HHsearch 1.5 NAME d1iaka1 FAM FILE d1iaka1 COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1iaka1.a3m DATE Tue Mar 9 00:16:41 2010 LENG 100 match states, 100 columns in multiple alignment FILT 112 out of 871 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 8.2 EVD 0.4209 -1.6438 SEQ >ss_dssp CCCCCCEEEEEESSCCCTTSCEEEEEEEEEECSSCCEEEEEETTEECCTTEEECCCEECTTSCEEEEEEEEECCCSSCCEEEEEECTTCSSCEEEEECCC >sa_dssp EEDDDBEBDCDCEDECEEDEEBCABACADCACCDDBEBDACDDEEECEEDDEDCECDECEEEBCCBCACBEBDBCEECCABACBDBECCEEDDDDDCDCE >ss_pred CCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCEECCCCCEECCCEECCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEC >ss_conf 9878777999327754579708999999858887627799667899467725032120478607899999980442888999998376888549998409 >Consensus axxxpPxVxixpxxxxxxgxxxtLxCxxxgxxPxxixvxWxkxgxxixxxxxxxxxxxxxdgxxxxxsxlxvxxxxxxxyxCxvxHxxlxxplxxxxxxx >d1iaka1 ATNEAPQATVFPKSPVLLGQPNTLICFVDNIFPPVINITWLRNSKSVTDGVYETSFFVNRDYSFHKLSYLTFIPSDDDIYDCKVEHWGLEEPVLKHWEPE >UniRef50_P97797(147-242:513) Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1 n=14 Tax=Euarchontoglires RepID=SHPS1_MOUSE E=9e-06 s/c=0.54 id=18% cov=94% AKPSPPEVS-GPADRGIPDQKVNFTCKSHGFSPRNITLKWFKDGQEL-HHLETTVNPSGKNVSYNISSTVRVVLNSMDVHSkviCEVAHITLDRSPLR-- --- >UniRef50_Q8HWE7(242-321:395) MHC I like leukocyte 1 n=71 Tax=Murinae RepID=Q8HWE7_MOUSE E=6e-05 s/c=0.61 id=20% cov=65% ----------------------TLTCRAFRLYTRVATLTWLQYRKPVQQKtFGSETILPSGDGTYQAWVSIRVLPGQESQFSCNLKH------------- - >UniRef50_Q5U495(441-543:772) LOC495513 protein n=3 Tax=Xenopus RepID=Q5U495_XENLA E=2e-07 s/c=0.55 id=20% cov=82% --------------DVYVGTEAEIQCNISGYFPDKLTVTWYKKKENGKEELVNNggryqipdiQSQYQPDWTLTCTARLLFSPslteEHGTQFICRVKHP SLGEEIER----- >UniRef50_B7PZA3(481-565:805) Down syndrome cell adhesion molecule, putative (Fragment) n=1 Tax=Ixodes scapularis RepID=B7PZA3_IXOSC E=0.0004 s/c=0.54 id=19% cov=83% ----PPSITPFSfPEKPQLGSRASVTCSVpEGDAP--IRLSWLRDGVPISSSSSPGVTLGHVDDFISTLVFKSLREEHTAVYTCLASNEA---------- -- >UniRef50_B7QHG7(263-355:1009) Nephrin, putative (Fragment) n=1 Tax=Ixodes scapularis RepID=B7QHG7_IXOSC E=3e-05 s/c=0.53 id=15% cov=61% -----------------------------------VDVAWKLDGSAVQPASDQSTVQTKEGWVTSSNLTITLTRQviDSFSFTCLAESQKLQETVIQ--- -- >UniRef50_B0WQT6(2000-2090:3710) Serrate protein n=1 Tax=Culex quinquefasciatus RepID=B0WQT6_CULQU E=0.0002 s/c=0.52 id=16% cov=90% ---ESPVLELYPTEPqvIKVGESTRLSCRATAGVPYPTLKWVRRDRRPLSTRVTQDYPG--------VITLREVTLDDAGEYECRAENSAGSTSLSASID VQ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * A 