HHsearch 1.5 NAME c8j5oZ_ FAM FILE c8j5oZ_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8j5oZ_.a3m DATE Sat Sep 23 09:21:50 2023 LENG 47 match states, 47 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.1 EVD 0.4414 1.4569 SEQ >ss_dssp CCSCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSCCCCCCTTTCC >sa_dssp EEEDEEDCDDEDDEDEDEEDEDEEDDDDEEEDEDECEDEEEDEEEDE >ss_pred CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCC >ss_conf 99763112778789899999999876641242112134671502379 >Consensus spwpxwxgyxxcfxplaavilgfiiaarftdkqatsaylrldpakan >c8j5oZ_ SPWPVWSGYALCFVPLAAVILGFIIAARFTDKQATSAYLRLDPAKAN >UniRef50_A5UYB6(12-58:63) Putative uncharacterized protein n=1 Tax=Roseiflexus sp. RS-1 RepID=A5UYB6_ROSS1 E=4e-16 s/c=1.83 id=88% cov=102% SPWPEWTGYLICFGPLAAVILGFIIAARFTDKQATSAYLRLDPAKAN # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * S 1 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 1 0 * * * * * * 1077 0 0 P 2 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 2 0 * * * * * * 1077 0 0 W 3 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 3 0 * * * * * * 1077 0 0 P 4 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1077 0 0 V 5 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 5 0 * * * * * * 1077 0 0 W 6 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * 6 0 * * * * * * 1077 0 0 S 7 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 7 0 * * * * * * 1077 0 0 G 8 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1077 0 0 Y 9 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 9 0 * * * * * * 1077 0 0 A 10 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1077 0 0 L 11 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1077 0 0 C 12 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1077 0 0 F 13 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 13 0 * * * * * * 1077 0 0 V 14 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * 14 0 * * * * * * 1077 0 0 P 15 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1077 0 0 L 16 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 16 0 * * * * * * 1077 0 0 A 17 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 17 0 * * * * * * 1077 0 0 A 18 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1077 0 0 V 19 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 19 0 * * * * * * 1077 0 0 I 20 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1077 0 0 L 21 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 21 0 * * * * * * 1077 0 0 G 22 * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 22 0 * * * * * * 1077 0 0 F 23 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1077 0 0 I 24 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1077 0 0 I 25 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 25 0 * * * * * * 1077 0 0 A 26 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 26 0 * * * * * * 1077 0 0 A 27 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 27 0 * * * * * * 1077 0 0 R 28 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 28 0 * * * * * * 1077 0 0 F 29 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 29 0 * * * * * * 1077 0 0 T 30 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 30 0 * * * * * * 1077 0 0 D 31 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1077 0 0 K 32 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 32 0 * * * * * * 1077 0 0 Q 33 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 33 0 * * * * * * 1077 0 0 A 34 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1077 0 0 T 35 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 35 0 * * * * * * 1077 0 0 S 36 * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * 36 0 * * * * * * 1077 0 0 A 37 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1077 0 0 Y 38 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 38 0 * * * * * * 1077 0 0 L 39 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1077 0 0 R 40 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 40 0 * * * * * * 1077 0 0 L 41 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 41 0 * * * * * * 1077 0 0 D 42 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 42 0 * * * * * * 1077 0 0 P 43 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1077 0 0 A 44 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 44 0 * * * * * * 1077 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1077 0 0 A 46 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 46 0 * * * * * * 1077 0 0 N 47 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 47 0 * * 0 * * * 1077 0 0 //