HHsearch 1.5 NAME c8sqxA_ FAM FILE c8sqxA_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8sqxA_.a3m DATE Sat Jun 10 08:48:51 2023 LENG 126 match states, 126 columns in multiple alignment FILT 1 out of 5 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.0 EVD 0.4507 0.9820 SEQ >ss_dssp CCCCEEEEESSCCCCSSSCTTCCCCEEEEEEEESCCCTTCHHHHHHHHHHCCCTTSCCCSCEEEEECTTSEEEEECCCSEEEEEEECCTTSCCCCCEEEE ECCSSSCCCEEECCCCCCCCSSTTTC >sa_dssp EEEBDACABBCEDDEEEDEBEECEEBCACABBADECBCEDEEDADDBCDEBBDEECEDDEEDECEBBDCBBAEBEEADCAAABADADCEEEDDBCCAAAB ACEEEECCECDDDBECEECEECACEE >ss_pred CCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEE EEECCCCCCEEECCEEEECCCCCCCC >ss_conf 9774799981685212357866650268875320887224578888875598632222277311124543015532898328985067788702524786 42046786136401003048999889 >Consensus qeantlvidleppaafaddqpqghnidvtvaklhnidpedheriralqrngvpstiseeqphtartdatgtatitnlppgtyvirdtnttkprfsplvip lgidttsptmtlrpklidatpgapnv >c8sqxA_ QEANTLVIDLEPPAAFADDQPQGHNIDVTVAKLHNIDPEDHERIRALQRNGVPSTISEEQPHTARTDATGTATITNLPPGTYVIRDTNTTKPRFSPLVIP LGIDTTSPTMTLRPKLIDATPGAPNV # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * Q 1 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 E 2 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 A 3 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 N 4 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 T 5 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 L 6 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1000 0 0 V 7 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 7 0 * * * * * * 1000 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1000 0 0 D 9 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 9 0 * * * * * * 1000 0 0 L 10 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1000 0 0 E 11 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1000 0 0 P 12 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1000 0 0 P 13 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1000 0 0 A 14 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1000 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1000 0 0 F 16 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1000 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1000 0 0 D 18 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1000 0 0 D 19 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 20 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 20 0 * * * * * * 1000 0 0 P 21 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 22 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1000 0 0 G 23 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1000 0 0 H 24 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1000 0 0 N 25 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1000 0 0 I 26 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1000 0 0 D 27 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1000 0 0 V 28 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 28 0 * * * * * * 1000 0 0 T 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 29 0 * * * * * * 1000 0 0 V 30 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 30 0 * * * * * * 1000 0 0 A 31 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1000 0 0 K 32 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1000 0 0 L 33 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 33 0 * * * * * * 1000 0 0 H 34 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1000 0 0 N 35 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 35 0 * * * * * * 1000 0 0 I 36 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1000 0 0 D 37 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1000 0 0 P 38 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 38 0 * * * * * * 1000 0 0 E 39 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1000 0 0 D 40 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1000 0 0 H 41 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1000 0 0 E 42 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1000 0 0 R 43 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 43 0 * * * * * * 1000 0 0 I 44 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1000 0 0 R 45 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 45 0 * * * * * * 1000 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1000 0 0 L 47 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 47 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 48 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 48 0 * * * * * * 1000 0 0 R 49 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 49 0 * * * * * * 1000 0 0 N 50 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1000 0 0 G 51 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1000 0 0 V 52 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 52 0 * * * * * * 1000 0 0 P 53 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 53 0 * * * * * * 1000 0 0 S 54 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 54 0 * * * * * * 1000 0 0 T 55 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 55 0 * * * * * * 1000 0 0 I 56 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1000 0 0 S 57 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 57 0 * * * * * * 1000 0 0 E 58 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1000 0 0 E 59 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1000 0 0 Q 60 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 60 0 * * * * * * 1000 0 0 P 61 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1000 0 0 H 62 * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * 62 0 * * * * * * 1000 0 0 T 63 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 63 0 * * * * * * 1000 0 0 A 64 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 64 0 * * * * * * 1000 0 0 R 65 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 65 0 * * * * * * 1000 0 0 T 66 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 66 0 * * * * * * 1000 0 0 D 67 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 67 0 * * * * * * 1000 0 0 A 68 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1000 0 0 T 69 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 69 0 * * * * * * 1000 0 0 G 70 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 70 0 * * * * * * 1000 0 0 T 71 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 71 0 * * * * * * 1000 0 0 A 72 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 72 0 * * * * * * 1000 0 0 T 73 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 73 0 * * * * * * 1000 0 0 I 74 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1000 0 0 T 75 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 75 0 * * * * * * 1000 0 0 N 76 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 76 0 * * * * * * 1000 0 0 L 77 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1000 0 0 P 78 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 78 0 * * * * * * 1000 0 0 P 79 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 79 0 * * * * * * 1000 0 0 G 80 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 80 0 * * * * * * 1000 0 0 T 81 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 81 0 * * * * * * 1000 0 0 Y 82 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 82 0 * * * * * * 1000 0 0 V 83 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 83 0 * * * * * * 1000 0 0 I 84 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 84 0 * * * * * * 1000 0 0 R 85 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 85 0 * * * * * * 1000 0 0 D 86 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 86 0 * * * * * * 1000 0 0 T 87 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 87 0 * * * * * * 1000 0 0 N 88 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 88 0 * * * * * * 1000 0 0 T 89 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 89 0 * * * * * * 1000 0 0 T 90 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 90 0 * * * * * * 1000 0 0 K 91 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1000 0 0 P 92 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 92 0 * * * * * * 1000 0 0 R 93 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 93 0 * * * * * * 1000 0 0 F 94 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 94 0 * * * * * * 1000 0 0 S 95 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 95 0 * * * * * * 1000 0 0 P 96 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 96 0 * * * * * * 1000 0 0 L 97 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1000 0 0 V 98 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 98 0 * * * * * * 1000 0 0 I 99 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1000 0 0 P 100 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 100 0 * * * * * * 1000 0 0 L 101 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 101 0 * * * * * * 1000 0 0 G 102 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1000 0 0 I 103 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 103 0 * * * * * * 1000 0 0 D 104 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1000 0 0 T 105 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 105 0 * * * * * * 1000 0 0 T 106 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 106 0 * * * * * * 1000 0 0 S 107 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 107 0 * * * * * * 1000 0 0 P 108 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1000 0 0 T 109 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 109 0 * * * * * * 1000 0 0 M 110 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 110 0 * * * * * * 1000 0 0 T 111 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 111 0 * * * * * * 1000 0 0 L 112 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 112 0 * * * * * * 1000 0 0 R 113 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 113 0 * * * * * * 1000 0 0 P 114 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1000 0 0 K 115 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1000 0 0 L 116 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 116 0 * * * * * * 1000 0 0 I 117 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1000 0 0 D 118 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1000 0 0 A 119 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 119 0 * * * * * * 1000 0 0 T 120 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 120 0 * * * * * * 1000 0 0 P 121 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1000 0 0 G 122 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 122 0 * * * * * * 1000 0 0 A 123 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1000 0 0 P 124 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 124 0 * * * * * * 1000 0 0 N 125 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1000 0 0 V 126 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 126 0 * * 0 * * * 1000 0 0 //