1 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 5353 0 0 T 2 4508 * * * * * * 4513 2990 3567 4673 * 2205 * * 4344 1960 2840 * * 2 0 * * * * * * 5967 0 0 N 3 3803 * * 3644 5032 4854 * * 3341 * * 1953 3279 * 4783 4737 2905 3773 * 4547 3 0 * * * * * * 6491 0 0 E 4 1993 * 4384 1870 * 5546 * * 5608 * * * * 5326 5571 3025 3331 3092 * * 4 0 * * * * * * 7456 0 0 A 5 2146 * * * * * * * 3290 * 6525 * 830 5950 5277 5920 5263 6189 * * 5 30 * 5600 * * * * 7927 0 0 P 6 * * * 5797 * * * * * * * * 45 * * 6319 * * * * 6 26 5821 * 0 * * 0 8129 1000 1000 Q 7 4987 * * 3167 * 6046 6376 5107 2567 3926 6080 * 6435 3848 3690 2561 3206 3285 6290 * 7 35 5393 * 744 1311 0 * 8169 1567 1000 A 8 6498 * * * 5235 * * 1915 * 3885 4254 * 5987 * * 5484 5131 970 * * 8 30 6610 6579 0 * * * 8221 1000 0 T 9 3933 * 5488 3427 5697 * 4120 4709 3846 4089 * * * 3920 4227 2012 2731 5489 * 4811 9 98 4248 6265 485 1809 * 0 8234 2711 1000 V 10 3761 * * * 5034 5613 * 1958 6128 2318 6504 * 4511 6377 6716 6597 * 1739 5885 * 10 145 5146 3898 2365 311 0 * 8229 1644 1661 F 11 * * 6069 3496 2019 3817 6109 4439 * 3896 6541 6017 6303 4988 4732 3284 4918 4834 6245 2653 11 101 4484 5451 838 1182 287 2472 8166 2633 3311 P 12 4822 * * 5529 5699 4858 6510 6391 * 3516 6322 * 1214 4551 5029 2726 3366 6153 * * 12 45 5034 * 0 * 0 * 8529 2179 1935 K 13 3767 * 5483 3215 5515 * 5398 * 3507 4392 * 4505 2548 4362 4299 2055 4306 * * 6686 13 30 5615 * 2546 271 * * 8542 1600 0 S 14 4345 6648 4063 2953 * 4997 3540 * 3161 4840 * 3992 4820 3468 3917 2534 5643 5071 6553 * 14 138 3456 * 434 1946 * * 8630 4088 0 P 15 3995 6616 4329 2458 * * 6373 6137 5115 5258 * 4824 1899 5346 3819 3208 3580 5412 * * 15 109 3781 * 740 1317 * * 8647 3667 0 V 16 2886 * 6427 3876 5424 4241 * 3695 5862 2891 5135 5713 4818 6709 5281 4711 5102 1766 * * 16 76 4278 * 1185 836 * * 8646 3136 0 L 17 4959 * 3909 2770 6878 5738 5593 5334 3397 3726 6671 5527 4347 3677 3661 3445 4565 3392 5365 5640 17 58 6671 5075 1000 1000 * * 8646 1000 0 L 18 3457 * 6510 2603 5105 4238 5546 4681 4549 2963 * 4542 3262 4411 4604 4348 4244 3963 6743 6737 18 85 4654 5838 1047 954 0 * 8633 2739 2281 G 19 4506 * * 4028 * 988 6278 * 5252 5797 6461 3074 6626 4793 4127 4097 5766 5437 * * 19 58 5087 6676 421 1983 939 1064 8745 2180 1594 Q 20 4696 * 3180 2337 * 3607 6118 * 3008 * 6459 3967 6570 2625 4252 3867 4802 5172 * * 20 28 6779 6622 1585 585 * 0 8731 1000 1770 P 21 5699 * 5238 2827 * 6859 5638 5166 3263 5939 * 4646 3081 4462 4602 2403 2669 4746 * 6971 