0 N 99 * * 1369 * * * * * * * * 706 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1829 0 0 F 100 * * * * 706 * * * * * * * * * * * * * * 1369 100 0 * * * * * * 1829 0 0 T 101 * * * * * * 1369 * * * * * * * * * 706 * * * 101 0 * * * * * * 1829 0 0 A 102 706 * * * * * * 1369 * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1829 0 0 Y 103 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 103 0 * * * * * * 1829 0 0 N 104 * * * 1714 * * * * * * * 1699 * 1369 * * * * * * 104 0 * * * * * * 1829 0 0 T 105 * * * * * 1369 * * * * * * * * * 1714 1699 * * * 105 0 * * * * * * 1829 0 0 K 106 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1829 0 0 T 107 * * * * * * 1369 * * * * * * * * * 706 * * * 107 0 * * * * * * 1829 0 0 P 108 * * * 1369 * * * * * * * * 706 * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1829 0 0 G 109 * * * 1369 * 706 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1829 0 0 H 110 * * * * * * 706 * * * * * * * * * 1369 * * * 110 0 * * * * * * 1829 0 0 L 111 * * * * * * * 1369 * 706 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1829 0 0 H 112 * * * * * * 706 * * * * * * 1369 * * * * * * 112 0 * * * * * * 1829 0 0 L 113 * * * * * * * * * 706 * * * * * * * 1369 * * 113 0 * * * * * * 1829 0 0 Y 114 * * * * 1369 * * * * * * * * * * * * * * 706 114 0 * * * * * * 1829 0 0 V 115 * * * * * * * 531 * * * * * * * * * 1699 * * 115 0 * * * * * * 1829 0 0 H 116 * * * 1369 * * 706 * * * * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1829 0 0 K 117 * * * * * * * * 706 * * * * * * * * 1369 * * 117 0 * * * * * * 1829 0 0 G 118 * * * * * 706 * * 1369 * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1829 0 0 H 119 * * * * * * 706 * * * * * 1369 * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1829 0 0 T 120 * * * * * * * * * 1369 * * * * * * 706 * * * 120 0 * * * * * * 1829 0 0 E 121 * * * 1699 * * * * * * * * * * * * 531 * * * 121 0 * * * * * * 1829 0 0 L 122 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1829 0 0 G 123 * * * 1369 * 1699 * * * * * 1714 * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1829 0 0 E 124 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1829 0 0 G 125 531 * * * * 1699 * * * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1829 0 0 E 126 * * 1369 1699 * * * * * * * * * * * * * * * 1714 126 0 * * * * * * 1829 0 0 R 127 * * * * * * * * * * * * * 531 1699 * * * * * 127 0 * * * * * * 1829 0 0 L 128 1369 * * * * * * * * 706 * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1829 0 0 V 129 1714 * * * * * * * * 1369 * * * * * * * 1699 * * 129 0 * * * * * * 1829 0 0 K 130 * * * * * * * * 1699 * * 1714 * 1369 * * * * * * 130 0 * * * * * * 1829 0 0 T 131 * * * * * * * * 1369 * 1714 * * * * * 1699 * * * 131 0 * * * * * * 1829 0 0 L 132 * * * * * * * 1369 * 706 * * * * * * * * * * 132 0 * * * * * * 1829 0 0 S 133 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 133 0 * * * * * * 1829 0 0 X 134 * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 134 0 * * * * * * 1599 0 0 K 135 * * * * * * * * 706 * * * * * * * 1369 * * * 135 0 * * * * * * 1829 0 0 L 136 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 1829 0 0 A 137 1699 * * * * * * * 1369 * * * * * * 1714 * * * * 137 0 * * * * * * 1829 0 0 Q 138 * * * 1369 * * * * * * * * * 706 * * * * * * 138 0 * * * * * * 1829 0 0 G 139 * * * * * 1699 * * 1369 * * * * * 1714 * * * * * 139 0 * * * * * * 1829 0 0 L 140 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 1829 0 0 P 141 1714 * * * * 1369 * * * * * * 1699 * * * * * * * 141 0 * * * * * * 1829 0 0 K 142 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 142 0 * * * * * * 1829 0 0 E 143 * * * 706 * * * * 1369 * * * * * * * * * * * 143 0 * * * * * * 1829 0 0 W 144 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 144 0 * * * * * * 1829 0 0 K 145 * * * * * * * * 525 * * * * * 1714 * * * * * 145 0 * * * * * * 1829 0 0 V 146 * * * * * * * * * * 1714 * * * * * 1369 1699 * * 146 0 * * * * * * 1829 0 0 F 147 * * * * 706 * * * * 1369 * * * * * * * * * * 147 0 * * * * * * 1829 0 0 P 148 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 148 0 * * * * * * 1829 0 0 S 149 * * * * * * * * * * * * * * * 525 1714 * * * 149 0 * * * * * * 1829 0 0 N 150 1369 * * * * * * * * * 1714 1699 * * * * * * * * 150 0 * * * * * * 1829 0 0 E 151 * * 1714 1699 * * * * * * * * * * * 1369 * * * * 151 0 * * * * * * 1829 0 0 W 152 * * * * * * * * * 1369 1714 * * * * * * * 1699 * 152 0 * * * * * * 1829 0 0 P 153 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 153 0 * * * * * * 1829 0 0 K 154 * * * 1369 * * * * 706 * * * * * * * * * * * 154 0 * * * * * * 1829 0 0 E 155 1369 * * 706 * * * * * * * * * * * * * * * * 155 0 * * * * * * 1829 0 0 F 156 * * * * 706 * * * * * * * * * * * * * * 1369 156 0 * * * * * * 1829 0 0 N 157 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 157 0 * * * * * * 1829 0 0 I 158 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 158 0 * * * * * * 1829 0 0 L 159 * * * * * * * * * 706 * * * * * * * 1369 * * 159 0 * * * * * * 1829 0 0 A 160 1699 * * * * * * * * * * * * * * * 531 * * * 160 0 * * * * * * 1829 0 0 L 161 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 161 0 * * * * * * 1829 0 0 P 162 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 162 0 * * * * * * 1829 0 0 Y 163 * * * * * * 1369 * * * * * * * * * * * * 706 163 0 * * * * * * 1829 0 0 E 164 * * * 1699 * * * * 531 * * * * * * * * * * * 164 0 * * * * * * 1829 0 0 V 165 * * * * * * * * * 975 * * * * * * * 1026 * * 165 0 * * * * * * 1301 0 0 F 166 * * * * 1026 * * * * * * * * * * * * * * 975 166 0 * * * * * * 1301 0 0 A 167 1026 * * * * * * * * * * * * 975 * * * * * * 167 0 * * * * * * 1301 0 0 K 168 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 168 0 * * * * * * 1301 0 0 E 169 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 169 0 * * * * * * 1301 0 0 R 170 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 170 0 * * * * * * 1301 0 0 G 171 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 171 0 * * * * * * 1301 0 0 S 172 975 * * * * * * * * * * * * * * 1026 * * * * 172 0 * * * * * * 1301 0 0 S 173 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 173 0 * * * * * * 1301 0 0 W 174 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 174 0 * * * * * * 1301 0 0 A 175 1026 * * * * * * * * * * * * * * 975 * * * * 175 0 * * * * * * 1301 0 0 K 176 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 176 0 * * 0 * * * 1301 0 0 //