HHsearch 1.5 NAME d1niga_ FAM FILE d1niga_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1niga_.a3m DATE Mon Mar 8 15:57:39 2010 LENG 146 match states, 146 columns in multiple alignment FILT 4 out of 8 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 2.0 EVD 0.3765 -2.4747 SEQ >ss_dssp CCCEEEETTTTEEEETTCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCSSHHHHHHHHHHHHHHHHTTTCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHTCHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHTSTTTTTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EDEEDDADCDECDBCDEBCABDACDCADCACDCADDACECEDCCECAEDACEAADCACDDBDEDDBDEDCCCDAEDCEDDEDDDDEBDEEDDEBBCCABD ABDBACCABECADDACECDDAEEDADEEBADBACCAACAAADBBDE >ss_pred CCCCHHCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >ss_conf 9830102001114897635899999999999997568761477589999999999987531144777999986010412320178851176547999999 9998889999998642067899860366899999999999541369 >Consensus mxxxrYCxviDxxlpxdhxxFxyrseixxxxaflGLAVSEgxkVxexrexlDilDtlxxxLyDxxLxdxxxKxLxxxxexWxDIxeKxxnGxkxtxYlxl AxsxlxxAvxxlxxlxxxexFxdxixexxixxmxKlxxxIxxexlg >d1niga_ MDIKRYCPVTDSELPADHVYFKFRSEIEAAEAYLGLAISEGIKVRETREILDIIDTVYNSLSDSKLNDFQEKRLNFTEEDWYDIKEKANNGNRWSLYMFL ARSAVDSAVYWSYRMKETEEFKEIVKEEMISKLLKAGYVILRESLG >UniRef50_Q97BU3(4-151:155) Putative uncharacterized protein TVG0351555 n=2 Tax=Thermoplasma RepID=Q97BU3_THEVO E=8e-51 s/c=1.36 id=66% cov=101% MENVRYCPVIDDNLPLDHVFFKFRSEIESAEAFIGLAVSEGVKVNETRELLDMLDTVYNSLYDeeSKLNEFQEKRLKFTEEEWYDIKEKCNSGSKWSLYL MLARSHIDNAVYWLSKLREDERFVNKVSDENIMALYKIGAVILREGLG >UniRef50_UPI000038E37D(9-151:155) hypothetical protein Faci_03271 n=1 Tax=Ferroplasma acidarmanus fer1 RepID=UPI000038E37D E=6e-17 s/c=0.62 id=32% cov=97% -----YCELIDRNLPPDHDFFLYESHVKIVKSFLGLAVSEARNVEKLRTMLDILDTLNQNLYDNEtvLADNVRKQLRRETKEWIDIDQKMDNGDKYTAYL VLAASNLRIALSYLWRLSKLPDFSDHITEYPLEFMQKLINMINNEAMG >UniRef50_Q6L129(4-145:150) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Picrophilus torridus RepID=Q6L129_PICTO E=5e-41 s/c=1.18 id=37% cov=97% -----YCDIIDDYIDIRSPYFAYREEINLTMAFLGLAVSEGSKVPEIKECIDILDVLTQHLYDKNvvLKDSVRKSLNHEDESWLDITEKMENGNKTTAYM FAAAAHLRLAINYITDMENDERFKDFIDDYTINYMLKLVLRIKNTGI- # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * M 1 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1262 0 0 D 2 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1262 0 0 I 3 * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1262 0 0 K 4 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * 4 0 * * * * * * 1262 0 0 R 5 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 5 0 * * * * * * 1262 0 0 Y 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 6 0 * * * * * * 2039 0 0 C 7 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 2039 0 0 P 8 * * 1904 1853 * * * * * * * * 1133 * * * * * * * 8 0 * * * * * * 2039 0 0 V 9 * * * * * * * 1904 * 1853 * * * * * * * 1133 * * 9 0 * * * * * * 2039 0 0 T 10 * * * * * * * 380 * * * * * * * * 2111 * * * 10 0 * * * * * * 2039 0 0 D 11 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 2039 0 0 S 12 * * 1024 * * * * * * * * * * * 1853 2111 * * * * 12 0 * * * * * * 2039 0 0 E 13 * * * 2111 * * * * * * * 997 * * * * * * * 1904 13 0 * * * * * * 2039 0 0 L 14 * * * * * * * 1904 * 449 * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 2039 0 0 P 15 * * 1904 * * * * * * * * * 449 * * * * * * * 15 0 * * * * * * 2039 0 0 A 16 2111 * * * * * * 1904 * 2156 * * 1853 * * * * * * * 16 0 * * * * * * 2039 0 0 D 17 * * 449 * * * * * * * * * * * 1904 * * * * * 17 0 * * * * * * 