21 0 * * * * 1538 609 8729 0 2328 N 22 2022 * * 6054 6491 6059 5912 3778 6520 3969 6555 3609 5285 4274 5626 4548 5629 1760 * * 22 42 5714 6661 1020 981 * 0 8736 1603 1746 T 23 5661 * 5719 4189 6878 * 6333 5816 3718 5294 5778 4950 5504 5470 6564 3508 1146 3160 * 6790 23 51 5942 5754 578 1599 0 * 8749 1703 2306 L 24 * * * * 3245 * * 2812 * 718 5383 * * * * * * 3740 * 4462 24 11 * 7086 * * 0 * 8713 0 1298 I 25 5180 6778 6837 3917 * 6793 6625 4640 5145 3520 5811 4578 5938 4357 4973 2683 1779 3329 * 6591 25 28 5684 * 1304 749 0 * 8726 1756 1000 C 26 5147 90 * * * 6630 * * * 6582 * * * * * * * * * 6391 26 0 * * * * * * 8654 0 0 F 27 5178 * 6050 4430 5897 6697 3296 4294 4876 2728 5651 5479 6701 3963 3400 2980 3820 3303 5731 5771 27 12 * 6938 * * * * 8654 0 0 V 28 1498 * * * 5386 * * 2652 * 4894 6841 * * * * 3351 5018 1778 * * 28 33 5485 * 0 * 0 * 8651 1653 1000 D 29 4317 * 5235 3761 6937 5619 5549 * 2958 6765 6632 3559 6017 6836 3697 2196 3068 4206 5653 4210 29 0 * * * * * * 8654 0 0 N 30 5409 * 3086 5225 * 1211 5233 * 3996 * * 2911 5481 5369 5071 3455 * * * 6629 30 53 * 4790 * * * * 8654 0 0 I 31 5101 6041 4932 * 1311 3314 * 5796 * 5267 5580 5538 * * 6210 2925 6385 5967 5786 2819 31 54 6594 5228 2000 415 * 0 8547 1000 2503 F 32 4892 * 5076 * 2585 * 4140 * 4045 6782 6787 4752 3259 * 5623 2745 * 5558 * 1726 32 38 5878 6772 606 1544 1300 752 8551 1681 3626 P 33 6414 * 6675 5022 * 6028 6915 * 5159 4253 * 5210 479 5762 5927 5044 5353 6717 * * 33 50 * 4865 * * 0 * 8582 0 3011 P 34 3219 * 3561 2930 * 4731 6230 6488 3063 3879 5819 4816 2109 * 4167 4316 6820 * 6701 5833 34 33 6957 6095 1000 1000 1857 466 8601 1000 2698 V 35 3035 * 3036 3755 6710 3780 4704 3701 4717 5757 * 3453 3330 5288 4649 3721 4469 4304 * * 35 108 7075 3945 0 * 0 * 8596 1000 3028 I 36 3727 * * 6240 4770 * 6385 1401 6711 2772 6282 * 3866 6280 * 5144 3947 2911 7037 * 36 72 * 4369 * * 0 * 8536 0 4067 N 37 4629 * 5972 2630 7124 6488 5179 5669 3951 4641 5612 3324 5341 4397 3444 2773 3035 4957 5213 * 37 0 * * * * 2195 355 8550 0 3036 I 38 * * * * 3179 * * 2664 5469 2203 3843 * 6276 * * * 5436 1481 5661 6930 38 0 * * * * 392 2072 8540 0 2662 T 39 6860 * * 4331 5025 * 4725 5063 3630 4645 6631 6446 * 3546 3401 2837 1918 4998 4577 4542 39 0 * * * * 0 * 8585 0 1000 W 40 * * * * 4816 * * 6507 * 4055 * * * 6318 * * * 5835 232 6420 40 60 7003 4932 1000 1000 * * 8594 1000 0 L 41 * * 6302 4039 2868 * 5738 4074 2873 1948 5889 * * 4579 3960 5245 5075 5439 6752 3261 41 16 * 6537 * * * 0 8567 0 2289 R 42 6776 