HHsearch 1.5 NAME d1dx5i1 FAM FILE d1dx5i1 COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1dx5i1.a3m DATE Mon Mar 8 16:08:05 2010 LENG 43 match states, 43 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.2 EVD 0.5145 3.5596 SEQ >ss_dssp CCCCCGGGGCCCSSEEEECSSSCEEEECCTTCCEETTEEEEEC >sa_dssp EEEEEBCEECECEEDCEEEEDECCDBCCCEEEDDCEEDDDDBE >ss_pred CCCCCHHHHCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCC >ss_conf 9754703216881466665987538995246447888731159 >Consensus vepvdpcfranceyqcqpxxqxxyxcicaegfapipxxpxrcq >d1dx5i1 VEPVDPCFRANCEYQCQPLDQTSYLCVCAEGFAPIPHEPHRCQ >UniRef50_UPI00017977B3(120-151:322) PREDICTED: similar to thrombomodulin n=1 Tax=Equus caballus RepID=UPI00017977B3 E=1e-06 s/c=1.69 id=70% cov=77% -----------CEYQCQPVGQNDYRCICAEGFAPIPQDPDRCQ # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * V 1 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 P 3 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 V 4 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 D 5 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 P 6 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 C 7 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 F 8 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 R 9 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 A 10 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 N 11 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 C 12 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1215 0 0 E 13 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1215 0 0 Y 14 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 14 0 * * * * * * 1215 0 0 Q 15 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 15 0 * * * * * * 1215 0 0 C 16 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1215 0 0 Q 17 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 17 0 * * * * * * 1215 0 0 P 18 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1215 0 0 L 19 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 19 0 * * * * * * 1215 0 0 D 20 * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1215 0 0 Q 21 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 21 0 * * * * * * 1215 0 0 T 22 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 22 0 * * * * * * 1215 0 0 S 23 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 23 0 * * * * * * 1215 0 0 Y 24 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 24 0 * * * * * * 1215 0 0 L 25 * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * 25 0 * * * * * * 1215 0 0 C 26 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1215 0 0 V 27 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 27 0 * * * * * * 1215 0 0 C 28 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1215 0 0 A 29 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1215 0 0 E 30 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 30 0 * * * * * * 1215 0 0 G 31 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1215 0 0 F 32 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1215 0 0 A 33 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1215 0 0 P 34 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1215 0 0 I 35 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1215 0 0 P 36 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1215 0 0 H 37 * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * 37 0 * * * * * * 1215 0 0 E 38 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1215 0 0 P 39 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1215 0 0 H 40 * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1215 0 0 R 41 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 41 0 * * * * * * 1215 0 0 C 42 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1215 0 0 Q 43 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 43 0 * * 0 * * * 1215 0 0 //