2039 0 0 H 18 * * * * * * 449 * * * * * * * * 1904 * * * * 18 0 * * * * * * 2039 0 0 V 19 * * 1853 * * * * * * * * * 1904 * * * * 1133 * * 19 0 * * * * * * 2039 0 0 Y 20 * * * * 997 * * * * * * * * * * * * * * 1003 20 0 * * * * * * 2039 0 0 F 21 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 2039 0 0 K 22 1904 * * * * * * * 1133 1853 * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 2039 0 0 F 23 * * * * 1133 * * * * * * * * * * * * * * 878 23 0 * * * * * * 2039 0 0 R 24 * * * 1853 * * * * * * * * * * 468 * * * * * 24 0 * * * * * * 2039 0 0 S 25 * * * 1904 * * * * * * * * * * * 449 * * * * 25 0 * * * * * * 2039 0 0 E 26 * * * 468 * * 1853 * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 2039 0 0 I 27 * * * * * * * 468 * * * * * * * * * 1853 * * 27 0 * * * * * * 2039 0 0 E 28 * * * 1133 * * * * 1853 * * 1904 * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 2039 0 0 A 29 2111 * * * * * * 1853 * 1904 * * * * * 2156 * * * * 29 0 * * * * * * 2039 0 0 A 30 1133 * * * * * * * * * * * * * * * 1904 1853 * * 30 0 * * * * * * 2039 0 0 E 31 * * * 1133 * * * * 1853 * 1904 * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 2039 0 0 A 32 468 * * * * * * * * * * * * * * 1853 * * * * 32 0 * * * * * * 2039 0 0 Y 33 * * * * 380 * * * * * * * * * * * * * * 2111 33 0 * * * * * * 2039 0 0 L 34 * * * * * * * 2156 * 367 * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 2039 0 0 G 35 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 2039 0 0 L 36 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 2039 0 0 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 2039 0 0 I 38 * * * * * * * 2111 * * * * * * * * * 380 * * 38 0 * * * * * * 2039 0 0 S 39 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 39 0 * * * * * * 2039 0 0 E 40 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 2039 0 0 G 41 1853 * * * * 468 * * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 2039 0 0 I 42 * * * * * * * 2111 * * * * * * 1853 1904 * 2156 * * 42 0 * * * * * * 2039 0 0 K 43 * * * * * * * * 468 * * 1853 * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 2039 0 0 V 44 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 44 0 * * * * * * 2039 0 0 R 45 * * * 1853 * * * * * * * 2156 1904 * 2111 * * * * * 45 0 * * * * * * 2039 0 0 E 46 * * * 468 * * * * 1853 * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 2039 0 0 T 47 * * * * * * * 1904 * 1853 * * * * * * 1133 * * * 47 0 * * * * * * 2039 0 0 R 48 * * * * * * * * 1904 * * * * * 449 * * * * * 48 0 * * * * * * 2039 0 0 E 49 * * * 468 * * * * * * * * * * * * 1853 * * * 49 0 * * * * * * 2039 0 0 I 50 * 1904 * * * * * 2111 * 2156 1853 * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 2039 0 0 L 51 * * * * * * * 1904 * 449 * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 2039 0 0 D 52 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 2039 0 0 I 53 * * * * * * * 367 * * 2156 * * * * * * * * * 53 0 * * * * * * 2039 0 0 I 54 * * * * * * * 2111 * 380 * * * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 2039 0 0 D 55 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 55 0 * * * * * * 2039 0 0 T 56 * * * * * * * * * * * * * * * * 449 1904 * * 56 0 * * * * * * 2039 0 0 V 57 * * * * * * * * * 878 * * * * * * * 1133 * * 57 0 * * * * * * 2039 0 0 Y 58 * * * * * * * * * * * 1853 * * * * 1904 * * 1133 58 0 * * * * * * 2039 0 0 N 59 * * * * * * * * * * * 1133 * 878 * * * * * * 59 0 * * * * * * 2039 0 0 S 60 * * * * * * 1904 * * * * 1853 * * * 1133 * * * * 60 0 * * * * * * 2039 0 