HHsearch 1.5 NAME d1ztda1 FAM FILE d1ztda1 COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1ztda1.a3m DATE Mon Mar 8 23:49:37 2010 LENG 124 match states, 124 columns in multiple alignment FILT 3 out of 7 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.5 EVD 0.4130 -0.5597 SEQ >ss_dssp CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCCCCCCCHHHHHHHHHHHTGGGGCCGGGTTCHHHHHHHHHHHHHHTTSSCHHHHHHHHHTTCCGGGGCTTTH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCC >sa_dssp ECEEDCAEDADDBACDAACCABCDDCEEEDDCEBCEDAACCAADDCCBBEEBEEEBDECCADCABBCBADADEEECBDDECBBCBACEDBEEDBEDEEEC EDCAADAABCAADCABEDCEEDEE >ss_pred CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9246888877899999999999997378777858747899999987468743651234714799999999998554107999999984167776235544 568888899999999988763059 >Consensus xxdKgLaxlGDSLiNFlySlALtefxGrPTGxrVPnxsLAiAxexxxLskxlxrxdkhakGdxaEAxiAyAWLxGxxsxeEaVExlxxnxxxxvlxxxxx keaxgxalxxllxxixxrlxxxxx >d1ztda1 EIDKGLAKFGDSLINFLYSLALTEFLGKPTGDRVPNASLAIALELTGLSKNLRRVDKHAKGDYAEALIAKAWLMGLISEREAVEIIKKNLYPEVLDFSKK KEAIGRALAPLLVIISERLYSSQV >UniRef50_C5A5J1(103-220:222) Putative uncharacterized protein n=9 Tax=Thermococcaceae RepID=C5A5J1_THEGJ E=7e-48 s/c=1.62 id=57% cov=95% --DKGLSTLGDSLINFIYSLALSEFTGRPTGGRVPNSSLAIAIERAKLRHLVpPRTDKHGKGDIAEAIIAYAWLEGAFTIEEAVEVLRANFTEDVLHPYR SKEALGVALGELLRLIGKRL----- >UniRef50_A1RX42(16-102:124) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Thermofilum pendens Hrk 5 RepID=A1RX42_THEPD E=5e-09 s/c=0.72 id=49% cov=66% ---KELARLGDSLVNFLVSAALT-LIGRPTGVKVPGETLARAFLSSRLSK-LGKPRGIAPGEAMEAFLAYAWLKGSLSCEESVEML-------------- ------------------------ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * E 1 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 I 2 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 D 3 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1345 0 0 K 4 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1617 0 0 G 5 * * * 1513 * 622 * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1617 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1617 0 0 A 7 576 * * * * * * * * * * * * * * 1602 * * * * 7 0 * * * * * * 1617 0 0 K 8 * * * * * * * * 1643 * * * * * 1513 * 1602 * * * 8 0 * * * * * * 1617 0 0 F 9 * * * * 1643 * * * * 557 * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1617 0 0 G 10 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1617 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1617 0 0 S 12 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 12 0 * * * * * * 1617 0 0 L 13 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1617 0 0 I 14 * * * * * * * 622 * * * * * * * * * 1513 * * 14 0 * * * * * * 1617 0 0 N 15 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1617 0 0 F 16 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1617 0 0 L 17 * * * * * * * 1602 * 576 * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1617 0 0 Y 18 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1513 * 622 18 0 * * * * * * 1617 0 0 S 19 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 19 0 * * * * * * 1617 0 0 L 20 1513 * * * * * * * * 622 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1617 0 0 A 21 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1617 0 0 L 22 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1617 0 0 T 23 * * * * * * * * * * * * * * * 1602 576 * * * 23 622 * 1513 * * * * 1617 0 0 E 24 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * 0 * 1345 0 1000 F 25 * * * * 622 * * * * 1513 * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1617 0 0 L 26 * * * * * * * 1513 * 1643 * * * * * * 1602 * * * 26 0 * * * * * * 1617 0 0 G 27 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1617 0 0 K 28 * * * * * * * * 1643 * * * * * 557 * * * * * 28 0 * * * * * * 1617 0 0 P 29 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1617 0 0 T 30 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 30 0 * * * * * * 1617 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1617 0 0 D 32 * * 1643 * * 1602 * * * * * * * * * * * 1513 * * 32 0 * * * * * * 1617 0 0 R 33 * * * * * * * * 1513 * * * * * 622 * * * * * 33 0 * * * * * * 1617 0 0 V 34 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 34 0 * * * * * * 1617 0 0 P 35 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1617 0 0 N 36 * * * * * 1513 * * * * * 622 * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1617 0 0 A 37 1643 * * 1513 * * * * * * * * * * * 1602 * * * * 37 0 * * * * * * 1617 0 0 S 38 * * * * * * * * * * * * * * * 622 1513 * * * 38 0 * * * * * * 1617 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1617 0 0 A 40 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1617 0 0 I 41 * * * * * * * 622 * * * * * * 1513 * * * * * 41 0 * * * * * * 1617 0 0 A 42 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1617 0 0 L 43 * * * * 1513 * * 1602 * 1643 * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1617 0 0 E 44 * * * 622 * * * * * 1513 * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1617 0 0 L 45 * * * * * * * * * 1643 * * * * 1602 1513 * * * * 45 0 * * * * * * 1617 0 0 T 46 1602 * * * * * * * * * * * * * * 1513 1643 * * * 46 0 * * * * * * 1617 0 0 G 47 * * * * * 1643 * * 1602 * * * * * 1513 * * * * * 47 0 * * * * * * 1617 0 0 L 48 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1617 0 0 S 49 * * * * * * * * * * * * * * 1602 576 * * * * 49 0 * * * * * * 1617 0 0 K 50 * * * * * * 1602 * 576 * * * * * * * * * * * 50 622 * 1513 * * * * 1617 0 0 N 51 * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * 51 0 * * * * 0 * 1345 0 1000 L 52 * * * * * * * * * 576 * * * * * * * 1602 * * 52 576 1602 * 0 * * * 1617 1000 0 R 53 * * * * * 1513 * * * * * * 1602 * 1643 * * * * * 53 0 * * * * * * 1617 0 0 R 54 * * * * * * * * 1513 * * * * * 622 * * * * * 54 0 * * * * * * 1617 0 0 V 55 * * * * * * * * * * * * 1513 * * * 1602 1643 * * 55 0 * * * * * * 1617 0 0 D 56 * * 622 * * * * * * * * * * * 1513 * * * * * 56 0 * * * * * * 1617 0 0 K 57 * * * * * 1513 * * 622 * * * * * * * * * * * 57 0 * * * * * * 1617 0 0 H 58 * * * * * * 622 1513 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1617 0 0 A 59 576 * * * * 1602 * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1617 0 0 K 60 * * * * * * * * 622 * * * 1513 * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1617 0 0 G 61 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1617 0 0 D 62 * * 622 1513 * * * * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1617 0 0 Y 63 1513 * * * * * * 1602 * * * * * * * * * * * 1643 63 0 * * * * * * 1617 0 0 A 64 622 * * * * * * * * * 1513 * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1617 0 0 E 65 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 65 0 * * * * * * 1617 0 0 A 66 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1617 0 0 L 67 * * * * 1513 * * 1602 * 1643 * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1617 0 0 I 68 * * * * * * * 622 * 1513 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1617 0 0 A 69 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 69 0 * * * * * * 1617 0 0 K 70 * * * * * * * * 1643 * * * * * * * * * * 557 70 0 * * * * * * 1617 0 0 A 71 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1617 0 0 W 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 72 0 * * * * * * 1617 0 0 L 73 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 73 0 * * * * * * 1617 0 0 M 74 * * * 1602 * * * * 1513 * 1643 * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1617 0 0 G 75 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1617 0 0 L 76 1602 * * * * * * * * 1643 * * * * * 1513 * * * * 76 0 * * * * * * 1617 0 0 I 77 * * * * 1602 * * 1643 * 1513 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1617 0 0 S 78 * * * * * * * * * * * * * * * 576 1602 * * * 78 0 * * * * * * 1617 0 0 E 79 * 1513 * 1643 * * * 1602 * * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1617 0 0 R 80 * * * 557 * * * * * * * * * * 1643 * * * * * 80 0 * * * * * * 1617 0 0 E 81 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 81 0 * * * * * * 1617 0 0 A 82 622 * * * * * * * * * * * * * * 1513 * * * * 82 0 * * * * * * 1617 0 0 V 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 83 0 * * * * * * 1617 0 0 E 84 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1617 0 0 I 85 * * * * * * * 1643 * * 1513 * * * * * * 1602 * * 85 0 * * * * * * 1617 0 0 I 86 * * * * * * * 1643 * 557 * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1617 0 0 K 87 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 87 0 * * * * * * 1345 0 0 K 88 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1345 0 0 N 89 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1345 0 0 L 90 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1345 0 0 Y 91 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 91 0 * * * * * * 1345 0 0 P 92 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1345 0 0 E 93 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1345 0 0 V 94 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 94 0 * * * * * * 1345 0 0 L 95 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 95 0 * * * * * * 1345 0 0 D 96 * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1345 0 0 F 97 * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1345 0 0 S 98 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 98 0 * * * * * * 1345 0 0 K 99 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 99 0 * * * * * * 1345 0 0 K 100 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 100 0 * * * * * * 1345 0 0 K 101 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1345 0 0 E 102 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1345 0 0 A 103 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1345 0 0 I 104 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1345 0 0 G 105 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 105 0 * * * * * * 1345 0 0 R 106 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * 106 0 * * * * * * 1345 0 0 A 107 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1345 0 0 L 108 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1345 0 0 A 109 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 109 0 * * * * * * 1345 0 0 P 110 * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1345 0 0 L 111 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 111 0 * * * * * * 1345 0 0 L 112 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1345 0 0 V 113 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * 113 0 * * * * * * 1345 0 0 I 114 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1345 0 0 I 115 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1345 0 0 S 116 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 116 0 * * * * * * 1345 0 0 E 117 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1345 0 0 R 118 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 118 0 * * * * * * 1345 0 0 L 119 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1345 0 0 Y 120 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 120 0 * * * * * * 1000 0 0 S 121 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 S 122 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 123 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 V 124 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 124 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //