HHsearch 1.5 NAME d1oi6a_ FAM FILE d1oi6a_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1oi6a_.a3m DATE Tue Mar 9 00:29:40 2010 LENG 202 match states, 202 columns in multiple alignment FILT 120 out of 242 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 5.7 EVD 0.4311 -0.5036 SEQ >ss_dssp CEEEECSSTTCEEEECCCEEETTEEECCSCCHHHHHHHHSSCCCCCCEEEEEEECTTBEEEEEEECTTTCCCEEEEEEESCEEEEEECCCBTCTTTTCEE EEEECSSSCCEEEECTTCEEEEEECSTTEEEEEEESSCCCGGGEEECCTTCTTTCCSCCCSSCCBCCHHHHTCCCHHHHHHTTCSCBHHHHHHHHHHHTC CC >sa_dssp DEDDEBDADDABBACBEDEEDEEDEDCDCCCEEBADEDCEBCCBEDDDECECDBEDBBBDBACABDCECBBABBACBDDBDACAAAAAAACEBECCDDCC CBDACDEDBCAAAAAABBABAAAACDEDABACBCBBDDDCEECBCCACBEBEEBEBDBECEDECDCDEDBDECCCBDDADEDEDCBDCECACDBBEEDBD EE >ss_pred CEEEECCCCCEEEEECCEEEECCEEEEEEECHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEE EEEECCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHC CC >ss_conf 9026786786399826603247803875338888887417887642688996527973888751589856413899878859999997889787433489 9997798863999469704368852897099984588648511211478661137888889885218788249987787523789855442567888635 88 >Consensus mxxxxtxIxGvxiixxxxxxDxRGxfxexxxxxxfxxxxxxxxxxxxQxnxSxsxxgvlRGlHxqxxpxxqxKlvxcixGxixdVxVDlRxxSpTfgxxx xvxLsxxnxxxlxIPxGxaHGFxxLxdxaxvxYxxxxxyxpxxexgixxxDpxlxIxWpxxxxpilSxkDxxxpxlxexxxxxxxpxxxxxxxxxxxxxx xx >d1oi6a_ MQARKLAVDGAIEFTPRVFADDRGLLILPYQEEAFVEAHGGPLFRVAQTIHSMSKRGVVRGIHYTVTPPGTAKYVYCARGKAMDIVIDIRVGSPTFGQWD SVLMDQQDPRAVYLPVGVGHAFVALEDDTVMSYMLSRSYVTQDELALSALDPALGLPIDIGVEPIVSDRDRVAITLAEAQRQGLLPDYTTSQEIERRLTA VP >UniRef50_C7P2L5(2-152:154) dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme n=2 Tax=Halobacteriaceae RepID=C7P2L5_HALMD E=1e-10 s/c=0.45 id=24% cov=73% -------ISGVTLRDLQTNTDERGHLVEVYREDW-DEYDPSPQM----SYYSMTYPGVTRAWH--KHHHGQIDHFVCPKGRIKVGVYDDREDSPSQGELD TFVIGEHNQKVIRIPGECWHGFKAIGDEPAFLInfpsKLYDYENPDEER--LPYDTD-KIPLDWDEKP-------------------------------- ------ >UniRef50_B0VEW2(21-197:207) Putative dTDP-6-deoxy-D-glucose-3,5-epimerase n=1 Tax=Candidatus Cloacamonas acidaminovorans RepID=B0VEW2_9BACT E=2e-55 s/c=1.23 id=24% cov=88% MKIEETSLEGVLIIHLDPKIDKRGYFLR-FWDETILSAYNLPQRWCEESISYSKYKNTLRGLHFQYQPFAQSKFISLIKGYISDVVVNIDLDSPNYGKWQ LFELSDKEPLALFIPANYAHGFVTRTEDCYLIYKMDKPYNPLFEDGIIWNDKDLGINWKVSA-PILSQRDSGFKTLNE---------------------- -- >UniRef50_B0T597(9-187:189) dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase n=1 Tax=Caulobacter sp. 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>UniRef50_C7M4B0(4-141:144) WxcM domain protein n=1 Tax=Capnocytophaga ochracea DSM 7271 RepID=C7M4B0_CAPOD E=5e-13 s/c=0.55 id=23% cov=54% -------------IQGEIFTDHRGQIS-SLNDFVFEEVE---RFYFIH----HPDKNVVRGWHGHQH---EKKWFYCVKGSFTIALVqpDDWNNPSTNLP ADIIQLSEKDSKILCVPEGYANCIKAGEDNSILL------------------------------------------------------------------ ---- >UniRef50_Q5N291(47-153:171) Putative uncharacterized protein n=4 Tax=Chroococcales RepID=Q5N291_SYNP6 E=3e-09 s/c=0.60 id=16% cov=39% ---------------------------------------------------------------------------------------------------- ---LSDPKREVVRIPPGIPHGAVNLSGEPCLLVNAVIRHGEPCDRDYRPLQPPLPYDWAAIQQALQS--------LRSPRQPQPLPRQR----------- -- >UniRef50_Q9RZB1(27-170:182) Lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative n=4 Tax=Deinococci RepID=Q9RZB1_DEIRA E=2e-23 s/c=0.77 id=18% cov=71% -------IEGVWFHSLKKNRSENGAFMEYVRLDENGVQNLPGQLVPRQISVSWAAPKRINAFHIHVK-EEQNEIWCVLQGQLTIWLVDCRAGSPTVGVKR 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