HHsearch 1.5 NAME d1dmha_ FAM FILE d1dmha_ COM /bmm/www/servers/phyre/brandnew/HH/hhmake -i d1dmha_.a3m DATE Mon Mar 8 20:30:29 2010 LENG 309 match states, 309 columns in multiple alignment FILT 167 out of 230 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 4.8 EVD 0.3728 -3.5605 SEQ >ss_dssp CCCTTSHHHHHHHHHHTTTTCSSSCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTCCHHHHHHHHHHHHHHHHTTCHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHTTCCCSSC CCCCCSCCEECCCEEESEEECCCSCCTTCCEEEEEEEEECTTSCBCTTCEEEEEECCTTSCCTTSCTTSCCSTTTTEEEEECCTTSEEEEEEECCCCEEC CTTSHHHHHHHHTTCCCEECSEEEEEEECTTBCCEEEEEEETTCTTTTCCTTCCCCTTCEECCEEECSHHHHHHTTCSSCEEEEECCEECCBCBTTBCTT CCCCCCEEC >sa_dssp EEEBEDEECCDEADEDBCCEEEEEEEEDCEDDCEDCBDECDDDCEEECDEEEDEEDCDCEEDBDEDEBEDBBCBADCEBCEDBDECCEDAEEEECECDBC BABBBDBBBCECDECEBDBDABCDDBEECCCABACABACCCDDEDCDEADABAAAABCEBCAADDBEEEEBEDBBAACBACACEEADACABABCBCCCDB DEEBAABDCADEEECCACBABBABAAACCEDBACBCAAAABCECEDBEDBBADACCEEACBECDDCEDEECCEECEBECDAACADBDACBCDDCEEECDB DDECECDEE >ss_pred CEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCH HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCC CCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCHH HHHHHHCCC >ss_conf 9000618899999998603677888589999999999999999872799999999999999986549847441022267899987412323356678985 5525887568985134665234468899858999999992899875782899994388874057677766777503799983899779999942531047 7754023567640888886654899998088760488997278831022621256610011232146642013217888605999999966588886135 543332049 >Consensus xxxxxxxxxqxxxxxxxxxxxxxxdpRxxxixxxlvxhlhxfxrexxltxxEwxxxxxfLxxxGxrxExxLlsDvlGxsxlVdxxxxxxxxxxxxxxxTp xxveGPFyxxxaPxxxxxxxxxxxxxxxGxplxlxGxVxDxxGxPixxAxVeIWqadxxGxYxxxxxxxxxxxxxlRGxxxTDxxGxyxFxTIxPgxYpi PxdgpxGxllxxxgrhxxRpaHIHfxVxaxGxxxLtTqlYfxddpxxxxDxvfxvkxxLixxxxxxxxxxxxxxxxxxgxxxxxxfDfvLxxexxxxxxx xxxxxxxxx >d1dmha_ VKIFNTQDVQDFLRVASGLEQEGGNPRVKQIIHRVLSDLYKAIEDLNITSDEYWAGVAYLNQLGANQEAGLLSPGLGFDHYLDMRMDAEDAALGIENATP RTIEGPLYVAGAPESVGYARMDDGSDPNGHTLILHGTIFDADGKPLPNAKVEIWHANTKGFYSHFDPTGEQQAFNMRRSIITDENGQYRVRTILPAGYGC PPEGPTQQLLNQLGRHGNRPAHIHYFVSADGHRKLTTQINVAGDPYTYDDFAYATREGLVVDAVEHTDPEAIKANDVEGPFAEMVFDLKLTRLVDGVDNQ VVDRPRLAV >UniRef50_C6MDW9(11-218:219) Protocatechuate 3,4-dioxygenase n=1 Tax=Nitrosomonas sp. AL212 RepID=C6MDW9_9PROT E=3e-23 s/c=0.54 id=26% cov=58% --------------------------------------------------------------------------------------------------TP EETEGPFYpVKNQKDKDEDLTQINGyvGGASGQHIVVGGHVTDIHGNAVENTLLDIWQADANGRYRHpRDSNKAKLDQNFQGwaVIQTDDKGSFRFKTVM PGAY--PASGT-----------WIRPPHIHLKIFKPGYLPLTTQMYFPDQELNKKDLL------LSRKSIIEQSAMMARKIGQQGNLIIYEYNVVLDLLR --------------- >UniRef50_A0K2D2(10-183:201) Protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit n=6 Tax=Actinomycetales RepID=A0K2D2_ARTS2 E=3e-09 s/c=0.37 id=25% cov=54% --------------------------------------------------------------------------------------------------TP GQTVGPFYGYALPYEK-----DRELLAPGSPgsIRLQGTVYDGAGHPIPDAILEIWQPDSEGNVVHRTGSLVRDGYTFTgfGRSAVGNTGVYTFTTVNP- -------GPTEPI-------PGKPAAAPFIsvaVFARGLmNRLFTRVYLPENkEALAAD-------PLLSSLDPERRSTLIARRDADG---GLTWDIRLQ GE---------------- >UniRef50_Q2MKF2(1-121:122) Protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit (Fragment) n=2 Tax=uncultured bacterium RepID=Q2MKF2_9BACT E=3e-07 s/c=0.48 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