5144 6748 4130 6318 6297 4766 * 1562 3965 6905 4905 6496 4822 2171 6016 * 3242 * * 42 90 4336 6496 1289 759 386 2091 8545 3317 2853 N 43 6720 * 1614 4010 * 3535 6564 * 4734 6470 * 1484 * 5514 4697 5797 * * 6773 6534 43 40 5653 7002 1731 517 0 * 8619 1640 1740 S 44 5221 * 3596 4456 * 780 6696 6592 6512 * * 4021 6504 5670 4844 3750 6775 5570 * * 44 46 6952 5417 0 * 0 * 8593 1000 1000 K 45 6613 * 5709 2794 6766 3654 5107 5563 2894 5546 * 3674 6484 2933 3716 3740 4289 3331 * 6667 45 53 5180 6856 1722 521 0 * 8590 2312 2110 S 46 5598 * 4372 2205 * 5523 6444 4638 3736 4201 7157 4338 2332 5804 5385 3580 5180 3425 * 6611 46 40 * 5182 * * 0 * 8585 0 1000 V 47 5080 * 6493 6787 * * 6579 2402 6068 1819 4535 6565 5796 5424 4333 4688 5311 2080 * 7095 47 26 7199 6480 2322 322 397 2057 8601 1000 2673 T 48 4790 * 3629 3421 5154 * 5409 4262 5013 4480 * 4435 2541 4489 4089 2537 3178 * * 7380 48 31 * 5563 * * 1019 981 8636 0 1632 D 49 3607 * 3299 2754 * 3617 5239 6594 4579 5322 6807 5076 3207 4808 4916 2871 3143 5846 * * 49 105 4520 5215 1174 845 583 1590 8547 2820 2400 G 50 3901 6714 3142 3096 6852 2440 6876 5899 5703 5706 * 3383 4105 4783 4715 2889 4326 6179 6683 * 50 94 5943 4425 2009 412 1915 444 8535 1682 2662 V 51 3681 6776 3701 4331 6938 4999 5526 4500 5616 4736 4047 5493 5804 4024 4210 3363 3500 2175 * * 51 14 * 6741 * * 1172 846 8447 0 3808 Y 52 4448 6515 5859 3171 4712 4755 4055 6781 3910 4764 * 4803 4395 3281 3495 3076 3307 4968 * 4622 52 50 5816 5959 705 1371 2096 384 8489 1663 2961 E 53 6835 * 5033 4476 4379 5737 5871 6341 4687 4214 5065 4097 4138 2907 4668 3411 2482 3241 7003 5473 53 113 4607 4860 1434 667 1442 662 8503 2742 3378 T 54 4647 * 4186 4124 6756 2773 5613 4799 5524 5088 * 3990 4304 5110 5081 2389 2362 5850 * 6653 54 58 4986 6967 1338 726 972 1029 8542 2645 3833 S 55 4552 * 3758 3562 * 4116 5258 4552 4171 6683 * 5256 2916 2995 4616 3439 3371 3622 * 6361 55 20 * 6212 * * 2031 405 8535 0 2880 F 56 3829 * 6795 4761 3949 6844 5546 3088 4688 2984 * 4003 2755 5265 5270 4163 3798 3951 7102 4507 56 50 7192 5207 0 * 1996 416 8525 1000 2908 F 57 4406 * 4882 3707 5827 4003 4747 4115 4607 2595 4513 5660 4730 5201 3469 3204 5261 3924 * 4588 57 18 * 6355 * * 1050 951 8548 0 3626 V 58 3672 * * 4044 4398 5933 6293 4996 3316 3366 5694 5686 2680 3245 3094 4184 5085 5915 6598 5214 58 40 5835 6685 1507 626 2415 300 8515 1666 2790 N 59 4465 * 3707 3504 * 4294 3368 6567 5368 * 5750 2579 5097 3470 4321 2989 3493 6056 * 5495 59 67 6339 4927 3322 152 1117 892 8524 