HHsearch 1.5 NAME d1zuea1 FAM FILE d1zuea1 COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1zuea1.a3m DATE Mon Mar 8 20:33:44 2010 LENG 41 match states, 41 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.3 EVD 0.4858 2.6420 SEQ >ss_dssp CCCCCCBTTTTTCEEEETTCSSCCBCSSCBCSSTTEEEECC >sa_dssp EEEEDDCAEEEECECDEDECEECEEDDEBECEEEEDCBADE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCC >ss_conf 92244631122563114344775136798634898511269 >Consensus xfxxxqxcxxxxgvcrdksxxnckxxaxtycenxnqxccxy >d1zuea1 IFFEMQACWSHSGVCRDKSERNCKPMAWTYCENRNQKCCEY >UniRef50_P0C8B2(26-66:66) Ornithorhynchus venom defensin-like peptide A n=5 Tax=Ornithorhynchus anatinus RepID=DLPA_ORNAN E=1e-06 s/c=1.32 id=57% cov=102% FFYGRQPCSYYDGVCRDKSDVNCKYIAFTYCENPNQRCCYY # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * I 1 * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1333 0 0 F 2 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1333 0 0 F 3 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 3 0 * * * * * * 1333 0 0 E 4 * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1333 0 0 M 5 * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * 5 0 * * * * * * 1333 0 0 Q 6 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 6 0 * * * * * * 1333 0 0 A 7 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1333 0 0 C 8 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1333 0 0 W 9 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * 9 0 * * * * * * 1333 0 0 S 10 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 10 0 * * * * * * 1333 0 0 H 11 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 11 0 * * * * * * 1333 0 0 S 12 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 12 0 * * * * * * 1333 0 0 G 13 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1333 0 0 V 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 14 0 * * * * * * 1333 0 0 C 15 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1333 0 0 R 16 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 16 0 * * * * * * 1333 0 0 D 17 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1333 0 0 K 18 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1333 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 19 0 * * * * * * 1333 0 0 E 20 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1333 0 0 R 21 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * 21 0 * * * * * * 1333 0 0 N 22 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1333 0 0 C 23 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1333 0 0 K 24 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1333 0 0 P 25 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 25 0 * * * * * * 1333 0 0 M 26 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1333 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1333 0 0 W 28 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * 28 0 * * * * * * 1333 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1333 0 0 Y 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 30 0 * * * * * * 1333 0 0 C 31 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1333 0 0 E 32 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1333 0 0 N 33 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1333 0 0 R 34 * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * 34 0 * * * * * * 1333 0 0 N 35 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1333 0 0 Q 36 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 36 0 * * * * * * 1333 0 0 K 37 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 37 0 * * * * * * 1333 0 0 C 38 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1333 0 0 C 39 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1333 0 0 E 40 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 40 0 * * * * * * 1333 0 0 Y 41 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 41 0 * * 0 * * * 1333 0 0 //