HHsearch 1.5 NAME d1qhma_ FAM FILE d1qhma_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1qhma_.a3m DATE Wed Mar 10 04:04:11 2010 LENG 611 match states, 611 columns in multiple alignment FILT 120 out of 133 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 5.0 EVD 0.3221 -8.0385 SEQ >ss_dssp CHHHHHHTTTCCCSGGGTSCCHHHHHHHSCCCCCCCGGGCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSCSEEEEEEECCSSSSCCCCSCTTTCSSCCCSSSS TTEEEECGGGCHHHHHHHHHHTTCCCCHHHHHHHHHTSCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHTSEECCCCSSCCCCCCCCTHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHTT HHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCSSCCCSHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCTTCCCBSCHHHHHHHHHHHHTTTSSCHHHHHH HHHHHHHHHHHCCCCCCGGGSTTTTCCCCCCCEEEECBCTTSCBCCCHHHHHHHHHHHHSCCCSSSCEEEEECTTSCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHH HHHHHHTCSCEECCTTSCCEETTTEEEEECCEEEHHHHHHHHHTTTEETTTTEECSCCCCCCCSSSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HCCCHHHHTTSCSSCEEEEEECEESHHHHHHHHHHHHHSEEEEEECTTSCEEEEEEESCCCCSSSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSCCGGGCEEEECS CCCCCCCCCCC >sa_dssp EECCEDABEEBDCCEACEDBCBCBABBDCBDCCECDCECCCECCECADDACDEBCECCEDBEEDECBDCBBCDDCACBCDBECBCCDEDDBBABABBADD CBBBBABACBBBECBDDABEDCEDECDEDBDDCBEEEDDBABCAADDDBCECADCADEBCAADEBBBCCBAABAAAAAABAAAAAADCBBECADEBCEDB DDDCEEDDEDEDBDCBCEBACDACDBACCACEBADDBECEACCBADDADCAAABABAAAAAAAABBBABABAABBAABABABAACCBCDEEDBDCDDAAC BBAAAAAABBBBCBBBBEEDCCECEBDCBCAABAAAABADDEDBBAACAAAAAABAADCBCEBECBBBBAACAEEBBEDACEBADCACEEBEBBDDDDAC DCBDECECBBAABACEBCBACBADBABABABDACACCABCABBAAACBBEEECDABDDDECBDDEDBDCECABECACEBADCAAEBAACAACBAADBABE BBBACBABAAACCEBEBBABBBBCDBDDAACDAAABDDCEBDBDDCEECBADEDDDEDECBDDDEECEDACEBBCCABECABEBADECEBBCEAEBCCDD CEEDEEEEEEE >ss_pred CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCH HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCH HHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEE ECCCCCCCCCC >ss_conf 9754321025447881000448999850598577852225680178899999999878877751386577887654312357553256544452024612 2212216404599999988860778765689999988765433355527589998752253125755455663046689999732688999899864356 7886422408999989999999999899899999986444234776689999999999999800478874560003111217898388748989899999 9999999753544443265433157877761589502178888354887899999999730468982899988998689999999984578973675551 3202441488477653303558986776653000688776775387064324101356667420015899999999999999999996168999999853 0822125530476421363556311799988999999985107999988651653104798768889478999999999999998506887898234102 01214566889 >Consensus xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxnxxxxxxxxxxlxxxtxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxyixxxxxxixgxqxxx xxxxxxxpxxxxxxxxxxxxxxxxxxdxxxxxixxxxxktxxdxxxxxxxxexxxarxxxxxtglxdaygxgxiixdyxxxxxxGxxxlxxxxxxxxxxx xxxxxxxxxxxxxxxxxxexxxqxxxxxelxxxaxxxxxxxxxPArTFxEAiQxxwfxhlxxxxExngxaiSxGRlDQyLyPYYkkDiexGxiTxEeAxE LleclxIKxxexxxxrsxxxxxxxaGxpxxqnitIGGxxxdGxDAtNeLSyliLeAxxxlxxlxqPnLsVRxhxxtPexflrxxxevxxgxgxPaxxNDe viipxlxarDYaixGCVExxixGkxxxxxxaxiNlaKiLElaLNxGxDxxtGxqvgxxtxxxxxxxxsfeelxxafxkqlxxxixxxvxxxniixxxxxx xxxxxxxSxlxdgxxxxxxgxgxxGlaxvaDSLaAIKklvfdxxxxxxalxxnfexxxxxPKYGNDddxvDxiaxxvxxxyxdxixxxknxRGgxyxxgx xxitxnVpxGk >d1qhma_ NEKLATAWEGFTKGDWQNEVNVRDFIQKNYTPYEGDESFLAGATEATTTLWDKVMEGVKLENRTHAPVDFDTAVASTITSHDAGYINKQLEKIVGLQTEA PLKRALIPFGGIKMIEGSCKAYNRELDPMIKKIFTEYRKTHNQGVFDVYTPDILRCRKSGVLTGLPDAYGRGRIIGDYRRVALYGIDYLMKDKLAQFTSL QADLENGVNLEQTIRLREEIAEQHRALGQMKEMAAKYGYDISGPATNAQEAIQWTYFGYLAAVKSQNGAAMSFGRTSTFLDVYIERDLKAGKITEQEAQE MVDHLVMKLRMVRFLRTPEYDELFSGDPIWATESIGGMGLDGRTLVTKNSFRFLNTLYTMGPSPEPNMTILWSEKLPLNFKKFAAKVSIDTSSLQYENDD LMRPDFNNDDYAIACCVSPMIVGKQMQFFGARANLAKTMLYAINGGVDEKLKMQVGPKSEPIKGDVLNYDEVMERMDHFMDWLAKQYITALNIIHYMHDK YSYEASLMALHDRDVIRTMACGIAGLSVAADSLSAIKYAKVKPIRDEDGLAIDFEIEGEYPQFGNNDPRVDDLAVDLVERFMKKIQKLHTYRDAIPTQSV LTITSNVVYGK >UniRef50_B8FDB2(203-685:823) Formate C-acetyltransferase n=1 Tax=Desulfatibacillum alkenivorans AK-01 RepID=B8FDB2_DESAA E=2e-14 s/c=0.17 id=24% cov=70% ---------------------------------------------------------------------------------------------------- ------------------------------------------------------------------DLYARDRLKAD----ALEDGTRLNADQRAFYKSV RTIILGIRNMASNLAAEAEKKAAAQGValerrKELLEAAEACLHAPYYPARTFKEGLQACWLVHMAMNLEDFEQGLSFGRLDRILLPLYKADLKKGLLTY EKAVEIMASFQLKTCETIPIYSERIDQYFSGNGVAQGITVGGVNGGGRDCTNELSGLVLDAFSQI-KTREPALHVRVHKKTPPWFLEKAAAVAAlgcgkp sffgDKAVIKaLENTGMSKPHAR--DYAVIGCVEMASQGRTYNSSdAALFNLPLCLELALNQGY--RFGSRRIPAlrfGAP-TPSVEEMD----AFDQVL RAFKTQVRDSVNemvkVITMIEQAYRVHRTT----PVNSIITQGClecgkdvtwggamydltsvQAAGLADAGDSLYALKRVVFDEKRMSLKAFVDIlks nwegqeklrqEISQKFPRYGNGDKDADRMTQVAADAYTDAVTAHKNSRGGQYIAGIYSMTCHHGFGK >UniRef50_UPI00016BFDA6(126-606:766) pyruvate formate-lyase n=1 Tax=Epulopiscium sp. 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