1000 3021 R 60 3252 * 5129 3048 5587 2124 4423 * 4062 5742 * 3888 3951 6581 4821 3244 4853 5052 * 5508 60 24 7002 6797 0 * 1493 633 8503 1000 3481 D 61 6621 * 1396 3377 * 3439 * * 4755 4799 5006 2436 6873 5418 * 3745 5259 * * * 61 13 6761 * 0 * 1340 725 8538 1000 3070 Y 62 * * 5150 5231 6303 1202 6722 5670 4550 4120 6996 4115 5449 5543 4313 4189 4838 5644 3791 5251 62 16 * 6513 * * 1535 610 8543 0 2217 S 63 4810 * 5162 5741 4752 4259 5775 5418 3683 2973 6735 4917 5324 5417 4869 3433 1815 5247 6072 4706 63 106 5164 4549 2936 202 * 0 8552 2373 2310 F 64 * 4981 * 6474 1696 5163 5626 4658 6664 3847 6773 5980 * 5676 5608 6769 4091 6330 * 1573 64 27 6738 6779 2000 415 446 1911 8514 1000 3923 H 65 4674 * 4562 6637 5607 * 4434 * 5263 6572 * 3752 5146 3242 3458 1728 2807 6604 6056 4803 65 13 * 6857 * * 599 1557 8546 0 2154 K 66 2810 6043 * * * 7059 6713 3732 4421 3138 4291 * * 3970 4992 3551 3501 2074 5875 6039 66 49 6444 5506 0 * * 0 8564 1000 1638 L 67 5584 * * 5355 4771 6552 5065 4461 5470 2142 3853 6791 * 5340 3843 2903 2614 4355 4836 5077 67 24 5938 * 3106 178 1723 521 8523 1635 2497 S 68 4035 6558 5347 6358 6610 * * 5778 4233 5924 * 4931 * * 5332 899 3946 2890 * * 68 13 * 6805 * * 567 1622 8527 0 1904 Y 69 5334 * 4915 5331 4221 6415 4819 2518 5587 3594 5438 6037 * 4319 4312 2633 3265 4419 4251 4835 69 24 * 5942 * * 1000 1000 8532 0 1720 L 70 4660 5751 6446 5740 5923 * 5496 3239 7031 1078 5684 5697 6425 * 4635 6912 4743 3208 * 4595 70 35 6063 6814 1320 738 1556 600 8558 1631 2187 T 71 4490 * 4666 3347 * 6693 5770 * 4573 4790 6408 3218 3767 6689 2948 3444 2237 4645 * 4805 71 9 7323 * 1585 585 0 * 8547 1000 2234 F 72 5689 * * * 3831 * * 2689 * 2315 6712 6615 6580 * 6363 4757 4486 1304 * 5306 72 54 5247 6626 1244 791 * * 8568 2212 0 I 73 5009 6887 4303 4721 5856 5442 5794 4535 3345 5331 6602 6229 2918 4019 4810 2982 2171 5394 6793 6319 73 12 6919 * 1585 585 * 0 8559 1000 1000 P 74 3577 6564 6802 4168 * 5650 5295 5322 3345 3211 6679 6960 1916 5715 3361 4131 5267 4213 5152 * 74 215 2852 * 1673 543 0 * 8559 5093 1000 S 75 3511 * 3840 2179 * 3950 4692 * 4436 * 5772 2923 * 4683 5242 2596 3604 * 6807 * 75 120 3646 * 1044 957 * * 8568 4217 0 D 76 4946 6553 1748 3108 * 5785 3380 7035 4481 5165 * 6531 3648 3241 4334 3858 5479 * 6442 * 76 57 5044 6843 0 * * * 8568 2242 0 D 77 3351 * 3876 4503 * 1491 6784 * 4807 5739 * 3949 * 5823 4556 3266 4696 6909 3401 * 77 53 5297 6545 1585 585 0 * 8556 2201 1000 D 78 3548 * 2545 4087 * 1697 5766 6720 3942 * 3913 4643 6882 6827 