0 L 61 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 61 0 * * * * * * 2039 0 0 S 62 * * * * * * * * * * * * * * * 2111 * * * 380 62 0 * * * * * * 2039 0 0 D 63 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 63 367 2156 * 1000 1000 * * 2039 1000 0 S 64 * * * * * * * * 1904 * * 1853 * * * 1133 * * * * 64 0 * * * * * * 2039 0 0 K 65 * * * 1853 * * * * 1133 * * 1904 * * * * * * * * 65 1133 878 * 1000 1000 * * 2039 1508 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 2039 0 0 N 67 1853 * * * * * * * 1904 * * 1133 * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 2039 0 0 D 68 * * 367 2156 * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 2039 0 0 F 69 * * * * 1133 * * * * * * 1853 * * * 1904 * * * * 69 0 * * * * * * 2039 0 0 Q 70 * * * * * * * * * * * * * 1133 * * * 878 * * 70 0 * * * * * * 2039 0 0 E 71 * * * 1133 * * * * * * * * * * 878 * * * * * 71 0 * * * * * * 2039 0 0 K 72 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 2039 0 0 R 73 * * * * * * * * * * * * * 1853 1133 1904 * * * * 73 0 * * * * * * 2039 0 0 L 74 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 2039 0 0 N 75 * * * * * * * * 2156 * * 1003 * * 1853 * * * * * 75 0 * * * * * * 2039 0 0 F 76 * * * * 1133 * 1904 * * * * * * * 1853 * * * * * 76 0 * * * * * * 2039 0 0 T 77 * * * 878 * * * * * * * * * * * * 1133 * * * 77 0 * * * * * * 2039 0 0 E 78 * * 1904 1133 * * * * * * * * * * * * 1853 * * * 78 0 * * * * * * 2039 0 0 E 79 * * * 468 * * * * 1853 * * * * * * * * * * * 79 0 * * * * * * 2039 0 0 D 80 * * 2111 997 * * * * * * * * * * * 1904 * * * * 80 0 * * * * * * 2039 0 0 W 81 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 81 0 * * * * * * 2039 0 0 Y 82 * * * * * * * 1853 * 1904 * * * * * * * * * 1133 82 0 * * * * * * 2039 0 0 D 83 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 2039 0 0 I 84 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 2039 0 0 K 85 * * 1853 * * * * * 1133 * * * * * * * 1904 * * * 85 0 * * * * * * 2039 0 0 E 86 * * * 468 * * * * * * * * * 1853 * * * * * * 86 0 * * * * * * 2039 0 0 K 87 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 87 0 * * * * * * 2039 0 0 A 88 2111 2156 * * * * * * * * 878 * * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 2039 0 0 N 89 * * 1853 1904 * * * * * * * 1133 * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 2039 0 0 N 90 * * * * * * * * * * * 367 * * * 2156 * * * * 90 0 * * * * * * 2039 0 0 G 91 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 2039 0 0 N 92 * * 1853 * * * * * * * * 1003 * * * 2156 * * * * 92 0 * * * * * * 2039 0 0 R 93 * * * * * * * * 380 * * * * * 2111 * * * * * 93 0 * * * * * * 2039 0 0 W 94 * * * * * * * * * * * * * * * * 1904 * 1133 1853 94 0 * * * * * * 2039 0 0 S 95 * * * * * * * * * * * * * * * 1133 878 * * * 95 0 * * * * * * 2039 0 0 L 96 878 * * * * * * * * 1133 * * * * * * * * * * 96 0 * * * * * * 2039 0 0 Y 97 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 97 0 * * * * * * 2039 0 0 M 98 * * * * * * * * * 997 1003 * * * * * * * * * 98 0 * * * * * * 2039 0 0 F 99 * * * * 1003 * * * * * 2156 * * * * * * 1853 * * 99 0 * * * * * * 2039 0 0 L 100 1904 * * * * * * * * 449 * * * * * * * * * * 100 0 * * * * * * 2039 0 0 A 101 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 2039 0 0 R 102 878 * * * * * * * * * * * * * 1133 * * * * * 102 0 * * * * * * 2039 0 0 S 103 1904 * * * * * * * * * * * * * * 449 * * * * 103 0 * * * * * * 2039 0 0 A 104 2111 * * * * * 1024 * * * * 1853 * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 2039 0 0 V 105 * * * * * * * 2156 * 878 * * * * * * * 2111 * * 105 0 * * * * * * 2039 0 0 D 106 * * 1133 * * * * * * * * * * * 878 * * * * * 106 0 * * * * * * 2039 0 0 S 107 * * * * * * * 1853 * 1904 * 2156 * * * 2111 * * * * 107 0 * * * * * * 2039 0 0 A 108 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 2039 0 0 V 109 * * * * * * * 1904 * 1853 * * * * * * * 1133 * * 109 0 * * * * * * 2039 0 0 Y 110 * * * * * * * * * * * 1904 * * * 1853 * * * 1133 110 0 * * * * * * 2039 0 0 W 111 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1133 878 111 0 * * * * * * 2039 0 0 S 112 * * * * * * * 1904 * 997 * * * * * 2111 * * * * 112 0 * * * * * * 2039 0 0 Y 113 * * * * * * * * * * * * * * * 2156 1904 * 1853 2111 113 0 * * * * * * 2039 0 0 R 114 * * 1904 * * * * * 2156 * * * * * 976 * * * * * 114 0 * * * * * * 2039 0 0 M 115 * * * * * * * * * 997 1003 * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 2039 0 0 K 116 * * * 1904 * * * * 2111 * * * * * 2156 1853 * * * * 116 0 * * * * * * 2039 0 0 E 117 * * * 1133 * * * * 1853 * * 1904 * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 2039 0 0 T 118 * * 1024 * * * * * * 1853 * * * * * * 2111 * * * 118 0 * * * * * * 2039 0 0 E 119 * * * 468 * * * * * * * * 1853 * * * * * * * 119 0 * * * * * * 2039 0 0 E 120 * * 1853 2111 * * * * * * * * * * 1024 * * * * * 120 0 * * * * * * 2039 0 0 F 121 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 2039 0 0 K 122 * * * * * * * * 1003 * * * * * * 1853 * 2156 * * 122 0 * * * * * * 2039 0 0 E 123 * * 878 2111 * * * * * * * 2156 * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 2039 0 0 I 124 * * * * 1904 * 1853 2111 2156 * * * * * * * * * * * 124 0 * * * * * * 2039 0 0 V 125 * * * * * * * 878 * * * * * * * * * 1133 * * 125 0 * * * * * * 2039 0 0 K 126 * * 1904 * * * * * 2111 * * * * * * 2156 1853 * * * 126 0 * * * * * * 2039 0 0 E 127 * * 1024 976 * * * * * * * * * * * * * * * * 127 0 * * * * * * 2039 0 0 E 128 * * * 1133 * * * * * * * * * * * * * * * 878 128 0 * * * * * * 2039 0 0 M 129 * * * * * * * * * * 2111 2156 1853 * * * 1904 * * * 129 0 * * * * * * 2039 0 0 I 130 * * * * * * * 468 * 1853 * * * * * * * * * * 130 0 * * * * * * 2039 0 0 S 131 * * * 1853 * * * * * * 2156 1904 * * * 2111 * * * * 131 0 * * * * * * 2039 0 0 K 132 2156 * * * 1853 * * * 2111 * * * * * * * * * * 1904 132 0 * * * * * * 2039 0 0 L 133 * * * * * * * * * 1133 878 * * * * * * * * * 133 0 * * * * * * 2039 0 0 L 134 * * * * * * * * * 1003 * * * 1853 * * * * * 2156 134 0 * * * * * * 2039 0 0 K 135 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 135 0 * * * * * * 2039 0 0 A 136 2111 * * * * * * 2156 * 878 * * * * * * * * * * 136 0 * * * * * * 2039 0 0 G 137 * * * * * 1133 * 1853 * * * * * * * * * 1904 * * 137 0 * * * * * * 2039 0 0 Y 138 2156 * * * * * * * * 1904 * 1853 * * * * * * * 2111 138 0 * * * * * * 2039 0 0 V 139 * * * * * * * * * * 1853 * * * 1904 * * 1133 * * 139 0 * * * * * * 2039 0 0 I 140 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 140 0 * * * * * * 2039 0 0 L 141 * * * * * * * * 1904 1133 * 1853 * * * * * * * * 141 0 * * * * * * 2039 0 0 R 142 * * * * * * * * * * * 878 * * 1133 * * * * * 142 0 * * * * * * 2039 0 0 E 143 * * * 449 * * * * * * * * * * * * 1904 * * * 143 0 * * * * * * 2039 0 0 S 144 1853 * * * * 1024 * * * * * * * * * 2111 * * * * 144 0 * * * * * * 2039 0 0 L 145 * * * * * * * 1904 * 1133 1853 * * * * * * * * * 145 0 * * * * * * 2039 0 0 G 146 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 146 0 * * 0 * * * 1744 0 0 //