HHsearch 1.5 NAME c8gzuY_ FAM FILE c8gzuY_ COM /bmm/www/servers/phyre2/HH/hhmake -i c8gzuY_.a3m DATE Sat Jun 17 13:54:27 2023 LENG 129 match states, 129 columns in multiple alignment FILT 2 out of 6 sequences passed filter (-id 90 -cov 0 -qid 0 -qsc -20.00 -diff 100) NEFF 1.6 EVD 0.3815 -2.0028 SEQ >ss_dssp CGGGSCHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHTSCCCTTSCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTCCSH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >sa_dssp EDEDCDEDCCCDCCEDDDDECCDDDDDDDEDDEDDEDDEDCDDBCCCCCDCDDDDDDDCCEDDEDCDCDECCCCCCDCDCCCDCECCDDCDDDDDECDDE CCCDCBCDCCCDCCDDDDDDCDCCCDDDD >ss_pred CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >ss_conf 9788899985160111334555420264156421115306525899999999999999734897767554299999999987415443235665422223 34433599999774101699999997429 >Consensus xxxxxDxIxKlNxxAxxNxxxxDxxxxxxxFxxxYExixIxxDrKxxxxDAxxxxxxxxxPTxxxLxxrxNxxxiQDRVxxrxQxxxxxxNsCixxArNV xxxNxCxDxxxxRiNxxxxxxVxQILrxY >c8gzuY_ NVEEMDTIQKMNYEATVNMGRQDLITREYTFYSDYEFIPIQEDRKQQMEDALNNLHKIIHPTVTQLKKKANVQEIQDRVFRKLQGWEGELNTCVFSAKNV RDSNFCADRFTNRINTEGVEFVKQILREY >UniRef50_A0E0D6(5-128:128) Chromosome undetermined scaffold_71, whole genome shotgun sequence n=3 Tax=Paramecium tetraurelia RepID=A0E0D6_PARTE E=6e-44 s/c=1.44 id=31% cov=97% -----DVIMKLNKDAEYNALTADFQGNDTKFVGEYENVKIPSDKKEFIKDAFRKVATACKPTLKNLSLRQNWLDLQDRVYNRAQYYTTDANSCISDARNV AEVNVCCDNYIQRLNNDFYNDVLQILKDY # NULL 3706 5728 4211 4064 4839 3729 4763 4308 4069 3323 5509 4640 4464 4937 4285 4423 3815 3783 6325 4665 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y M->M M->I M->D I->M I->I D->M D->D Neff Neff_I Neff_D 0 * * 0 * 0 * * * * N 1 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 1 0 * * * * * * 1000 0 0 V 2 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 2 0 * * * * * * 1000 0 0 E 3 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 3 0 * * * * * * 1000 0 0 E 4 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 4 0 * * * * * * 1000 0 0 M 5 * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * 5 0 * * * * * * 1000 0 0 D 6 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 6 0 * * * * * * 1608 0 0 T 7 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * 7 0 * * * * * * 1608 0 0 I 8 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 8 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 9 * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * 9 0 * * * * * * 1608 0 0 K 10 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 10 0 * * * * * * 1608 0 0 M 11 * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * 11 0 * * * * * * 1608 0 0 N 12 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 12 0 * * * * * * 1608 0 0 Y 13 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 13 0 * * * * * * 1608 0 0 E 14 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 14 0 * * * * * * 1608 0 0 A 15 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 15 0 * * * * * * 1608 0 0 T 16 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 16 0 * * * * * * 1608 0 0 V 17 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 17 0 * * * * * * 1608 0 0 N 18 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 18 0 * * * * * * 1608 0 0 M 19 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 19 0 * * * * * * 1608 0 0 G 20 * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * * * * 20 0 * * * * * * 1608 0 0 R 21 * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * 21 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 22 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 22 0 * * * * * * 1608 0 0 D 23 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 23 0 * * * * * * 1608 0 0 L 24 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 24 0 * * * * * * 1608 0 0 I 25 * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * 25 0 * * * * * * 1608 0 0 T 26 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * 26 0 * * * * * * 1608 0 0 R 27 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 27 0 * * * * * * 1608 0 0 E 28 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 28 0 * * * * * * 1608 0 0 Y 29 * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 29 0 * * * * * * 1608 0 0 T 30 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 30 0 * * * * * * 1608 0 0 F 31 * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * 31 0 * * * * * * 1608 0 0 Y 32 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 32 0 * * * * * * 1608 0 0 S 33 * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * 33 0 * * * * * * 1608 0 0 D 34 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 34 0 * * * * * * 1608 0 0 Y 35 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 35 0 * * * * * * 1608 0 0 E 36 * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * 36 0 * * * * * * 1608 0 0 F 37 * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * 37 0 * * * * * * 1608 0 0 I 38 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 38 0 * * * * * * 1608 0 0 P 39 * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * * 39 0 * * * * * * 1608 0 0 I 40 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 40 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 41 * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * 41 0 * * * * * * 1608 0 0 E 42 * * * 1000 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 42 0 * * * * * * 1608 0 0 D 43 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 43 0 * * * * * * 1608 0 0 R 44 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 44 0 * * * * * * 1608 0 0 K 45 * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * 45 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 46 * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 46 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 47 * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 47 0 * * * * * * 1608 0 0 M 48 * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * * 48 0 * * * * * * 1608 0 0 E 49 * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * 49 0 * * * * * * 1608 0 0 D 50 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 50 0 * * * * * * 1608 0 0 A 51 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 51 0 * * * * * * 1608 0 0 L 52 * * * * 1000 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 52 0 * * * * * * 1608 0 0 N 53 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 53 0 * * * * * * 1608 0 0 N 54 * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * * * * 54 0 * * * * * * 1608 0 0 L 55 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 