5250 4399 3895 6912 * 6629 78 192 3002 * 1609 573 * 0 8548 4949 1000 I 79 5269 * 5590 2560 * * 5834 4035 3255 5350 * 3408 * 3880 3649 4157 2844 2937 * 6928 79 60 4622 * 1294 756 0 * 8548 3183 1000 Y 80 * 6036 * * 2440 5735 * 3790 * 3672 * * * * * * * 3220 * 933 80 12 6924 * 1585 585 * * 8568 1000 0 D 81 5640 * 5520 3923 * 6738 5761 3496 4342 5635 * * * 4066 4200 2196 1778 3834 6358 * 81 17 6433 * 1585 585 * * 8568 1000 0 C 82 * 93 * * * * * 6453 * 5959 * * * * * * 5685 6033 * * 82 0 * * * * * * 8561 0 0 K 83 * 6629 6879 2381 * * 5645 4757 4359 4317 4658 5888 * 3214 2272 4338 4460 2750 5737 * 83 11 6994 * 3000 193 * * 8305 1000 0 V 84 2068 * * * 5776 6417 * 3694 * 5490 * * * * * * 5565 818 * 4512 84 0 * * * * * * 8263 0 0 E 85 5430 * 5555 2519 6369 6947 5959 6097 3193 5368 5633 4514 * 3268 3613 3115 2816 4440 4977 6385 85 101 4131 6594 2466 288 * * 8286 2777 0 H 86 * * 6270 * 6358 5340 476 * * 5710 * 3124 * 4599 6302 5573 * 6500 * 6476 86 19 6246 * 1000 1000 0 * 8186 1000 1000 W 87 5181 * 4572 2137 * * * 5421 4730 6311 4593 5564 2335 3804 4252 3341 4804 3995 5420 5381 87 0 * * * * * * 8129 0 0 G 88 1748 * 6085 6007 * 2094 6388 5933 * 6766 6179 6254 * * * 2025 3160 5979 * * 88 24 5945 * 1000 1000 * * 8019 1000 0 L 89 3755 * * * * 4400 * 5868 6166 886 6069 6138 * 5217 5924 2880 6044 3590 * * 89 38 5276 * 0 * * * 7983 1736 0 E 90 4013 * 3803 3045 * 4194 4460 5969 4073 6144 * 4584 3389 3007 4870 3359 2762 6058 * * 90 18 6339 * 2807 222 * * 7921 1000 0 E 91 3821 * 5514 1943 6339 5886 4154 6058 3501 5747 6189 6002 6119 2677 4985 3287 3444 6162 * * 91 56 * 4710 * * * * 7921 0 0 P 92 5807 * 6081 4833 * * 5423 5578 4855 * * 3954 869 * * 3178 3506 4544 * * 92 0 * * * * * 0 7467 0 1723 V 93 5309 * * 5405 * * * 2149 4870 1370 4776 * 5847 4771 * * 4230 2635 * * 93 0 * * * * 0 * 7421 0 1723 L 94 5824 5662 4727 3607 * * * 2933 4502 3087 4735 * * * 3155 2605 2630 3753 * * 94 0 * * * * * * 7408 0 0 K 95 3698 * * 4373 * 5388 * * 2586 5444 * * * 4374 2222 * 3376 1937 * 4600 95 49 4893 * 2000 415 * * 7368 1000 0 H 96 * * 5033 4061 * * 3155 * 3163 5200 * 2929 * * * 2600 1613 4829 * * 96 144 3395 * 1787 494 * * 6999 1639 0 W 97 * * * * 4535 * * 3492 * 2621 * * * * * * * * 1032 2208 97 0 * * * * * * 6252 0 0 E 98 * * 1698 2112 * * * * 4205 * * * * * 3277 4389 4242 2304 * * 98 0 * * * * * * 5927 0 0 P 99 3919 * * * * * * * * * * * 598 * * 4090 3827 2794 * * 99 0 * * * * * * 5283 0 0 E 100 * * 1192 1580 * * * * 3215 * * * * 3057 * * * * * * 100 0 * * 0 * * * 4189 0 0 //