55 0 * * * * * * 1608 0 0 H 56 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 56 0 * * * * * * 1608 0 0 K 57 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 57 0 * * * * * * 1608 0 0 I 58 1000 * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 58 0 * * * * * * 1608 0 0 I 59 * 1000 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 59 0 * * * * * * 1608 0 0 H 60 * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * 60 0 * * * * * * 1608 0 0 P 61 * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * 61 0 * * * * * * 1608 0 0 T 62 * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * 62 0 * * * * * * 1608 0 0 V 63 * * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * 63 0 * * * * * * 1608 0 0 T 64 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * 64 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 65 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 65 0 * * * * * * 1608 0 0 L 66 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 66 0 * * * * * * 1608 0 0 K 67 * * * * * * * * 1000 * * * * * * 1000 * * * * 67 0 * * * * * * 1608 0 0 K 68 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 68 0 * * * * * * 1608 0 0 K 69 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 69 0 * * * * * * 1608 0 0 A 70 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * * 70 0 * * * * * * 1608 0 0 N 71 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 71 0 * * * * * * 1608 0 0 V 72 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * 72 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 73 * * * * * * * * * 1000 * * * 1000 * * * * * * 73 0 * * * * * * 1608 0 0 E 74 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 74 0 * * * * * * 1608 0 0 I 75 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 75 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 76 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 76 0 * * * * * * 1608 0 0 D 77 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 77 0 * * * * * * 1608 0 0 R 78 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 78 0 * * * * * * 1608 0 0 V 79 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 79 0 * * * * * * 1608 0 0 F 80 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 80 0 * * * * * * 1608 0 0 R 81 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 81 0 * * * * * * 1608 0 0 K 82 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 82 0 * * * * * * 1608 0 0 L 83 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 83 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 84 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 84 0 * * * * * * 1608 0 0 G 85 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 85 0 * * * * * * 1608 0 0 W 86 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 86 0 * * * * * * 1608 0 0 E 87 * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * 87 0 * * * * * * 1608 0 0 G 88 * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * 88 0 * * * * * * 1608 0 0 E 89 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 89 0 * * * * * * 1608 0 0 L 90 1000 * * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * * 90 0 * * * * * * 1608 0 0 N 91 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 91 0 * * * * * * 1608 0 0 T 92 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 1000 * * * 92 0 * * * * * * 1608 0 0 C 93 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 93 0 * * * * * * 1608 0 0 V 94 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * * 1000 * * 94 0 * * * * * * 1608 0 0 F 95 * * * * 1000 * * * * * * * * * * 1000 * * * * 95 0 * * * * * * 1608 0 0 S 96 * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 96 0 * * * * * * 1608 0 0 A 97 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 97 0 * * * * * * 1608 0 0 K 98 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 98 0 * * * * * * 1608 0 0 N 99 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 99 0 * * * * * * 1608 0 0 V 100 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 100 0 * * * * * * 1608 0 0 R 101 1000 * * * * * * * * * * * * * 1000 * * * * * 101 0 * * * * * * 1608 0 0 D 102 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 102 0 * * * * * * 1608 0 0 S 103 * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * 103 0 * * * * * * 1608 0 0 N 104 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 104 0 * * * * * * 1608 0 0 F 105 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * 1000 * * 105 0 * * * * * * 1608 0 0 C 106 * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 106 0 * * * * * * 1608 0 0 A 107 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * * * 107 0 * * * * * * 1608 0 0 D 108 * * 0 * * * * * * * * * * * * * * * * * 108 0 * * * * * * 1608 0 0 R 109 * * * * * * * * * * * 1000 * * 1000 * * * * * 109 0 * * * * * * 1608 0 0 F 110 * * * * 1000 * * * * * * * * * * * * * * 1000 110 0 * * * * * * 1608 0 0 T 111 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 1000 * * * 111 0 * * * * * * 1608 0 0 N 112 * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * 112 0 * * * * * * 1608 0 0 R 113 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * 113 0 * * * * * * 1608 0 0 I 114 * * * * * * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * 114 0 * * * * * * 1608 0 0 N 115 * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * 115 0 * * * * * * 1608 0 0 T 116 * * * * * * * * * * * 1000 * * * * 1000 * * * 116 0 * * * * * * 1608 0 0 E 117 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 117 0 * * * * * * 1608 0 0 G 118 * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * 118 0 * * * * * * 1608 0 0 V 119 * * * * * * * * * * * * * * * * * 1000 * 1000 119 0 * * * * * * 1608 0 0 E 120 * * * 1000 * * * * * * * 1000 * * * * * * * * 120 0 * * * * * * 1608 0 0 F 121 * * 1000 * 1000 * * * * * * * * * * * * * * * 121 0 * * * * * * 1608 0 0 V 122 * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 * * 122 0 * * * * * * 1608 0 0 K 123 * * * * * * * * 1000 1000 * * * * * * * * * * 123 0 * * * * * * 1608 0 0 Q 124 * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * 124 0 * * * * * * 1608 0 0 I 125 * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * 125 0 * * * * * * 1608 0 0 L 126 * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * 126 0 * * * * * * 1608 0 0 R 127 * * * * * * * * 1000 * * * * * 1000 * * * * * 127 0 * * * * * * 1608 0 0 E 128 * * 1000 1000 * * * * * * * * * * * * * * * * 128 0 * * * * * * 1608 0 0 Y 129 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 0 129 0 * * 0 * * * 1608 0 0 //